作为一个电脑爱好者，当你把程序设计完成后，下一步接着就是要为它撰写一个安装程序。可就在这一步，不少人都曾有过这样的苦恼：一个原来仅仅数百KB的小程序，写好安装程序后竟然变成一、两MB，平白无故长“胖”不少。不过，现在大家不用心烦了，让“快速的INF安装程序产生器”INF-Tool为你分担吧！ 首先，让我们看看INF-Tool到底有什么特长?原来，使用INF-Tool制作出来的安装程序文件非
前言我们常说三个臭皮匠顶个诸葛亮，在机器学习领域中将这个理念应用到极致的技术是boosting，将N多的弱分类器组合到一起，达到一个强分类器的效果，主流代表的算法就是xgboost，当然对于这种集成的思想，还有另外一个技术叫做ensemble，我们通过训练出不同算法的最优单模型，然后综合这些单模型的投票结果，输出最终结果。一般来说，ensemble技术主要有两个好处，可以进一步提升模型的性能可以有
顾名思义，node-webkit就是nodejs+webkit。这样做的好处显而易见，核心奥义在于，用nodejs来进行本地化调用，用webkit来解析和执行HTML+JS。快速上手 下载node-webkit 点击这里： https://github.com/ro
# Python打开gff文件的步骤
## 步骤概览
下面是打开一个gff文件的整个流程：
| 步骤 | 描述 |
| --- | --- |
| 步骤1 | 导入所需的模块 |
| 步骤2 | 打开gff文件 |
| 步骤3 | 读取文件内容 |
| 步骤4 | 处理文件内容 |
| 步骤5 | 关闭文件 |
接下来，我们将详细介绍每个步骤需要做什么，以及相关的代码和注释。
## 步骤
原创
2023-07-21 12:30:57
389阅读
## Python读取GFF文件
GFF（General Feature Format）是一种用于存储基因组注释信息的文件格式。在生物信息学研究中，我们经常需要从GFF文件中提取基因的位置、类型和其他注释信息。Python是一种功能强大的编程语言，可以用于读取和解析GFF文件，并提取所需的信息。在本文中，我们将介绍如何使用Python读取GFF文件，并提供一些代码示例。
### 什么是GFF文
原创
2023-11-23 05:38:54
865阅读
# Python处理GFF文件
## 介绍
GFF（General Feature Format）是一种常用于描述基因组结构和注释信息的文件格式。它包含了基因、转录本、蛋白质等生物学实体的位置、特征和其他相关信息。由于GFF文件通常较大且格式复杂，使用Python进行GFF文件处理是一种常见的方法。
本文将介绍如何使用Python处理GFF文件，包括读取、解析和分析GFF文件中的数据。我们将
原创
2023-07-24 01:55:09
862阅读
Pyhon走进python：列表列表是干嘛的：列表用list表示使用[ ]来存放数据，每一项用逗号隔开，列表能存放的数据较多，处理起来也较容易 ，能装对象的对象 是一个可变的数据类型与str不一样lst = ["移动硬盘","笔记本","鼠标",101,["人民币","美金","欧元"]] #这是一个列表存放的是对象的对象索引和切片：lst = ["海上迪斯尼","暴力小子","舌尖上的中国","
首先进行Blast类型的选择：blastp:将待查询的蛋白质序列及其互补序列一起对蛋白质序列数据库进行查询；blastn:将待查询的核酸序列及其互补序列一起对核酸序列数据库进行查询；blastx:先将待查询的核酸序列按六种可读框架(逐个向前三个碱基和逐个向后三个碱基读码)翻译成蛋白质序列，然后将翻译结果对蛋白质序列数据库进行查询；tblastn:先将核酸序列数据库中的核酸序列按六种可读框架翻译成蛋
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2024-10-29 17:25:14
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欢迎关注”生信修炼手册”!鉴于代码的排版问题，建议在电脑上阅读本文。组装得到基因组的序列只是开展基因组研究的
原创
2022-06-21 05:52:18
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【UCSC Genome Browser】- Genes and Gene Predictions - NCBI RefSeqRefSeq（RNA reference sequences collection，） 是NCBI维护的标准参考序列数据库，提供了具有生物意义上的非冗余的基因、转录本及蛋白质序列，详细介绍可以参考RefSeq官网（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/r
简介：Enigma Virtual Box 虚拟文件打包系统（Windows 环境）可以将您的程序和配套文件打包成一个可执行文件，而没有任何效率的损失，配套文件也不会被释放至硬盘。本项功能有独立的免费应用程序，同时支持 X86 和 X64 二进制文件。Enigma Virtual Box 文件打包系统是创建简化程序的理想应用。 软件介绍：Enigma Virtual
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2024-04-19 22:12:59
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1.下载及安装在ffmpeg官网https://ffmpeg.zeranoe.com/builds/可以下载到需要的版本，然后解压到D盘，添加环境变量（如D:\ffmpeg\bin）在cmd输入ffmpeg，出现如图现象，即为安装成功2.使用#视频处理
def file_name(path_file):
for i in range(len(path_file)):#找到不含地址的文件名
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2023-05-31 17:01:24
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欢迎关注”生信修炼手册”!存储基因和转录本的结构信息，gtf和gff3两种格式都可以。在实际分析时，会需要转
原创
2022-06-21 09:05:44
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作业要求：在UCSC下载hg19参考基因组，我博客有详细说明，从gencode数据库下载基因注释文件，并且用IGV去查看你感兴趣的基因的结构，比如TP53,KRAS,EGFR等等。
作业，截图几个基因的IGV可视化结构！还可以下载ENSEMBL，NCBI的gtf，也导入IGV看看，截图基因结构。了解IGV常识。 参考基因组--下载地址：UCSC https://genome.ucsc.e
学习内容
了解可用的基因组注释数据库和存储信息的不同类型
比较和对比可用于基因组注释数据库的工具
应用各种 R 包检索基因组注释
基因组注释对二代测序结果的分析需要将基因、转录本、蛋白质等与功能或调控信息相关联。为了对基因列表进行功能分析，我们通常需要获得与我们希望使用的工具兼容的基因标识符。在这里，我们讨论了您可以获得基因注释信息的方法以
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2024-10-13 19:11:49
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摘自生信技能树中的 直播我的基因组分析 http://www.biotrainee.com/thread-1376-1-1.html我的基因组（五）:测试数据及参考基因组的准备hg19、GRCH37、 ensembl 75 等，基因组各种版本对应关系：http://www.bio-info-trainee.com/1469.html 讲的真全面：首先是NCBI 对应 &nbs
背景： 1，无论是功能测试还是性能测试的造数据，如果逻辑简单可以使用存储过程进行造数据，如果业务复杂可以使用接口进行造数据，但是如果逻辑不是很简单也不是很复杂，那么你该选择哪个呢？别担心，还有第三种选择方式，那就是使用python连接操作，可适用于逻辑结构一般的业务。 2，前端的测试可能只需要去一张表里面查看落库是否正常就可以，但是服务端的测试，就有很多的清表操作，数据同步，数据复制，其中要测的数
机器学习的算法中，讨论的最多的是某种特定的算法，比如Decision Tree，KNN等，在实际工作以及kaggle竞赛中，Ensemble methods（组合方法）的效果往往是最好的，当然需要消耗的训练时间也会拉长。 所谓Ensemble methods，就是把几种机器学习的算法组合到一起，或者把一种算法的不同参数组合到一起。 打一个比方，单个的学习器，我们把它类比为一个独裁者。而
GBase 8s 的基本恢复过程如下：（1）首先恢复元数据。 （2）备份描述控制页面列表列出了用户页面将要被恢复的去向。这些列表的物理地址和 extent 大小将被记录在内存表中。（3）恢复客户端将从磁盘上读取 smart-large-object 页面，并由服务器将其写入控制页 所指定的位置。 其过程如图所示： 另外，在 GBase 8s 进行恢复时，需要用到以下的
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2024-05-14 14:54:00
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Python目前可以用一个字来描述那就是“火”，问题来了，这么火的语言零基础小白到底该怎样学习Python？ 首先，从基础开始学习，切勿毛躁。 刚开始学习Python的时候，我们可能会有些毛躁总觉得这些知识太简单了，没必要去学习，其实这种想法完全是错误的，因
