dplyr 包中也有特定的连接函数,用来实现不同数据框之间的连接操作,类似于 SQL 中的 join。

这一节我们使用 nycflights13 数据集,这个数据集中包含了纽约市 336776 次航班的信息,使用前先安装一下:install.packages(‘nycflights13’)。

library(dplyr)
library(nycflights13)

# flights 数据框
slice_head(flights, n = 5)

# airlines 数据框
slice_head(airlines, n = 5)

flights 数据框:

基于R语言的群体药代学研究 r语言编程—基于tidyverse_基于R语言的群体药代学研究


airlines 数据框:

基于R语言的群体药代学研究 r语言编程—基于tidyverse_数据分析_02

flights 数据框中有很多字段,我们只筛选出一些必要的字段,如航班编号 flight、航空公司缩写 carrier、飞机编号 tailnum、出发地 origin、目的地 dest。

为了方便演示连接查询的结果,对 flights 和 airlines 做了相应的处理,新数据框 flights_sub、airlines_sub 中仅有 6 行数据,两个数据框可以通过 carrier 字段来关联。

flights_sub <- flights %>%
    select(flight, carrier, tailnum, origin, dest) %>%
    slice_head(n = 6)
flights_sub

airlines_sub <- airlines %>%
    slice_head(n = 6)
airlines_sub

flights_sub 数据框:

基于R语言的群体药代学研究 r语言编程—基于tidyverse_数据分析_03


airlines_sub 数据框:

基于R语言的群体药代学研究 r语言编程—基于tidyverse_基于R语言的群体药代学研究_04

1. inner_join:内连接

内连接仅查询出两个数据框完全匹配的行。

  • flights_sub 数据框,去重后的 carrier 字段有 UA、AA、B6、DL 4个取值
  • airlines_sub 数据框,去重后的 carrier 字段有 AA、B6、DL、9E、AS、EV 6个取值

两者内连接后,能匹配上的 carrier 字段有 AA、B6、DL,可以使用 by 参数来指定连接的字段,如果不指定,则默认会取两个数据框中名称相同的字段进行连接。

# 不指定连接的字段
flights_sub %>% 
    inner_join(airlines_sub)

# 指定连接的字段, 且两个数据框的字段名相同
flights_sub %>% 
    inner_join(airlines_sub, by = 'carrier')

# 指定连接的字段, 且两个数据框的字段名不同
# 先把 carrier 字段重命名为 carrier_id
flights_sub_v2 <- flights_sub %>%
    rename(carrier_id = carrier)
# 通过 flights_sub_v2 的 carrier_id 字段连接 airlines_sub 的 carrier 字段
flights_sub_v2 %>% 
    inner_join(airlines_sub, by = c('carrier_id'= 'carrier'))

inner_join 结果:

基于R语言的群体药代学研究 r语言编程—基于tidyverse_字段_05

2. 外连接
2.1 left_join:左外连接

以左边的 flights_sub 数据框为基准,去重后的 carrier 字段有 UA、AA、B6、DL 4个取值,而 airlines_sub 数据框中仅能匹配到 AA、B6、DL 3个值,匹配不到的 UA ,其对应的 name 字段取值为 NA。

flights_sub %>% 
    left_join(airlines_sub, by = 'carrier')

left_join 结果:

基于R语言的群体药代学研究 r语言编程—基于tidyverse_字段_06

2.2 right_join:右外连接

以右边的 airlines_sub 数据框为基准,去重后的 carrier 字段有 AA、B6、DL、9E、AS、EV 6个取值,而 flights_sub 数据框中仅能匹配到 AA、B6、DL 3个值,匹配不到的 9E、AS、EV,其对应的 flight、tailnum、origin、dest 字段取值均为 NA。

flights_sub %>% 
    right_join(airlines_sub, by = 'carrier')

right_join 结果:

基于R语言的群体药代学研究 r语言编程—基于tidyverse_数据分析_07

2.3 full_join:全外连接

无论是否匹配到,所有的行都会保留,可以认为是左外连接和右外连接合并后去重的结果。

flights_sub %>%
    full_join(airlines_sub, by = 'carrier')

full_join 结果:

基于R语言的群体药代学研究 r语言编程—基于tidyverse_r语言_08

3. 筛选连接

进行完 join 操作后,有时候需要对 join 的结果做进一步的过滤,这种情况下,可以使用 semi_join 和 anti_join 来简化操作。

3.1 semi_join:保留匹配行
# 保留两个数据框匹配的所有行
flights_sub %>% 
    semi_join(airlines_sub, by = 'carrier')

# left_join 的等价写法
flights_sub %>% 
    left_join(airlines_sub, by = 'carrier') %>%
    filter(!is.na(name)) %>%
    select(-name)

semi_join 结果:

基于R语言的群体药代学研究 r语言编程—基于tidyverse_字段_09

3.2 anti_join:丢弃匹配行
# 丢弃两个数据框匹配的所有行
flights_sub %>% 
    anti_join(airlines_sub, by = 'carrier')

# left_join 的等价写法
flights_sub %>% 
    left_join(airlines_sub, by = 'carrier') %>%
    filter(is.na(name)) %>%
    select(-name)

anti_join 结果:

基于R语言的群体药代学研究 r语言编程—基于tidyverse_字段_10