三维荧光学习记录–在Origin中绘制三维荧光光谱图（补充）及荧光区域积分（FRI）注：本文仅作为自己的学习记录以备以后复习查阅关于区域积分的简介，大家可以去看我之前的文章，这里就不赘述了，主要想补充一下之前写过的三维荧光学习记录–在Origin中绘制三维荧光光谱图 大家都知道matlab和origin这两个软件都是可以绘图的，包括我们这个三维荧光的光谱图以及区域积分，主要还是看大家觉得哪个软件画
三维旋转矩阵描述的是在三维空间中物体的旋转关系，我们难以直观地从旋转矩阵上看出旋转的具体情况。但是，它可以由欧拉角变换而来，也就是可以视为绕着xyz三个轴分别进行旋转后结果的叠加，是一系列三角函数相乘的结果。比如，通常我们所使用的rpy角： 关于不同旋转表达方式之间的转换这里不做赘述，感兴趣的可以参考：四种三维空间旋转表示方法“轴角、旋转矩阵、欧拉角、四元数”之间的相互转换总结。下面直接进
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2023-09-17 14:55:20
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一、前言火山图是做差异分析中最常用到的图形，在前面的推文中，我们也推出了好几期火山图的绘制教程，以及很多火山图的教程也可以参考。R语言绘制精美图形 | 火山图 | 学习笔记、各类差异基因火山图汇总 | 学习笔记等等。大家根据自己的需求绘制相关的火山图即可。今天，我们学习使用volcano3D绘制3D火山图，我们会给出详细的绘图过程。注意： 小杜的生信笔记分享的教程是结合自己的需求进行分享，难免会有
多数据柱形图用于比较一个类别或多个类别，在不同数值状态下的表现。需要根据数据类型的不同做一些数据处理工作包括数据合并数据排序。知识点：sort()、melt()数据展示本次所使用的数据如下:mydata<-read.csv("MultiColumn_Data.csv",check.names=FALSE)数据处理现在我们按照数据的年份，将数据变为新的三列，分别为类别列：Catergory、年
本系列主要介绍R语言中当下最好的3D地理可视化，且完全可以商用或科研用。涉及到的包有echarts4r，mapdeck，rayshader。首先展示一下三种包做出的可视化效果，（1）echarts4r 图1 中国航线图 完整视频见本人B站链接， 中国航线可视化www.bilibili.com （2）mapdeck 图2 航线图 引用自mapd
矩阵（matrix）是一种特殊的向量，包含两个附加的属性：行数和列数。所以矩阵也是和向量一样，有模式（数据类型）的概念。（但反过来，向量却不能看作是只有一列或一行的矩阵。数组（array）是R里更一般的对象，矩阵是数组的一个特殊情形。数组可以是多维的。例如：一个三维数组可以包含行、列和层（layer），而一个矩阵只有行和列两个维度 1、创建矩阵矩阵的行和列的下标都是从1开始，如：矩阵a左
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2023-06-19 20:52:28
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R语言入门系列课程（3）不积跬步无以至千里，不积小流无以成江河，每天进步一点点，就会遇见更优秀的自己 。
标量相当于点，向量相当于线，由标量构成了向量，由向量构成了矩阵，矩阵相当于二维平面，而数组则是三维空间里的立方体，或多维空间图形。数据框各列相对矩阵数组更为灵活，可以使hi不同模式的数据，而列表则是较为复杂的数据结构，它的元素可以是向量、数组、数据框、列表，甚至函数。今天的内容空分四个
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2023-09-14 14:36:07
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折线图中涉及到gcookbook的包。需要下载安装，在Rstudio中用install(“gcookbook”)即可安装，安装后运行程序即可显示相应的折线图。 引言 折线图一般用于描述一维变量随着某一连续变量变化的情况，连续变量通常为时间。换句话说，折线图最适合描述时间序列数据的变化情况。当然随着离散变量变化也是可以的，不过这个离散变量必须是有序的。画一条折线图一条基本的折线图还是比较简单的，只要
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2023-06-21 20:48:45
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## 如何使用R语言绘制三维散点图
在数据分析与可视化中，三维散点图是一种非常有效的工具，用于展示多变量之间的关系。接下来，我们将详细介绍如何使用R语言实现三维散点图。以下是整个流程的概述：
### 流程概述
```mermaid
flowchart TD
A[开始] --> B[安装必要的R包]
B --> C[加载数据]
C --> D[绘制三维散点图]
作者：丁点helper 上篇文章中，我们用世界银行的例子给大家介绍了散点图怎么画，那折线图呢？绘制折线图如果将散点图上的点从左往右连接起来，就会得到一个折线图。今天我们以R中自带的Orange 数据集为例，来学习折线图的画法，该数据集中包含五种橘树的树龄和年轮数据。要考察橘树的年轮如何随着树龄变化，先画个散点图看看： # 先看第一种橘树，提取第一种树的数据，保存在t1中
t1 &l
⛄ 内容介绍随着分析测量技术的发展,三维(Three-dimensional,3D)图谱的获取变得越来越容易.与传统的二维图谱相比,三维图谱由于增加了一个测定的维度,因而包含了更加丰富的待测物质的信息.因此,从理论上来说,基于三维指纹图谱对复杂体系的多个目标组分进行分析时能够获得更加准确,可靠的结果.三维荧光图谱(fluorescence3D spectrum,或excitation emissi
作者：李誉辉 前言继R_ggplot2基础连载结束，今天开启R_3D图系列的连载。准备工作：安装ggforce包devtools::install_github('thomasp85/ggforce')
install.packages("plot3D")1.基础图形1.1persp()persp()函数在平面上绘制一个三维透视图，需要指定观察方向等信息。 pers
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2023-06-25 15:05:35
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大部分情况下，我们使用二维的图像就足以展示我们的数据，但是也无法排出在一些特定的情况下，需要将数据在三维空间进行展示。今天给大家介绍两个用来绘制三维散点图的R包。rgl包首先介绍的是rgl包的plot3d()函数。还是先来看一下这个函数的参数。plot3d(x, y, z,
xlab, ylab, zlab, type = "p", col,
size, lwd, radius,
# 如何在R语言中创建矩阵三维
## 1. 确定矩阵三维的维度和数值
在R语言中，可以使用`array()`函数来创建多维数组，其中包括矩阵三维。首先，确定矩阵三维的维度和数值。假设我们要创建一个3x3x3的矩阵三维，数值为1到27。
## 2. 使用array()函数创建矩阵三维
```markdown
```R
# 创建3x3x3的矩阵三维
matrix_3d 2.使用array()
## R语言创建三维数据
在数据分析和可视化中，有时候我们需要处理三维数据，即数据具有三个维度。在R语言中，我们可以使用一些库和函数来创建和处理三维数据。本文将介绍如何在R语言中创建三维数据，并演示一些基本操作和可视化方法。
### 创建三维数据
在R语言中，我们可以使用`array`函数来创建三维数据。下面是一个简单的示例，创建一个3x3x3的三维数组：
```markdown
```R
某日，老大发问，有这样的一张图，有什么思路解决它吗。
(来源文献“A genome-based model for adjusting radiotherapy dose (GARD): a retrospective, cohort-based study”)
好了，第一眼看去，提琴图嘛，对不对？其它的都还好说，貌似唯一难点就是怎样根据“提琴宽度”分配渐变色了。
# 使用R语言绘制三维曲面图
在数据可视化领域，三维曲面图是一种常见的图形形式，可以用来展示数据在三个维度上的分布情况。R语言作为一种强大的统计计算工具，也提供了丰富的绘图功能，可以很容易地绘制出漂亮的三维曲面图。
## 代码示例
下面是一个简单的R语言代码示例，用来生成一个三维曲面图：
```R
library(plotly)
# 生成数据
x
文章目录前言一、Matlab插值1.Meshgrid函数2.Griddata函数二、绘制1.使用函数（1）linspace函数（2）peaks函数（3）polt3函数（4）mesh函数（5）surf函数（6）contour函数2.步骤（1）常见数学函数绘图（2）离散数据绘图前言最近需要用到Matlab来绘制三维的地形图等，即通过已知的山地海拔数据，利用Matlab软件使用插值法绘制三维曲面图、等
三维散点图：R语言版 上一期用Python做了一个三维散点图，这一次我们用R语言来做。 首先还是先看效果： 如果有上一次用Python的matplotlib的同学实现了的，会被Python那恐怖至极的速度给吓坏了——可不是么，Python的特性之一，就是慢……不但慢，还巨消耗资源。 那么这一次你运行一下R语言的
原创
2022-07-25 09:42:49
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上期我们说了气泡图。如果我们将气泡图的三维数据绘制到三维坐标系[1]中，通常称其为三维散点图，即用在三维X-Y-Z图上针对一个或多个数据序列绘出三个度量的一种图表。有关散点图前几部分系列可见：趋势显示的二维散点图分布显示的二维散点图气泡图R 中scatterplot3d包的scatterplot3d()函数、rgl包的plot3d()[2]函数、plot3D包的scatter3D()函数等都可以绘
