一、ropls简介ropls可以实现PCA、PLS(-DA)和OPLS(-DA)方法,包括R2和Q2质量指标,VIP值计算,检测异常值分数和正交距离,以及许多图形(分数、加载、预测、诊断、异常值等)。二、背景知识偏最小二乘法(PLS)是一种基于预测器和因变量之间协方差潜在变量回归方法,已被证明可以有效地处理多共线预测器数据集,如光谱测量。正交偏最小二乘(OPLS)算法,以分别对与因
1、R语言概念         R提供了大量开箱即用功能,但它最激动人心一部分功能是通过可选模块下载和安装 来实现。目前有2500多个①称为(package)用户贡献模块可从http://cran.r-project.org/ web/packages下载。这些提供了横跨各种领域、数量惊人新功能,包括分析地理数据、处理 蛋白质质
转载 2023-07-04 21:00:29
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广义线性模型(GLM)是常见正态线性模型直接推广,它可以适用于连续数据和离散数据,特别是后者,如属性数据、计数数据。这在应用上,尤其是生物、医学、经济和社会数据统计分析上,有着重要意义。对于广义线性模型应有一下三个概念:第一是线性自变量,它表明第i个响应变量期望值E(yi)只能通过线性自变量βTxi而依赖于xi,其中如通常一样,β是未知参数(p+1)x1向量,可能含截距。第二是连续函数,
转载 2023-08-07 21:59:43
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R语言中括号是一种重要语法元素,用于控制代码执行顺序、调用函数以及创建数据结构。在本文中,我们将详细介绍R语言中括号作用。 首先,括号用于控制代码执行顺序。在R语言中,括号可以改变表达式优先级,从而影响代码执行结果。例如,加法和乘法运算符具有不同优先级,可以使用括号来明确指定运算顺序。下面是一个示例: ```R result
原创 2023-10-08 15:08:11
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R语言中包含五种数据结构:1.向量,2.矩阵,3.数组,4.数据框,5.列表,6.因子1.向量:用于存储数值型、字符型、逻辑型数据一维数 #用c()创建一个数组,如下: #同一个向量应只包含一种数据类型 a<-c(1,3,4,5,6) b<-c("Hello","World","What") c<-(TRUE,FALSE,TRUE,TRUE,FALSE) #向量元素获取 a[
学习一个新编程语言惯例是什么?,当然是编写一个“Hello,World!”,下面我们将演示如何使用R编程编写一个“Hello,World!”程序。根据需要,您可以在R命令提示符下编程,也可以使用R脚本文件编写程序。R命令提示符当安装好了R开发环境以后,那么通过在命令提示符下键入以下命令,就可以启动R命令提示符 -$ R或者,在Windows系统下 -C:\Users\Administrator&
0 理论部分Prophet 是一种基于加法模型预测时间序列数据程序,其中非线性趋势、季节性以及假日效应相匹配。它最适用于具有强烈季节性和有几个季节历史数据时间序列。Prophet 对缺失数据和趋势变化具有鲁棒性,并且通常可以很好地处理异常值。1 基本流程       在 R 中,我们使用正常模型拟合 API。 我们提供了一
1 两者都可以用于表示字符串分隔,用法和意义没有差别如果字符串包含有分隔符本身,字符串内分隔符引号需要转义(使用反斜杠)R语言字符串打印/显示都是用双引号形式表示,双引号是推荐使用字符串分隔符单引号字符串通常仅在字符串内含有双引号时使用 (aa <- 'This is an example.') ## [1] "This is an example." (bb <-
转载 2023-05-22 22:59:35
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前言总所周知,R语言有些神奇赋值操作, 同一个函数既可以正常使用获取对象属性, 又可以给返回值赋值从而修改原对象属性names 下例实现了给对应元素一次性赋值name属性功能。> a = c(1,2) > names(a) = c("张三","李四") > names(a) [1] "张三" "李四" > a 张三 李四 1 2 >length下
转载 2023-06-22 21:01:50
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参考,文中较为详细,本文结合该文章进行实践,主要还是学习,哈哈~~1.网页基础知识 可以参考用python爬虫学习笔记中第一节或者直接参考该网址2.rvest用法简介 下面对rvest主要函数功能做一下说明: read_html() 读取html文档函数,其输入可以是线上url,也可以是本地html文件,甚至是包含html字符串也可以。 html_nodes() 选择提取文档中制
转载 2023-10-20 23:04:26
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二代测序 (NGS) 发展已经彻底改变了许多领域研究。在很多临床研究队列研究中,微生物甚至被誉为人类第二基因组,参与多种疾病生理及病理生理机制。然而,海量测序数据以及各种统计分析及模型算法引入,显著增加微生物数据分析研究初学者学习难度。特别是在研究初期需要频繁进行数据及代码操作时,繁杂数据分析代码极大提高了各种意想不到错误风险性。因此,需要一种高效便捷微生物组数据分析工具能
转载 2024-01-26 21:50:39
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# 科普文章:探索R语言中vegan ## 简介 在生态学和环境科学领域,物种多样性分析和生态学统计是非常重要研究内容。R语言作为一种强大统计分析工具,提供了许多用于生态学数据分析。其中,veganR语言中最受欢迎生态学分析之一,提供了各种多样性指数计算、物种组成分析、群落相似性分析等功能。 ## 安装vegan 要使用vegan,首先需要安装它。在R中,可以使用
原创 2024-06-02 05:49:03
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R作为一门完全免费开源计算机语言,现在越来越受到大家欢迎。那么到底R是什么呢?说到底,R就是(package)集合,而又是关于函数、数据集和编译器集合。在R语言中,有2类,一类是基础(base),它们在你下载R时候会被默认下载,是一些基础操作运行底层;一类是共享(contrib),它们是由全球性研究社区和第三方提供集合,用于满足不同受众需求而开发,可以选择性下载
简介批量处理函数有很重要apply族函数:lapply sapply apply tapply mapply。这些函数底层通过C实现,效率比手工遍历高效。apply族函数是高效能计算运算向量化(Vectorization)实现方法之一,比起传统for,while常常能获得更好性能。apply : 用于遍历数组中行或列,并且使用指定函数来对其元素进行处理。lapply : 遍历列表向量内
转载 2023-08-13 10:38:10
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R语言是个好东西,其实数据挖掘本不是一件新鲜事,MATLAB等等早就可以做到,但如R这样,即可以有完整数据挖掘工具,又可以绘制出精美的堪比Origin图形,更重要是人家还是开源软件,可供免费使用,这便使其成为了“爆款”。前段时间开始学习R语言,凡有心得总结,都记录在博客里吧,如有不足之处,日后熟练了再返回来修改。下载安装完毕R语言之后,第一件事并不是开始干活,而是熟悉一下环境配置。设置工作
文章目录R语言函数自定义函数调用函数默认参数R函数功能延迟 R语言函数R语言具有大量内置函数,用户也可以创建自己函数。在R语言中,函数是一个对象,因此R语言解释器能够将控制传递给函数,以及函数完成动作所需参数。自定义函数使用关键字 function 创建R语言函数。 R语言函数定义基本语法如下函数名 <- function(参数列表){ 函数体 返回值
转载 2023-05-22 10:28:53
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# R语言中raster使用指南 R语言是一种广泛用于数据分析和可视化语言,尤其在地理信息系统(GIS)和环境科学中被广泛使用。`raster`R中处理栅格数据重要工具,能够高效地加载、处理和分析栅格数据。本文将介绍如何使用`raster`,并通过具体步骤和代码示例帮助小白开发者掌握这一工具。 ## 流程概述 在开始之前,让我们先梳理一下使用`raster`基本流程。下面是
原创 2024-08-29 08:26:29
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# 了解R语言中DMwR 数据科学一个重要任务是处理和清洗数据,以便进行分析和建模。R语言作为统计分析和数据可视化领域强大工具,提供了许多来简化数据处理流程。DMwR(Data Mining with R就是其中之一,它提供了一组工具帮助数据科学家在数据挖掘和机器学习中进行数据预处理和模型评估。本文将深入探讨DMwR功能,并通过代码示例帮助您更好地理解如何使用这一工具。 ##
原创 9月前
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在数据可视化世界里,R语言无疑是常用工具之一,而在这个工具中,`wordcloud`为我们提供了一种直观且美观方式来展示文本数据频率。本文将深入探讨如何处理R语言中`wordcloud`问题,并且逐步为您展现必要技术背景、理论基础及实际案例。 ### 背景描述 在数据分析和可视化领域,词云图因其出色视觉效果而广受欢迎。自2010年,`wordcloud`便成为了R语言用户
原创 5月前
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# R语言中SAM:一种用于基因表达数据分析工具 在生物信息学研究中,基因表达数据分析至关重要。随着高通量技术发展,如何有效处理和分析这些数据成为了一个热门课题。R语言作为一种强大统计计算工具,拥有众多生物信息学,其中**"SAM"(Significance Analysis of Microarrays)**就是一个非常有用工具。 ## SAM简介 **SAM**
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