Mantel test 是对两个矩阵相关关系的检验,由Nathan Mantel在1976年提出。之所以抛开相关系数发展这样一种方法,是因为相关系数只能处理两列数据之间的相关性,而在面对两个矩阵之间的相关性时就束手无策。Mantel检验专治这种不服。这种方法多用于生态学上,不同的样本case对应不同的变量,而不同的变量可以分属不同的类别,对case有不同角度的刻画。如基于不同植物种类数量可以建立样
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2023-10-30 21:37:08
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存在两个及以上连续结果(或响应)变量的ANOVA被称为多变量方差分析(Multivariate Analysis of Variance,MANOVA)。例如,将小鼠分为处理A和处理B两组后,测量小鼠的长度和高度。此时小鼠的长度和高度就是结果变量,假设长度和高度都因为处理不同产生差异。此时可以使用MANOVA检测上述假设。MANOVA分析过程总结如下:1)将所有结果变量经过线性组合形成一个新的复合
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2023-12-14 12:07:42
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# 项目方案:使用Python的MANOVA进行多变量分析
## 1. 项目背景和目标
在统计学中,多元方差分析(Multivariate Analysis of Variance,简称MANOVA)是一种用于比较多个因变量在不同组别间的均值差异的方法。与一元方差分析(ANOVA)相比,MANOVA可以同时考虑多个因变量的影响,更适用于分析多个相关变量之间的差异。
本项目的目标是利用Pyth
原创
2024-01-15 10:48:23
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注: 本文是R语言sf包的核心开发者和维护者——来自德国明斯特大学的地理信息学教授:
Edzer Pebesma 的一篇关于sf包的简介,发表于2018年7月的R语言期刊,主要讲述了sf的定位、功能、开发现状及现存问题和今后展望,sf包是一个非常了不起的工具,在R语言中引入了空间数量分析领域通用的标准规范(simple feature),结合tidyverse工具箱组合
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2023-06-30 18:38:28
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1.单因素方差分析:适用于单因素A有两个水平或以上,研究个水平对因变量的影响正态假设条件:W检验shapiro.test():原假设为数据来自正态分布方差齐性条件:Bartlett检验(主要用于正态分布的数据) bartlett.test(x, g, ...)x是数据向量或列表(list);g是因子向量,如果x是列表则忽略g。 当使用数据集时,也可以通过formula调用函数&
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2023-06-25 20:40:28
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本文讲述R语言中apply家族的函数的使用方法。一、lapply
最好不要试图一开始就用apply函数,因为它比lapply函数复杂。lapply函数是apply家族的函数中逻辑最简单、版本兼容性、最user-friendly的函数。你甚至可以用lapply这一个函数打天下。其基本语法为:lapply(Vector, function(ii) { ... })。例如,有这样一个data.frame
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2023-06-16 19:39:15
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R中还有一个有趣的sqldf包,它可以让你用SQL来操作dataframe,这种功能能让会R的人能练习SQL,会SQL的人能练习R,不得不感叹R语言的强大技能和神奇魅力。 当然也可以将R与外部数据库连接,直接在R中操作数据库,并生成最终结果,这也是一种可行的方法。在R中连接数据库需要安装其它的扩展包,根据连接方式不同我们有两种选择:一种是ODBC方式,需要安装RODBC包并安装ODBC驱动。另一
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2023-08-08 17:17:47
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R语言数据分析 听课笔记第三部分搏术目录R语言数据分析 听课笔记第三部分搏术观数以形:一维数据作图茎叶图直方图小提琴图箱线图小提琴图 + 箱线图观数以形:二维数据作图观数以形:高维数据作图三维散点图脸谱图平行坐标图11章 相随相伴,谓之关联关联规则 I关联规则 II关联规则 III分类:既是世间法,自当有分别近邻法, k-最近邻分类算法R语言实现树模型(决策树) CART算法R语言实现随机森林算法
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2023-09-14 13:22:06
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R操作关系型数据库基本要求: R语言基础,懂得一定SQL语法, 懂得使用搜索引擎目标: 学会使用DBI操作SQLite数据库简介R本身不具备数据库操作能力,需要额外的扩展包--DBI(database interface)。DBI将数据库管理分为前端和后端。用户在前端使用对应的API, 经由DBI转换成相应的底层操作.DBI分为三个部分:数据库驱动, 负责与数据库进行交互,比如说与SQLite数据
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2024-04-26 09:20:49
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Nomogram,中文常称为诺莫图或者列线图,简单的说是将Logistic回归或Cox回归的结果进行可视化呈现。它根据所有自变量回归系数的大小来制定评分标准,给每个自变量的每种取值水平一个评分,对每个患者,就可计算得到一个总分,再通过得分与结局发生概率之间的转换函数来计算每个患者的结局时间发生的概率。 下图显示的 logisitc
回归的诺曼图。比如想知道年龄
70
岁的男性的患病风险,
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2023-09-10 15:14:22
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文章目录1、资料下载2、注册用户3、安装和测试opencv 最近看到329的论坛又更新了好多东西,于是我又蠢蠢欲动了,另外也想好好熟悉下linux,就又拿起来了,这里记录下过程。1、资料下载首先是要下载什么东西优先还是去官方的网盘下载吧,更新速度还是内容都是最新的sipeed企业网盘这里我主要是为了下这个最新的镜像,就去了这边下载,因为最新的镜像已经内置了很多我们测试用的模型,就比较方便我们使用
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2023-11-05 20:24:06
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目录一、数据二、logistic回归1.拟合2.预测三、probit回归四、经典判别分析(线性、混合线性、灵活线性)五、交叉验证与比较一、数据脊柱数据(Column_2C.csv、Column_3C.csv)有两个版本,区别在于分为两类还是3类。不过是.dat文件,需要进行相应的转换或者直接下载我上传的文件,是已经对格式和数据经过处理,可以直接进行分析的csv文件。数据具有6个自变量(生物力学特征
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2023-09-11 12:41:45
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本文主要介绍R语言中基本图形的绘制,包含以下几种图形:1.条形图 2.饼图 3.直方图 4.核密度图 5.箱线图 6.点图1.直方图的绘制 #直方图绘制
barplot(height)
#height是一个向量或者矩阵
a<-c(1,2,3,4,5,6)
#垂直直方图
barplot(a,main="Simple Bar Plot",xlab="
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2023-07-16 16:45:09
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统计检验是将抽样结果和抽样分布相对照而作出判断的工作。主要分5个步骤:建立假设求抽样分布选择显著性水平和否定域计算检验统计量判定 —— 百度百科
假设检验(hypothesis test)亦称显著性检验(significant test),是统计推断的另一重要内容,其目的是比较总体参数之间有无差别。假设检验的实质是判断观察到的“差别”是由抽样误差引起还是总体上的不同,目的是评价两种不同处理引起效应
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2023-10-07 22:38:46
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R语言中有关绘图的包:base、grid、lattice及ggplot21.lattice包可生成栅栏图形 [plain] view plaincopy
1. library(lattice)
2. histogram(~height|voice.part,data=singer,
3. main="Distribution of He
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2024-02-05 14:41:39
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在计量经济学中,经常要对时间序列数据进行回归建模。时间序列数据通常具有异方差(Heteroscedasticity)和自相关(Autocorrelation)的性质,此时使用传统的最小二乘法(OLS)估计回归参数虽然仍可得到参数的无偏估计,但是传统方法计算出来的参数方差具有偏差,会导致参数的t检验不准确,常出现虚假显著的情况。为避免这种情况,计量经济学中常对上述参数的方差进行调整,最常用的是N
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2023-09-14 13:09:06
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什么是R语言R语言简介R语言的诞生、发展、优缺点· R语言——集数据操作、分析、展示于一体的数据分析工具· 源于S语言,与S-PLUS同为S语言的实现· 2000年发布第一个二进制版本,目前最新版本4.0.0· 随着数据分析的兴起,R语言也正在变得热门——TIOBE· R语言的优点· R语言的缺点开发工具----R与RstudioR· R-project网站介绍、下载安装· R环境界面介绍RSt
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2023-06-21 18:26:56
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R语言如何计算矩阵的行均值?目录R语言如何计算矩阵的行均值?R语言是解决什么问题的?R语言如何计算矩阵的行均值?R语言是解决什么问题的?R 是一个有着统计分析功能及强大作图功能的软件系统,是由奥克兰大学统计学系的Ross Ihaka 和 Robert Gentleman 共同创立。由于R 受Becker, Chambers & Wilks 创立的S 和Sussman 的Scheme 两种语
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2023-08-07 10:38:41
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SPecc函数用法 R语言 Spectral Clustering谱聚类Description A spectral clustering algorithm. Clustering is performed by embedding the data into the subspace of the eigenvectors of an affinity matrix.描述用法参数附加参数描述
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2023-09-01 23:02:55
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R语言是进行统计分析和可视化的优秀语言(其实机器学习和网页制作也可以用R,小声说~|ω`)) R语言 相信大家在利用R语言进行数据分析的时候可能会有大数据分析需求。所谓大数据,很好理解,就是大样本高维度数据,这样的数据在当今信息爆炸时代,很是常见。比如医学数据,数据量大,维度极高,因为医学的检测指标多,而且随着基因测序特别是二代测序等高通量测序(High-throughput sequen
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2023-05-28 15:09:11
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