欢迎关注”生信修炼手册”!ncRNA-eQTL数据库专注于研究不同肿瘤中调控ncRNA表达量的eQTL, 通
原创
2022-09-05 13:31:56
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欢迎关注”生信修炼手册”!Rfam是一个RNA分类信息的数据库，根据多序列比对结果，二级结构的一致性，协方差
原创
2022-06-21 09:09:06
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软件 下载数据库 确定待查询的核苷酸序列或基因组的大小，作为后续命令的参数 使用cmscan程序注释基因组的ncRNAs 结果解释 my-genome.cmscan my-genome.tblout 结果解析 Reference 生信宝典，学的...
原创
2023-07-19 13:16:45
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1. ncRNA 非编码RNA(Non-coding RNA, ncRNA) 包括rRNA，tRNA，snRNA，snoRNA 和microRNA 等不编码蛋白质的RNA，它们转录后直接在RNA 水平上就能行使各自的生物学功能，并不需要翻译成蛋白质。 2. 软件 tRNA注释 一般用tRNAscan
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2022-09-01 09:35:37
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Rfam是用来鉴定non-coding RNAs的数据库，常用于注
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2023-07-27 12:24:00
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欢迎关注”生信修炼手册”!神经系统疾病是一类由于中枢神经系统或者周围神经系统受到影响从而引起的疾病，包括脑血
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2022-06-21 05:59:19
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数据库历史埃德加·弗兰克·科德埃德加·弗兰克·科德（英文:Edgar Frank “Ted” Codd）是一位英国计算机科学家。他为关系型数据库理论做出了奠基性的贡献。他在IBM工作期间，首创了关系模型理论。他一生中为计算机科学做出了很多有价值的贡献，而关系模型，作为一个在数据库管理方面非常具有影响力的基础理论，仍然被认为是他最引人瞩目的成就。1981年，科德因在关系型数据库方面的贡献获得了图灵奖
欢迎关注”生信修炼手册”!随着科学研究的不断进步，科学家发现不编码蛋白的ncRNA与很多疾病的发生发展密切相
原创
2022-06-21 05:59:26
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摘要 RNA-蛋白质复合物在介导重要的基本细胞过程（例如运输和定位）中是必不可少的。特别是，ncRNA-蛋白质相互作用在mRNA定位，mRNA稳定化，聚腺苷酸化，剪接和翻译等转录后基因调控中发挥重要作用。解决RNA-蛋白质相互作用预测问题的实验方法仍然是昂贵和耗时的。在这里，作者提出RPI-Pred
（RNA-蛋白质互做预测器），一种基于支
原创
2021-03-25 08:55:33
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ncRNA-eQTL数据库专注于研究不同肿瘤中调控ncRNA表达量的eQTL, 通过TCGA数据库获取不同肿瘤中的SNP分型信息，以及lncRNA和miRNA的表达量，然后通过eQTL分析将二者结合起来。除了传统意义上的cis-eQTL和trans-eQTL外，该数据库还从以下两个方面进行了创新将eQTL和生存分析相结合，以SNP位点的不同分型结果为分类因素，进行生存分析，筛选生存相关的SNP位点
欢迎关注”生信修炼手册”!circRNA是一类新发现的ncRNA, 和线性的pre-mRNA相比，缺少了5’
原创
2022-06-21 06:02:04
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1、什么是转录组测序？转录组广义上指在某一生理条件下，细胞内所有转录组产物的集合，包括：mRNA、ncRNA、rRNA等；狭义上指所有mRNA的集合。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，主要包括mRNA和ncRNA。转录组具有时间特异性、组织特异性、空间特异性等特点。2、无参转录组和有参转录组的区别？如果所研究的物种有组装注释质量较好基因组序列，且和该基因
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2024-01-28 07:55:12
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理解 RNA 分子的结构和功能一直是分子生物学和制药行业的核心研究方向。RNA，尤其是非编码 RNA (ncRNA)，能够折叠成特定结构，并在基因调控 (如转录和翻译)、催化、生物信号传导、应激反应等多种细胞过程中发挥重要作用。
随着高通量测序技术的快速发展，RNA 序列数据呈指数级增长，但已知序列与实验解析 RNA 结构之间的差距却在不断扩大。因此，仅基于 RNA 原始序列解析其原子结构变得越来
# 非编码RNA的测序数据分析
## 引言
随着基因组学的迅速发展，非编码RNA（ncRNA）的研究逐渐受到重视。非编码RNA是一类不编码蛋白质的RNA分子，但它们在基因表达调控、细胞分化和其他多个生物过程中发挥着关键作用。本文将探讨如何分析非编码RNA的测序数据，包括数据预处理、基因表达分析和可视化示例。
## 非编码RNA的种类
非编码RNA可以分为几大类，包括但不限于：
- **微
LncRNA自从发现至今，相关研究如火如荼。欧易生物也给很多科研工作者提供lncRNA测序和芯片检测的服务工作。但检测后，很多老师反馈，lncRNA序列等相关信息查询非常困难，忆秋就此整理一套lncRNA常用、好用的数据库，供各位看官参考。1.LNCipedia该数据库针对人进行lncRNA数据的收集、整理，共收入111,685条人类有注释的lncRNA转录本，同时还包含ncRNA转录本在基因组位
转录组广义上指在某一生理条件下，细胞内所有转录组产物的集合，包括：mRNA、ncRNA、rRNA等；狭义上指所有mRNA的集合。因为测的是所有的RNA，因此数据量庞大。以植物为例，基本上每个物种的转录组测出来的基因数目都有上万条。而我们进行RNA-seq的主要目的就是寻找引起处理和对照之间表型差异的关键基因，也就是要通过一些生物信息的分析，从上万条基因中找出
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2023-12-06 23:25:24
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