R项目你应该阅读Using Projects - RStudio Support . R项目非常有用，但它们不用于保存R环境中的数据 . 它们由RStudio代码编辑器专用 . 他们做的最好的事情之一是在打开工作目录时自动将工作目录设置为项目目录 . 他们还记得您在RStudio中打开了哪些文件，以及其他与编辑相关的偏好等 . 绝对使用RProjects！R数据.RData 是R对象的文件 . 您
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2023-06-25 13:31:15
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火山图在SCI文章中经常出现，其实火山图就是个散点图，通过不同颜色的散点来表示基因的差异。通常横坐标用log2（fold change）表示，差异越大的基因分布在两端，纵坐标用-log10（pvalue）表示，T检验显著性P值的负对数。通常差异倍数越大的基因T检验越显著，所以往往关注左上角和右上角的值。 今天我们通过R来绘制火山图，先导入我们的数据和R包library(ggplot2)
libra
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2023-07-04 20:03:19
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001\log1p()函数 = log(1 + number); 甚至当number值接近于0时也能准确的计算出结果。 log(10)
log1p(9) ## 相当于log(1 + 9)
log(1)
log1p(0) ## 相当于log(1 + 0)
log1p(1.718281828459) ## 相当于log(1 + 1.718281828459)
l
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2023-05-24 16:31:00
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R语言作为专门的数据处理工具，在某些方面比通用的编程语言要更方便。对于变量的灵活保存与加载，就是R语言的一大特色。用R可以将数据保存为.RData格式的文件，不仅文件更小，而且能够直接加载使用。在RStudio的右上角显示当前变量的区域，有一个保存按钮：点击后，会将当前环境的所有变量以及变量的值进行保存。保存后，我们会在工作目录找到一个后缀为.RData的文件。该类文件双击运行后，可以直接加载为R
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2023-06-16 19:54:45
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R语言 数据类型在使用任何编程语言进行编程时，我们需要使用各种变量来存储各种信息。 变量只是保留值的存储位置。 这意味着，当创建一个变量，必须在内存中保留一些空间来存储它们。
可能想存储各种数据类型的信息，如字符，宽字符，整数，浮点，双浮点，布尔等。基于变量的数据类型，操作系统分配内存并决定什么可以存储在保留内存中。
变量分配有R对象，R对象的数据类型变为变量的数据类型。尽管有很多类型的R对象，但
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2023-06-25 13:31:29
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自己整理编写的逻辑回归模板，作为学习笔记记录分享。数据集用的是14个自变量Xi，一个因变量Y的australian数据集。1. 测试集和训练集3、7分组australian <- read.csv("australian.csv",as.is = T,sep=",",header=TRUE)
#读取行数
N = length(australian$Y)
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2023-09-15 17:33:51
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学习R语言的数据读取和整理（参照数据《数据分析：R语言实战》
library(MASS)#载入package MASSdata(package="MASS") #查看MASS中的数据集data(SP500,package="MASS") #载入MASS中的SP500数据集data(SP500) #简化写法getwd() #返回当前工作目录setwd("d
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2015-07-01 21:53:00
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R中的帮助函数函数功能help.start()打开帮助文档首页help(“foo”)或?foo查看函数foo的帮助（引号可以省略）help.search(“foo”)或??foo以foo为关键词搜索本地帮助文档example(“foo”)函数foo的使用示例（引号可以省略）RSiteSearch(“foo”)以foo为关键词搜索在线文档和邮件列表存档apropos(“foo”, mode=“fun
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2023-08-31 16:07:20
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1.R数据的保存与加载可通过save()函数保存为.Rdata文件，通过load()函数将数据加载到R中。1. > a <- 1:10
2. > save(a,file='d://data//dumData.Rdata')
3. > rm(a) #将对象a从R中删除
4. > load('d://data//dumData.Rdata')
5. &
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2023-07-14 11:13:05
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①对于plot或者xyplot，例如：png(file = "myplot.png", bg = "transparent") #创建画布
plot(1:10) #画图
rect(1, 5, 3, 7, col = "white")
dev.off() #关闭画布各种图片格式：bmp(filename = "Rplot%03d.bmp",
width = 480,
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2023-07-09 17:05:22
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# 科普文章：如何使用R语言对数据进行去log操作
## 引言
在数据分析领域，常常会遇到处理对数变换后的数据。对数变换可以将偏态分布的数据转化为近似正态分布，以便更好地进行统计分析和建模。而在R语言中，对数据进行去log操作也是十分简单的。本篇文章将介绍如何使用R语言对数据进行去log操作，并通过代码示例演示具体步骤。
## 流程图
```mermaid
flowchart TD;
原创
2024-04-07 03:44:00
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# R语言中的Log变换
## 一、什么是Log变换？
Log变换是一种常用的数据预处理方法，通常用于处理数据的正态化，尤其是当数据存在显著的正偏态时。通过对数据进行对数变换，我们可以减少其变异性，并且有助于线性回归等统计分析的合理性。
## 二、实现Log变换的流程
下面是实现Log变换的一般步骤：
| 步骤 | 内容
原创
2024-08-05 08:06:14
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## R语言中log的实现流程
### 步骤一：了解log函数的功能和用法
在开始实现log函数之前，我们首先需要明确log函数的功能和用法。在R语言中，log函数用于计算一个数的自然对数。其语法如下：
```R
log(x, base)
```
其中，参数x是需要计算自然对数的数值，参数base是可选的，用于指定对数的底数。如果不指定base参数，则默认为自然对数。
### 步骤二：使
原创
2023-08-31 10:59:42
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# R语言log封装的实现步骤
在数据分析和机器学习中，记录日志是一项非常重要的工作。R语言提供了许多工具来帮助我们实现日志封装。接下来，我将详细介绍如何在R中实现日志封装，并附上各个步骤的详细说明和代码示例。
## 实现流程
我们可以将整个流程分成几个主要步骤，如下表所示：
| 步骤 | 描述 |
|------|----------------
原创
2024-09-07 05:24:48
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本文我们对逻辑回归和样条曲线进行介绍。logistic回归基于以下假设：给定协变量x，Y具有伯努利分布， 目的是估计参数β。回想一下，针对该概率使用该函数是 （对数）似然函数对数似然 其中。数值方法基于（数值）下降梯度来计算似然函数的 最大值。对数似然（负）是以下函数negLogLik = function(beta){
-sum(-y*log(1 + e
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2023-08-21 11:12:41
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log简介golang内置了log包，实现简单的日志服务。通过调用log包的函数，可以实现简单的日志打印功能。log使用log包中有3个系列的日志打印函数，分别print系列、panic系列、fatal系列。函数系列作用print单纯打印日志panic打印日志，抛出panic异常fatal打印日志，强制结束程序(os.Exit(1))，defer函数不会执行实例package main
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2024-02-26 12:20:07
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R语言通过工作目录来对文件读取和写入，若一个文件不在工作目录，则必须给出其路径可使用命令getwd()（获得工作目录）来找到目录；使用命令setwd(“F:/2glkx”)将当前工作路径改为：F:/2glkxR语言中目录分隔符用“/ ” 或“\”表示一 、R语言数据存储用write.table()或save()在文件中写入一个对象,一般是写一个数据框,也可以是其他类型对象以数据框为例说明：#建立用
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2023-06-21 20:42:47
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数据探索一、实验说明1. 环境登录无需密码自动登录，系统用户名shiyanlou，密码shiyanlou 2. 环境介绍本实验环境采用带桌面的Ubuntu Linux环境，实验中会用到程序：1. LX终端（LXTerminal）: Linux命令行终端，打开后会进入Bash环境，可以使用Linux命令2. GVim：非常好用的编辑器，最简单的用法可以参考课程[Vim编辑器](http:/
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2024-06-13 21:52:40
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R包export可以轻松的将R绘制的图和统计表输出到 Microsoft Office (Word、PowerPoint和Excel)、HTML和Latex中，其质量可以直接用于发表。你和PPT高手之间，就只差一个iSlideExcel改变了你的基因名，30% 相关Nature文章受影响，NCBI也受波及特点可以用命令将交互式R图或ggplot2、Lattice或base R图保存到Microso
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2023-12-30 21:01:35
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1. 文本格式和CSV数据读取和保存读取.txtoptions(stringsAsFactors = F)
immune <- read.table("data/pan_cancer_immune.txt", sep="\t",
header=T, check.names=F) #单个列表形式
group_list1 = read.table("data/GSE12_sampl
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2023-05-22 10:06:45
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