在做分子对接前，需要对蛋白质和分子进行预处理。对蛋白质进行：去水，去配体，加氢，处理；小分子需要加氢，做能量优化。 关于数据库：DUDE数据库上有蛋白质受体和配套的阳性、阴性配体。从DUDE数据库上下载的蛋白质和PDB数据库上下载的有所差异，但是对接使用的是蛋白质口袋，外圈的其实影响不大，DU
转载
2023-10-17 22:53:34
73阅读
概念Hook函数机制：不改变主体，实现额外功能，像一个挂件一样将功能挂到函数主体上。hook的出现与pytorch动态图运算机制有关，pytorch在每一次运算结束后，会将中间变量释放，以节省内存空间，这些会被释放的变量包括非叶子张量的梯度，中间层的特征图等。但有时候，我们想可视化中间层的特征图，又不能改动模型主体代码。但是，我们往往想要提取这些中间变量（如“提取”特征图，“提取”非叶子张量的梯度
转载
2024-01-30 05:52:40
45阅读
# 如何在Python中安装PyTorch
## 1. 整体流程
在安装PyTorch之前，首先需要安装Python，然后使用pip工具安装PyTorch。下面是整个安装流程的步骤概览：
```mermaid
gantt
title 安装PyTorch流程
section 安装Python
安装Python :a1, 2022-01-01, 2d
sectio
原创
2024-07-12 06:30:32
22阅读
# 如何在Linux中安装PyTorch
作为一名经验丰富的开发者，我将教会你如何在Linux中安装PyTorch。下面是整个过程的步骤：
| 步骤 | 操作 |
|------|------|
| 1. | 安装Python和pip |
| 2. | 使用pip安装PyTorch的依赖库 |
| 3. | 下载并安装PyTorch |
下面是每个步骤需要执行的操作，以及相应的代
原创
2023-07-20 12:35:21
328阅读
**标题：详解Python PyTorch安装方法**
## 1. 概述
PyTorch是一个针对深度学习任务的开源机器学习库，它基于Torch库，是Facebook的开源项目之一。本文将介绍如何在Python环境中安装PyTorch，以便您可以开始在您的项目中使用PyTorch进行深度学习。
## 2. 安装流程
下面是安装PyTorch的步骤概览：
| 步骤 | 内容
原创
2024-04-29 11:04:44
59阅读
wsl2 windows10/11 安装 配置cuda及pytorch参考文献安装wsl2 ubuntu20.04安装wsl cuda驱动安装CUDA Tollkit配置cudnn连接pytorch GPUANACONDA安装后话 参考文献Windows 11/10 WSL2 Ubuntu 20.04 下配置Cuda及Pytorch官方安装wsl2官方wsl2连接gpu 这篇文章基本上就是上面一
转载
2024-06-19 04:16:25
115阅读
# 在CentOS系统中安装PyTorch的指南
## 前言
PyTorch是一种流行的深度学习框架，由Facebook人工智能研究团队开发。以其强大的灵活性和简便性，PyTorch成为了学术界和工业界广泛使用的工具。本文将为您介绍如何在CentOS系统中安装PyTorch，整个过程包括系统依赖性安装、CUDA配置以及PyTorch的实际安装。
## 环境准备
在安装PyTorch之前，确
# 在 PyCharm 中安装 PyTorch 的全过程
PyTorch 是一个流行的深度学习框架，提供了灵活的张量计算和强大的计算图功能。为了便于开发，许多数据科学家和机器学习工程师使用 PyCharm 作为他们的 IDE。本文将详细介绍如何在 PyCharm 中安装 PyTorch，并通过示例代码展示其基本用法。
## 一、安装前准备
在安装 PyTorch 之前，我们需要确保我们的计算
# Python 安装 PyTorch GPU
PyTorch 是一个基于 Python 的科学计算库，提供了丰富的工具和函数，用于构建和训练深度神经网络。为了充分利用计算资源，我们可以将 PyTorch 配置为使用 GPU 进行计算。本文将介绍如何在 Python 环境中安装和配置 PyTorch GPU，并提供相关代码示例。
## 安装 PyTorch
在开始之前，确保已经安装了适当版本
原创
2023-10-24 18:54:02
76阅读
# Python PyTorch Linux 安装指南
PyTorch是一个深度学习框架，它提供了丰富的工具和库，以便进行机器学习和深度学习任务。本文将介绍如何在Linux系统上安装Python PyTorch，并提供相应的代码示例。
## 步骤1: 安装Python
要安装PyTorch，首先需要确保系统中安装了Python。在终端中输入以下命令以检查Python版本：
```bash
原创
2023-07-27 08:40:24
73阅读
前言transformer火了这么久，在视觉，文本，多模态等领域各种刷榜，某天有空看到这篇推送 熬了一晚上，我从零实现了Transformer模型，把代码讲给你听 后来发现有点小问题, 以及代码风格可能自己不是特别喜欢，然后就动手改一改。 Anyway, 很感谢原作者本着开源和分享的精神，看他的代码确实很有收获。关于transformer理论部分，这里有篇讲解: 【Transformer】10分钟
在上篇文章我介绍了深度学习的一些python基础和IDE的选择，这次我们从李沐老师的译作《动手学深度学习》中完整的走一遍安装MXNet的安装。在介绍安装MXNet安装之前，我们先了解一下，什么是MXNet？在如今开源深度学习框架中包括TensorFlow，Keras，MXNet，PyTorch，CNTK，Theano，Caffe，DeepLearning4，Lasagne，Neon等等。但是当下最
转载
2024-08-20 13:15:14
332阅读
一、Aanconda的安装可以参考笔者的这篇博客：Anaconda安装详细教程二、准备工作1、查看本机的python的版本(本机python解释器版本为3.8.5) 2、单击启动Anaconda Prompt创建新虚拟环境 3、在Anaconda Prompt依次执行以下命令，创建名字为pytorch的虚拟环境# -n后表示的是创建虚拟环境名，python=版本号，即为cmd查看的本机的pytho
转载
2023-10-18 08:51:57
84阅读
PyTorch 环境配置及安装1. 安装 anaconda2. 为 PyTorch 创建单独的环境，便于管理。打开 Anaconda Prompt为 PyTorch 创建单独的环境python 版本与 anaconda 中 python 版本相同即可。conda create -n pytorch python=3.8输入 y 开始安装需要的包并创建环境（如果出现了 ERROR 并且你此时正在使用
转载
2023-07-04 22:22:44
370阅读
# 如何使用Python安装PyTorch
## 一、流程图
```mermaid
stateDiagram
[*] --> 安装Python
安装Python --> 安装pip
安装pip --> 安装PyTorch
安装PyTorch --> [*]
```
## 二、步骤及代码
### 步骤一：安装Python
首先，我们需要安装Python。可以去
原创
2024-04-13 06:03:16
155阅读
PyTorch 是由 Facebook 开发的现代开源机器学习库。与 TensorFlow 和 Keras 等其他流行库一样，PyTorch 允许您使用视频卡的处理能力，自动计算计算图，对其进行区分和读取。但是，与以前的库不同，它具有更灵活的功能，因为它使用了动态计算图。本文只是一个初步讲解，详细资料可参见博文深度学习之pytorch电子书百度云下载现在我们将完成使用 PyTorch 库的所有阶段
转载
2023-07-24 21:49:21
86阅读
Pytorch环境的安装首先先安装Anaconda3软件，打开Anaconda Promat创建一个新的Pytorch环境：conda create -n pytorch python=3.6 （-n 后面添加环境的名称，并选择python的版本）进入新建的环境：conda activate pytorch
安装Pytorch：百度搜索pytorch第一个链接进入 选择需要安装的版本，若需要安装
转载
2023-11-21 20:16:03
180阅读
1. 创建虚拟环境pytorch1 创建一个叫做pytorch1的环境 指令如下： conda create -n pytorch1 python=3.6 之后，弹出提示，输入 y，即可安装安装成功后，输入以下指令： conda info --envs 即可看到 conda 环境中，有新建的 pytorch1 环境 2. 进入pytorch1 环境中，安装 pytorch 使
转载
2023-08-08 12:01:37
72阅读
Python安装教程（pytorch环境配置）敬告：想要使用python，无论是做项目，还是搞科研，安装python前，最好先装anaconda，然后配置一个或多个项目的环境，并在环境中安装所需版本的python。 内容大部分是自己编辑整合，有部分内容来源于网络，这个文档本来是给自己和学弟学妹们用的，就也没有注明部分内容来源。近期有同学问，就顺便把这篇发出来，如侵删。一、安装anaconda31、
转载
2023-09-12 19:38:51
126阅读
python安装教程和Pycharm安装详细教程，分享给大家。首先我们来安装python1、首先进入网站下载：点击打开链接（或自己输入网址https://www.python.org/downloads/），进入之后如下图，选择图中红色圈中区域进行下载。2、下载完成后如下图所示3、双击exe文件进行安装，如下图，并按照圈中区域进行设置，切记要勾选打钩的框，然后再点击Customize instal
转载
2023-10-17 21:28:49
138阅读
