1. tapply函数的一个例子解释>n<-17;fac<-factor(rep(1:3,len=n),levels=1:5)
> table(fac)
fac
1 2 3 4 5
6 6 5 0 0
> tapply(1:n,fac,sum)
1 2 3 4 5
51 57 45 NA NA求和过
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2023-06-25 08:33:27
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标题：如何使用R语言输出多个图
## 引言
在数据分析和可视化的过程中，经常需要一次性输出多个图表。R语言提供了丰富的函数和库来实现这一目标。本文将向刚入行的小白介绍如何使用R语言输出多个图表的方法。
## 流程概览
下面是整个流程的概览，使用表格展示了每个步骤和对应的代码：
| 步骤 | 代码 | 说明 |
| --- | --- | --- |
| 1 | `library(ggplot
原创
2024-01-25 12:31:51
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# 如何获取R语言输出图的路径
在数据分析和可视化过程中，R语言是一种非常强大的工具。它不仅可以生成各种图表，还可以将这些图表保存为文件，以便进一步使用或分享。然而，有时候我们需要获取这些图表的路径，以便在其他应用程序中引用或进行进一步处理。本文将介绍如何获取R语言输出图的路径，并提供一些代码示例。
## 旅行图
在开始之前，我们先了解一下获取R语言输出图路径的旅程。
```mermaid
原创
2024-07-19 11:47:13
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完整代码图片绘制过程完全是由R语言完成的，完整代码如下，细节说明见下文library(imager)
opar = par(no.readonly = F)
gzh = load.image("129.二维码/公众号二维码.jpg")
wx = load.image("129.二维码/wechat.jpg")
bz = load.image("129.二维码/b站2.jpg")
zh = load
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2024-06-17 20:14:00
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1、数据集的概念按照某种格式来创建数据集，是任何数据分析的第一步1、选择一种数据结构来存储2、将数据输入或导入到这个数据结构中向R中导入数据有很多方便的方法，可以手工输入数据，也可以从外部源导入数据，数据源可以是电子表格（excel）、文本文件（txt）、统计软件（SAS）和各类数据库（MYSQL）等。 数据集通常是有数据构成的一个矩形数组，行表示记录，列表示属性（字段）。如下面一个病例清单： R
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2023-09-11 12:28:43
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文章目录柱状图用腻了？试试好看的弦状图弦图简介数据准备代码部分载入R语言包数据导入颜色设定画图保存以上图片Circlize包的所有参数(个性化设置)笔者个性化弦图 柱状图用腻了？试试好看的弦状图作者：郑伟弦图简介总体来讲，弦图是一种可视化微生物物种或基因相对丰度的方法。平时大多数时间我们看到的文章一般都用柱状图表示微生物或者基因的相对丰度，弦图和柱状图最大的区别就在于它不仅可以用来表示微生物物种
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2024-01-08 22:46:43
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在我们的一篇客户文章的GO/KEGG富集分析部分有这样一类热图（如下），通过改变颜色条的映射方式，以0.05为分界，非常巧妙地实现对Q值(也可以是P值)的可视化展示，直观展示出感兴趣通路在不同比较组的富集情况。 genes,2019 绘制这样的热图，有两个关键的步骤：颜色条的控制和分组信息的添加。接下来，就为大家介绍如何使用R语言的pheatmap包绘制这样的图表
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2023-06-21 10:07:04
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# 使用R语言输出图象到PDF文件
在数据分析和可视化的过程中，R语言以其强大的绘图能力而受到广泛欢迎。尤其是在需要将图形保存为文件时，将图像输出为PDF格式非常常见。本文将带您了解如何使用R语言将图像输出为PDF格式，并以饼状图为例展示整个过程。
## R语言绘图基础
R语言中有多个绘图库可用于制作图形，最常用的包括基础图形系统、`ggplot2`、`lattice`等。为了实现将图像输出
原创
2024-08-15 09:23:34
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ggplot2是一款强大的绘图R包，今天的笔记内容是学习使用ggplot2来绘制一幅热图，并进行美化调整。需要加载的包有两个：ggplot2、reshape2。如果你也想跟着笔记一起学习，请访问链接下载脚本：https://down.jewin.love/?f=/Rscript/访问上面的网址即可下载使用，也可以直接在Rstudio中运行下面这一句代码，则会自动在当前工作路径下生成11副PDF图片
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2023-06-20 14:53:01
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## R语言 plot 输出矢量图
作为一名经验丰富的开发者，我将向你介绍如何使用R语言绘制图形并输出矢量图。下面是整个流程的步骤：
```mermaid
journey
title R语言 plot 输出矢量图流程
section 了解R语言的plot函数
section 安装和加载必要的R包
section 创建数据
section 绘制图形
原创
2023-10-30 11:02:47
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\r 回车： 在Linux、unix 中表示返回到当行的最开始位置。 在Mac OS 中表示换行且返回到下一行的最开始位置，相当于Windows 里的 \n 的效果。 \n 换行： 在Windows 中表示换
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2023-10-15 22:45:29
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森林图在论文中很常见，多用于表示多因素分析中的变量与结果变量的比值效应，可以用图示的方法比较直观的绘制出来，本期介绍两种快速绘制多因素回归分析森林图方法，比较适合新手，可以快速出图。 继续使用我们的乳腺癌数据首先把数据和包导入library(foreign)
library(survival)
library("survminer")
bc <- read.spss("E:/r/test/B
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2023-08-17 16:47:41
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看了几天的书，终于到这一步了，说实话，用R来做统计，很少有人手动的去输入那些数字，肯定是从别的地方导入的，我们用来处理就可以了，所以到这里才算是真正的入门，前面都是做基础的练手。我学习R从《R语言与统计分析》入手，第一个例子，从书上的例子，入手，为大家能够快速入门。在F盘下有个r文件夹，里面有个foo.txt的文件，文件的内容如下：treat weightA  
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2023-06-25 14:54:53
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不常用R的朋友，可能并不能意识到好的编辑模板带来的长期效率提高和代码重用性，非计算机专业科研人员且需要使用R语言，此文会对您有帮助。个人认为：是否能熟悉使用Shell(项目流程搭建)+R(数据统计与可视化)+Perl/Python等(胶水语言，数据格式转换，软件间衔接)三门语言是一位合格生物信息工程师的标准。之前分享过我个人的《Shell语言》和《Perl语言》脚本写作模板(蓝色字为链接直达)，今
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2024-07-05 17:28:11
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一、标准输入、输出1. 简单的输入\输出机制从标准输入中一次读取一个字符：int getchar(void)
将字符c送到标准输出中： int putchar(int)
2. 输入重定向如果程序prog中使用了getchar函数，那么 prog < infile，将使得程序prog从输入文件infile中读取字符。如果输入通过管道来自另一个程序，那么这种输入切换也是不可见的。如命令other
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2024-07-28 14:09:10
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上一期“【R语言】——绘制按聚类结果分组的热图3”介绍了R语言pheatmap包绘制按聚类结果分组的热图，本期主要介绍使用ComplexHeatmap和circlize包绘制环形热图，环形热图可以将过长的热图变为环状，从而节省空间和使基因标签变得更为的清晰及美观。1 数据准备数据输入格式（csv格式）： 2 R包加载及数据导入#下载包#
install.packages("circli
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2023-07-31 10:45:29
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目录前言pheatmap包pheatmap简介常用参数介绍使用安装绘制样本间相关系数图（简单使用）差异表达基因热图（进阶使用）如何查看pheatmap的聚类结果pheatmap总结corrplot包参考资料 前言在生信分析中，我们常常需要计算一个样本的几次实验结果或者不同样本实验结果的相关系数（样本间相关系数）以判断几个数据集之间相关的程度。 在本篇中及之后的内容中，为了用R得到相关系数热图（本
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2023-08-15 22:19:33
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绘制热图除了使用ggplot2，还可以有其它的包或函数，比如pheatmap::pheatmap (pheatmap包中的pheatmap函数)、gplots::heatmap.2等。 相比于ggplot2作heatmap, pheatmap会更为简单一些，一个函数设置不同的参数，可以完成行列聚类、行列注释、Z-score计算、颜色自定义等。data_ori <- "Grp_1;G
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2023-08-22 21:49:35
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# 项目方案：使用R语言中的ggplot2进行图片输出
## 引言
在数据科学和统计分析中，数据可视化是不可或缺的一部分。R语言作为一门强大的统计语言，允许我们通过各类图形库实现数据的视觉化。其中，ggplot2是一个非常流行的绘图库，使得数据可视化变得更加简洁和高效。在本项目中，我们将探讨如何使用ggplot2输出各种类型的图片，包括序列图和甘特图，并展示相应的代码示例。
## 项目目标
原创
2024-08-22 04:38:41
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相关点总结通用打印：print &sprintf & catprint(sprintf("something : %d", i) # 不要漏了print，不然不输出使用print则转义字符失效，建议使用cat。注意print有自动换行，cat没有。(但print可以打印各种格式，包括list；而cat好像不能打印list，可能是只能打印字符串，本人暂未查证） 因此，含转义字符的字符
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2023-06-21 15:52:20
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