文章目录回归分析OLS回归的使用场景异常值分析利群点高杠杆值点强影响点 回归分析通过一个或者多个变量预测响应变量的方法。[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-8EokBER4-1593327054520)(https://i.loli.net/2020/06/19/udUt7GNCyrWImkZ.png)]普通最小二乘(OLS)回归法，包括简单线性回归、多
我是目录前言1、GGEBiplot简介2、GGEBiplot使用步骤2.1 引入库2.2 图像界面操作3、GGE 双标图重要功能图型。3.1 “哪个赢在哪里”图3.2 “环境间关系”图3.3 “区分力和代表性”图3.4 “高产性和稳产性”图总结参考文献 前言双标图分析可直观分析农作物品种多点试验数据和其他类型的两向数据。经过实践检验，这种方法越来越被植物育种家和农业研究人员的推崇。本章内容主要简
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2023-09-21 10:31:34
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机机是个好动又好学的孩子，平日里就喜欢拿着手机地图点点按按来查询一些好玩的东西。某一天机机到北海公园游玩，肚肚饿了，于是乎打开手机地图，搜索北海公园附近的餐馆，并选了其中一家用餐。 饭饱之后机机开始反思了，地图后台如何根据自己所在位置查询来查询附近餐馆的呢？苦思冥想了半天，机机想出了个方法：计算所在位置P与北京所有餐馆 的距离，然后返回距离<=1000米的餐馆。小得意了一会儿，机机发现北
# 使用R语言分析地理数据入门指南
在现代数据分析中，R语言已经成为一项重要的工具，尤其是在处理地理数据时。本篇文章将指导你如何使用R语言进行地理数据分析。我们将涵盖整个流程，同时提供所需的代码和必要的注释，帮助你逐步掌握这一技能。
## 流程概述
在开始之前，让我们先看一下分析流程的整体步骤：
| 步骤 | 描述 |
|------|------|
| 1 | 安装必要的R包 |
在R用户组织的主题为“R与预测分析科学”的panel会议上，有来自工业界的四位代表发表了讲话，介绍各自在工业界是如何应用R进行数据挖掘。他们分别是：Bo Cowgill, GoogleItamar Rosenn, FacebookDavid Smith, Revolution ComputingJim Porzak, The Generations Network 他们分别
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2023-10-18 19:54:23
127阅读
## 解析GEO数据的流程
下面是解析GEO数据的流程图：
```mermaid
graph LR
A(开始)
B(下载GEO数据)
C(读取GEO数据)
D(数据预处理)
E(数据分析)
F(结果展示)
G(结束)
A --> B
B --> C
C --> D
D --> E
E --> F
F --> G
```
## 步骤详解
### 1. 下载GEO数据
首先，你需要下载GEO
原创
2023-10-06 09:46:46
386阅读
# GEO数据挖掘与R语言
随着生物信息学和计算生物学的发展，基因表达数据的分析变得愈发重要。GEO（Gene Expression Omnibus）数据库是一个大型公共数据库，存储了大量的基因表达数据。利用R语言对GEO数据的挖掘，可以帮助研究人员从中提取有价值的信息。本文将介绍如何用R语言进行GEO数据挖掘，示例代码将帮助您更好地理解这一过程。
## 数据获取
在R中，我们可以使用`GE
## R语言导入GEO数据的步骤和代码解释
### 1. 简介
在生物信息学中，GEO（Gene Expression Omnibus）是一个非常重要的公共数据库，存储了大量的基因表达数据。为了进行生物数据分析，我们需要将GEO数据导入到R语言环境中，以便进行后续的统计分析和可视化。
本文将以一个步骤表格的形式介绍如何使用R语言导入GEO数据，并给出每一步所需的代码和解释。希望这能帮助刚入行的
原创
2023-11-26 03:20:51
1120阅读
# 使用R语言加载GEO包
在生物信息学领域，我们经常需要分析基因表达数据，而GEO（Gene Expression Omnibus）数据库是一个非常重要的资源，其中包含了大量的基因表达数据供科研人员使用。为了方便地从GEO数据库中获取数据并进行分析，我们通常会使用R语言的GEO包。
## 什么是GEO包
GEO包是一个用于从GEO数据库中下载数据并进行预处理的R语言包。使用这个包，我们可以
原创
2024-04-14 05:21:55
214阅读
# R语言读取GEO数据教程
## 1. 简介
在生物信息学领域，GEO（Gene Expression Omnibus）数据库是一个重要的公共数据库，用于存储和共享基因表达数据。读取GEO数据是生物信息学分析的基础步骤之一。本教程将指导你如何使用R语言读取GEO数据。
## 2. 整体流程
下面是读取GEO数据的整体步骤：
| 步骤 | 描述 |
| --- | --- |
| 步骤1 |
原创
2024-02-01 10:10:03
903阅读
## 如何实现LOOCV GEO数据 R语言
### 流程图
```mermaid
flowchart TD
A(准备数据) --> B(拆分训练集和测试集)
B --> C(建立模型)
C --> D(预测)
D --> E(评估)
```
### 步骤表格
| 步骤 | 描述 |
|------|----------------|
|
原创
2024-05-22 07:17:10
62阅读
# GEO R语言下载及其应用
## 什么是GEO？
GEO（Gene Expression Omnibus）是一个公共功能基因组数据存储库，提供基因表达数据、芯片数据以及相关的元数据和分析工具。它由美国国家生物技术信息中心（NCBI）维护，研究人员可以在此提交和查询相关的生物学数据。对于生物信息学研究人员来说，获取和分析GEO数据库中的数据至关重要。R语言作为一种功能强大的统计分析工具，提供
目录1.载入R包2.利用AnnoProbe下载GEO数据库中的数据3.提取表达矩阵和临床信息4.输出文件1.获得GEO数据库中的数据下面以GSE14520数据系为例：获得GEO数据库中的数据总体上分为两种办法：1.从GEO数据库中下载；2.用R包下载（1）从GEO数据库中下载进入GEO网站，找到对应的Series Matrix File(s)即表达矩阵进行下载，保存到本地进行加载。 在R
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2023-06-21 10:40:21
3215阅读
1.数据挖掘的方法有哪些？ 分类方法有K近邻、Logistic回归、朴素贝叶斯和贝叶斯网络、决策树（ID3/C4.5/CART/RF）、Boosting、人工神经网络、支持向量机、组合分类器等。 聚类方法有K均值、K中心点、层次聚类BIRCH、密度聚类DBSCAN、模糊聚类、SOM等。 关联规则方法有Apriori算法、FP-growth算法等。 其他还有数据可视化方法、维数约简（PCA）等。 2
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2023-09-20 13:38:44
72阅读
本文介绍ggplot2中常见的几种类型图的绘画，包括散点图、折线图、直方图、柱状图、时间序列图，由于ggplot2所用的数据格式是数据框类型的（Excel表格正常导入就是），非数据框格式的数据需先进行转换，可以利用函数data.frame()完成.ggplot2画图的基本语法为:ggplot(data = <你的数据>,aes(x = <x轴代表什么>, y = <y
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2023-07-26 12:44:45
195阅读
一个关于 R作直方图的小例子 2010-04-27 19:31:36| 分类： R&Bioconductor|举报|字号订阅
首先是一串很简单的数据，有30个元素： 把它逐行打到一个TXT文件中去，命名为ex1.txt，保存在目录E:\Da 105
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本帖子会简单介绍如何读入并处理栅格数据。首先，我们会用到一个矢量数据，数据来自：https://gadm.org/download_country_v3.html，用到的是澳洲的地图。读取方法如下： # 获得数据的方法之一
# wget --no-check-certificate https://biogeo.ucdavis.edu/data/gadm3.6/gpkg/gadm36_AUS_gp
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2023-10-25 19:54:14
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qplot 的意思是quick plot，是属于ggplot2包的一部分，使用时需先加载包。qplot参数：qplot(x, y = NULL, ..., data, facets = NULL, margins = FALSE,
geom = "auto", xlim = c(NA, NA), ylim = c(NA, NA), log = "",
main = NULL
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2023-08-21 20:59:59
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R编程语言最早出现于1993年，而在2000年，它的第一个符合产品质量的版本R-1.0发布了。自那之后，R就成为了统计分析方面的业界标准，围绕着这门语言出现了大量的图形界面工具，以及可用于各种IDE及文本编辑器的包。Revolution Analytics是一家成立了9年的公司，他们为R语言提供商业级的支持服务。但就在最近，微软收购了这家公司，作为他们向大数据及机器学习领域迈出的第一步。这次收购的
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2024-01-11 09:14:09
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简介R语言中，自身已经带有了强大的数据处理、数据计算等方面的函数。 虽然，对于大规模的数据集合，处理过程可能会不如Python快，但是小规模的数据处理，R语言使用起来仍然会更方便。值得注意的是，为了执行效率，我们要尽量避免在R语言中，使用循环函数，而是要运用向量化的处理函数，即R语言Base基础包中，当然，记得apply家族的那么多函数以及不同的用法是一件麻烦的事情，于是类似plyr，dplyr，
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2024-07-05 05:27:30
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