NCBI（National Center for Biotechnology Information，美国国家生物技术信息中心）除了维护GenBank核酸序列数据库外，还提供数据分析和检索资源。NCBI资源包括Entrez、Entrez编程组件、MyNCBI、PubMed、PudMed Central、PubReader、Gene、the NCBI Taxonomy Browser、B
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2024-04-16 22:25:33
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简介SRA数据库是美国国立卫生研究院（NIH）的高通量测序数据的主要归档，是国际核苷酸序列数据库协作（INSDC）的一部分，其中包括NCBI序列读取存档（SRA），欧洲生物信息学研究所（EBI）和DNA数据库 日本（DDBJ）。 提交给三个组织中的任何一个的数据都是共享的。SRA数据库数据来自高通量测序平台（Roche 454 GSSystem®，Illumina GenomeAnal
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2023-07-29 20:33:32
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速来围观！——三种NCBI常见数据库在微生物测序分析中，常常需要对未知的核酸或蛋白序列进行物种,功能或类别注释。注释方法种类较多，其中最常用的是与一些标准数据库进行相似性搜索，也就是序列比对。因此，数据库的优劣对注释结果至关重要。本期小编为大家带来的是NCBI上的三个重要的数据库—NR/NT，Taxonomy和RefSeq。NR/NT 数据库NR(Non-Redundant Prote
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2023-09-26 11:00:30
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Mysql元数据分析 一、information_schema库 information_schema库中的表，保存的是Mysql的元数据。官网元数据表介绍InnoDB相关的表介绍库中有表： 1. CHARACTER_SETS 保存所有Mysql可用的字符集。相当于命令：SHOW CHARACTER
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2018-12-27 21:55:00
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# Hive元数据分析详解
Apache Hive 是一个用于大规模数据仓库的工具，能够在Hadoop之上提供数据处理的便利性。Hive 通过SQL类似的查询语言（HiveQL）来抽象和简化复杂的数据操作。在Hive的后台，元数据管理是至关重要的一部分。本文将深入探讨 Hive 元数据的分析，并提供一些代码示例。
## 什么是Hive的元数据？
Hive元数据是指关于 Hive 表的结构和数
原创
2024-09-21 06:44:52
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转录组分析综述
转录组
文献解读
Trinity cufflinks
转录组研究综述文章解读
今天介绍下小编最近阅读的关于RNA-seq分析的文章，文章发在Genome Biology 上的A survey of best practices for RNA-seq data analysis 。由于文章较长和枯燥，小编认为重要的信
文章目录Hive简介1.Hive安装1.解压安装配置环境变量2.配置文件3.使用初始化元数据启动元数据服务启动2.hive的简单使用3.hive数据加载方式1.直接拷贝到hdfs中的表的对应目录2.使用命令导入数据3.装载方式4.insert into方式装载4.Hive表属性修改 Hive简介Hive是基于Hadoop的一个数据仓库工具，用来进行数据提取、转化、加载，这是一种可以存储、查询和分
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2023-10-23 22:05:49
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12.4 基于Java类定义Bean配置元数据12.4.1 概述基于Java类定义Bean配置元数据，其实就是通过Java类定义Spring配置元数据，且直接消除XML配置文件。 基于Java类定义Bean配置元数据中的@Configuration注解的类等价于XML配置文件，@Bean注解的方法等价于XML配置文件中的Bean定义。 基于Java类定义
元数据即是数据的数据，是用来描述数据的，即和数据识别，产生，使用这一流向过程相关的直接的间接的所有相关的数据都可以称之为元数据，而不单单是数据表相关信息。比如：以大数据数仓常见的架构为例：源数据通常通过ETL工具如kettle或canal或其他工具将数据抽到大数据平台中，存储在hdfs上，再经过数据分析(经典数仓按照ods->dwd->dws->ads)形成最终要使用的数据，最后
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2023-09-13 19:57:37
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3.2 线性表定义零个或多个数据元素的有限序列。首先它是一个序列。也就是说，元素之间是有顺序的，若元素存在多个，则第一个元素无前驱，最后一个元素无后继，其它元素都有且只有一个前驱一个后继。然后，线性表强调是有限的，即元素个数是有限的。3.2 线性表的抽象数据类型对于一个线性表来说，插入或者删除数据都是必须的操作，因此线性表的抽象数据类型定义如下：ADT线性表(List)
Data
线性表的数据对象
在进入下面的主题之前想来搞清楚edits和fsimage文件的概念：1，fsimage文件其实是hadoop文件系统元数据的一个永久性的检查点，其中包含hadoop文件系统中的所有目录和文件idnode的序列化信息。2，edits文件存放的是hadoop文件系统的所有更新操作的路径，文件系统客户端执行的所有写操作首先会被记录到edits文件中。 元数据的介绍：元数据的分类
按形式分类：内
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2023-07-13 11:43:11
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【原始表格】【呈现结果】【代码实现及注释】import xlrddata = xlrd.open_workbook(r'H:\MyExcel.xlsx') #打开exceltable=data.sheet_by_index(0) #读取第一张表print('表名'+table.name,'总共'+str(table.nrows)+'行',str(table.ncols)+'列') #打印表名，
原创
2022-11-12 18:41:15
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本篇文章把上传数据（扩增子测序）的步骤尽可能详细的整理出来，希望能对各位科研工作者有所帮助。其它类型数据上传讲解将依次在后续推文中奉上，大家持续关注哦！1.注册及登录账号1）注册一个NCBI（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/）网页：按照提示填写账号、密码、邮箱等信息。2）登录账号，点击左上角的NCBI大图标回到NCBI的主页，然后点击图中Submit按钮进入提交数据页面。
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2024-03-27 15:09:15
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# Python分析NCBI基因序列
在生物信息学领域，基因序列分析是一个重要的研究方向。NCBI（国家生物技术信息中心）提供了丰富的基因序列数据，成为研究者们获取和分析基因数据的重要资源。本文将介绍如何使用Python对NCBI的基因序列进行分析，并提供相关代码示例，帮助你更深入地理解这一过程。
## 基础知识
在开始之前，我们需要了解一些基础知识。基因序列通常由一系列的核苷酸（A、T、C
原创
2024-08-27 07:38:51
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不用任何公开参考资料，估算今年新生儿出生数量 解答：1）采用两层模型（人群画像人群转化）：新生儿出生数=Σ各年龄层育龄女性数量各年龄层生育比率 2）从数字到数字：如果有前几年新生儿出生数量数据，建立时间序列模型（需要考虑到二胎放开的突变事件）进行预测 3）找先兆指标，如婴儿类用品的新增活跃用户数量X表示新生儿家庭用户。Xn/新生儿n为该年新生儿家庭用户的转化率，如X2007/新生儿2007位为20
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2023-08-21 09:13:32
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1.数据分析方法分类业务数据分析师（对数学建模的要求较低）、数据挖掘（对业务与数学建模的要求较高）、大数据分析（需要一定的编程能力）。层层进阶2.职位进阶3.数据分析结果数据可视化4.数据分析的流程在业务理解中要多问问题，了解需求，知道问题的核心。可以看书籍《学会提问》。5. 围绕数据分析师的三大类工作内容
原创
2022-04-15 21:35:17
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当我们谈论IT服务管理（ITSM）世界中的大数据时，这里有两个非常不同的概念： • IT为业务提供的大数据工具/服务：对关键的业务运营数据进行数据索引。 • IT运营中的大数据：处理和利用复杂的IT运营数据。大数据中的业务运营服务在竞争日益激烈，数据驱动的世界中，企业管理者都在寻找能够有效管理和解释业务数据（尤其是大数据）的方法。数字化的业务操作，如：电子商务网站和银行移动APP，它们产生了大量的
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2023-10-03 08:52:17
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进入到机器学习中，最为简单的就是回归分析，其实回归分析在中学就差不多有涉及了。 所谓的回归分析就是利用已知数据来产生拟合方程，从而（对未知数据）进行预测，从这方面来说这算是一个监督学习。 回归分析的用途一般是用来分析新数据的合理性，或者预测未知数据。 回归分析又分为线性回归和非线性回归。 而线性回归又分为：一元线性回归；多元线性回归；广义线性回归。 先从一元线性回归开始说起： 其模型非
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2023-09-13 22:09:03
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大数据技术和数据分析有什么关系大数据经过多年发展形成了一个完整的产业链和技术链，大数据的产业链是围绕技术链来打造的，而大数据的技术链则围绕数据价值化这个中心来展开，涉及到数据的采集、存储、安全、分析、呈现和应用，那么大数据技术和数据分析有什么关系呢?1、从大数据的技术链来看：数据分析是其中的重要一环，也是目前大数据价值化的核心环节，所以很多人也把大数据就理解为数据分析了。虽然数据分析比较重要，但是
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2024-01-13 20:01:43
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在JDBC中提供了DatabaseMetaData和ResultSetMetaData接口来分析数据库的元数据。 DatabaseMetaData 使用DatabaseMetaData取得数据库的元信息 ResultSetMetaData
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2016-03-22 15:49:00
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