• apply函数(对一个数组按行或者按列进行计算): 使用格式为: apply(X, MARGIN, FUN, ...) 其中X为一个数组;MARGIN为一个向量(表示要将函数FUN应用到X的行还是列),若为1表示取行,为2表示取列,为c(1,2)表示行、列都计算。 示例代码: > ma <- matrix(c(1:4, 1, 6:
转载 2024-05-16 05:17:59
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apply函数(对一个数组按行或者按列进行计算):使用格式为:apply(X, MARGIN, FUN, ...)其中X为一个数组;MARGIN为一个向量(表示要将函数FUN应用到X的行还是列),若为1表示取行,为2表示取列,为c(1,2)表示行、列都计算。示例代码:> ma <- matrix(c(1:4, 1, 6:8), nrow = 2)> ma  &
转载 2024-04-26 21:31:50
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发现这个网站上搞统计的人还挺多的关于R中利用apply、tapply、lapply、sapply、mapply、table已有 211 次阅读 2011-11-3 10:52 |系统分类:科研笔记|关键词:2n matrix style apply函数(对一个数组按行或者按列进行计算): 使用格式为: apply(X, MARGIN, FUN, ...) 其
转载 2024-05-20 16:31:30
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    组名称和组数量已知的分组汇总被称为固定分组汇总,此类算法的分组依据来自于数据集之外,比如:按照参数列表中的客户名单分组,或按照条件列表进行分组。此类算法会涉及分组依据是否超出数据集、是否需要多余的组、数据是否重叠等问题,解决起来有一定的难度。本文将介绍R语言实现固定分组汇总的方法。    例1:分组依据不超出数据集   
一、apply函数(对一个数组按行或者按列进行计算):  使用格式为: apply(X, MARGIN, FUN, ...) 其中X为一个数组;MARGIN为一个向量(表示要将函数FUN应用到X的行还是列),若为1表示取行,为2表示取列,为c(1,2)表示行、列都计算。apply()函数的处理对象是矩阵或数组,它逐行或逐列的处理数据,其
转载 2023-12-19 10:52:39
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R基础包base的apply族函数采用向量化运算实现批量计算,相较于for循环语句其代码更加简洁、运行速度也更快,恰当地运用这些函数能够极大提高代码质量。本篇主要介绍apply族函数的apply(),lapply(),sapply(),mapply()和tapply()函数。1 apply()函数官方文档给出的apply()函数的语法结构如下:apply(X, MARGIN, FUN, ...)a
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在R语言中使用`tapply`函数时,用户常常会遇到“因子不是数值型”的错误。这个问题多发生在数据处理阶段,影响了后续的统计分析和结果展示。本文将针对这一问题的解决过程进行详细记录。 ## 协议背景 在数据分析过程中,R语言尤其强大,但同时也可能因为数据类型的问题导致一些根本性的错误。这个错误通常出现在对因子型变量进行数值计算时,而因子实际上是分类变量,无法直接进行数值运算。 ### 时间轴
原创 6月前
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文件mart_export.txt3如下所示,可以看到,ENSG00000002016的第二列有很多不同的内容: 现在想要把相同ID的行进行合并,生成新的文件mart_export.txt4如下所示: 则可以使用命令: phe = read.table("mart_export.txt3",head ...
转载 2021-09-24 12:47:00
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R语言使用as.Date函数将字符串转化为日期数据类型、通过tz参数指定时区信息、使用class函数查看数据的类型目录R语言使用as.Date函数将字符串转化为日期数据类型、通过tz参数指定时区信息、使用class函数查看数据的类型R 语言特点R语言使用as.Date函数将字符串转化为日期数据类型、通过tz参数指定时区信息、使用class函数查看数据的类型R可以在CRAN(Comprehensiv
前言刚开始接触R语言时,会听到各种的R语言使用技巧,其中最重要的一条就是不要用循环,效率特别低,要用向量计算代替循环计算。那么,这是为什么呢?原因在于R的循环操作for和while,都是基于R语言本身来实现的,而向量操作是基于底层的C语言函数实现的,从性能上来看,就会有比较明显的差距了。那么如何使用C的函数来实现向量计算呢,就是要用到apply的家族函数,包括apply, sapply, tapp
转载 2024-04-10 23:02:56
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apply() apply(m,dimcode,f,fargs) m 是一个矩阵。 dimcode 是维度编号,取1则为对行应用函数f,取2则为对列运用函数f。 f 是函数 fargs 是函数f的可选参数集 >
原创 2023-11-06 14:32:18
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tabulate-频率表1.句法tabulate(x)%返回的是一个频率表,包括value,Count,Percenttbl=tabulate(x)%返回表格里的数值,或以cell形式2.描述tabulate(x):显示向量x的频率表。对于x中的每一个唯一的值,tabulate函数显示该值在x中的实例数和百分比。tbl=tabulate(x):当x 是数字时,将频率表tbl返回为数字矩阵,否则返回
1.      tapply函数的一个例子解释>n<-17;fac<-factor(rep(1:3,len=n),levels=1:5) > table(fac) fac 1 2 3 4 5 6 6 5 0 0 > tapply(1:n,fac,sum) 1 2 3 4 5 51 57 45 NA NA求和过
目录一、doBy包中的函数1.1 doBy()的准备1.2 doBy()三个函数的描述二、函数的介绍2.1 summaryBy()2.2 orderBy()2.3 sampleBy()总结 一、doBy包中的函数在上章内容中我们讲了tapply()函数(tapply函数介绍)可以用于分组。数据处理中关于对数据进行分组的包有很多,其中doBy最有名。我们主要介绍doBy中的三个函数。分别是summ
R学习笔记4_初级数据排序sort函数rank函数order函数数据转换长宽型数据转换stack函数tapply函数reshape函数reshape2函数变量因子化(连续变量离散化)数据汇总apply家族apply函数lapply函数sapply函数tapply函数mapply函数ave函数by函数aggregate函数sweep函数 本系列为R语言系统学习笔记,已收录至“R语言笔记”专栏,可戳
转载 2023-06-25 14:14:53
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data.entry(mtcar) # 编辑 edit(mtcar) # 编辑 fix(mtcar) # 列出结构 attach(mtcar) detach(mtcar) table(mtcar) barplot(table(Cry)) mean(mtcars$mpg,trim=0.1) # 截外平均 mean(mtcars$mpg) # 平均 tapply(mtcars$
转载 2023-10-30 21:25:39
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R提供了计算单变量,多变量和观察值子集的均值,长度,标准差,最小值,最大值,方差等的函数。1 tapply函数首先载入实验数据Veg <- read.table(file = "Vegetation2.txt",header = TRUE) names(Veg) [1] "TransectName" "Samples" "Transect" "Time"
转载 2023-09-27 10:33:54
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R中主要的循环函数(loop functions)有 lapply( )、sapply( )、apply( )、tapply( ) 和 mapply( )。 lapply( )lapply( )对列表中每个元素,包括各种类型的对象(向量、矩阵、数据框等),运用函数,返回一个新的列表。lapplyfunction (X, FUN, ...) { FUN if (!is.vec
主要目标:理解这个代码的主要的思路。想分析一下老师的这个富集分析的主要的思路是什么? 一行一行的理解这个代码。# Get cell type mean of each gene cellTypeMean <- t(apply(dat, 1, function(v) { tapply(v, droplevels(factor(cellSubtypes, levels=subtypeOrder
如果计算涉及到一个单一的向量,而结果也是一个向量,tapply函数是一个可选项,不同于aggregate函数,它返回一个向量或数组,这使得其单个元素很容易被访问。将组定义...
转载 2022-08-09 16:30:18
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