生信技能树R语言部分学习笔记dir() #列出工作目录下的文件
ls() #列出环境中的变量1. 认识csv格式csv打开方式：
(1)默认excel
(2)记事本打开
(3)sublime（适用大文件）
(4)R语言读取：读进R语言之后的数据是一个数据框，可赋值，变量名与文件名无必然联系，对数据框进行的修改不会同步到表格文件。2. 认识分隔符常见分隔符：
逗号，
空格
制表符（\t）C
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2023-06-21 22:56:58
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文章目录把数据读入R语言Excelcsvtxt其他写出文件（从R语言另存为其他格式） 本文面向R语言初学者，尤其是生物医药领域的初学者，大佬勿喷~在之前的推文中，我们用两个视频详细介绍了R语言、rtools、Rstudio以及R包的安装，解决新手最先碰到的两大难题！接下来大家就面临把数据读入R语言、把数据另存为其他格式的问题！大家在日常生活中遇到的最多的数据应该还是Excel数据，但是对于R语言
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2023-06-20 15:05:40
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R获取数据的三种途径利用键盘来读取数据。通过读取存储在外部文件上的数据。通过访问数据库系统来获取数据。一、键盘读取数据首先根据自己的需求输入数据，使用data.frame()函数将其构建为数据框。 如果想要构建一个不包含数据的数据框，并且想要向其中填写自己需要的内容的话，可以使用edit()函数： 为每一列数据框的数据定义其类型，包括character(),numeric()等等，随后是有edit
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2023-06-07 17:44:43
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文章目录一、数据读入1.直接输入数据2.读R包中的数据3.从外部文件读入数据3.1 读入文本文件(TXT)3.2读入Excel格式文件3.3读入其它格式文件（SAS数据、SPSS数据、Stata数据等）二、写入数据三、数据预处理1.创建新变量2.变量重编码3.变量重命名4.变量类型的转换5.日期变量的转换四、缺失数据处理1.缺失数据的探索与检验2.缺失数据的处理五、数据集的合并与拆分1.数据框的
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2023-07-07 14:47:35
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本次课程，我们学习R中用于读取表格数据的reader包的一些基本功能。有关readr的详细介绍，可以参考*《Mastering Software Development in R》*的1.3节。读取在本课程中，我们将使用美国邮政编码上的一个小型数据集。 该表包含有关美国人口普查局发布的城市邮政编码的百分比的信息。首先，我们使用library()函数载入readr包。> library(rea
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2023-07-07 14:50:54
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1）R语言读取csv，txt数据#读取txt文件，header文件首行是否包含变量名，sep表示文件中的分隔符，col.names列名称
col_names<-c("col1","col2","col3")
data_txt<-read.table("traindata.txt",header=TRUE,sep="\t",col.names =col_names)
#读取csv文件
d
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2023-06-29 17:46:48
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二进制文件是包含仅以位和字节(0和1)的形式存储的信息的文件。它们不是人类可读的，因为它中的字节转换为包含许多其他不可打印字符的字符和符号。尝试使用任何文本编辑器读取二进制文件将显示如Ø和ð的字符。二进制文件必须由特定程序读取才能使用。例如，Microsoft Word程序的二进制文件只能通过Word程序读取到人类可读的形式。这表示，除了人类可读的文本之外，还有更多的信息，例如字符和页码等的格式化
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2023-09-28 09:09:33
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刚开始使用spark-sql，首先看了一部分的源码。然后开始着手程序的编写。在spark中使用jdbc：在 Spark-env.sh 文件中加入:export SPARK_CLASSPATH=任务提交时加入:spark-submit –master spark://master:7077 –jars ojdbc16.jar
一、
val rdd = sqlContext.read.format(“
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2023-10-06 16:40:06
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0 引言 使用R语言、Python等进行数据处理的第一步就是要导入数据（也可以使用UCI数据集），下文主要根据R语言的帮助文档来介绍外部文件数据的导入方法和注意事项。下面先附上一些指令。1 格式read.table read.table(file, header = FALSE, sep ="", quote = "\"'",dec = ".", skip = 0,st
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2023-10-03 08:41:19
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本节书摘来异步社区《量化金融R语言初级教程》一书中的第1章，第1.1节，作者： 【匈牙利】Gergely Daróczi（盖尔盖伊） , 等 译者： 高蓉 , 李茂 责编： 胡俊英，1.1 使用时间序列数据用于存储时间序列数据的基本R类有vector、matrix、data.frame以及ts对象。但是，它们可以存储在这些对象中的数据类型相当有限。并且，这些表达方式提供的方法范围也很有限。不过幸运
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2024-07-25 18:51:07
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简述令人惊讶的是，网上的教程关于r语言处理excel数据的都是在说如何读。。下面以用xlsx这个包为例安装这个包，并读取数据【两行命令】R语言读取excel数据操作数据其实，导入进来之后，到R语言的环境中，就会转为data.frame的格式。所以，我们就只需要安装data.frame的方式来操作就好了。假设a是导入进来的变量导入方法为：library(xlsx)
a = read.xlsx('D:
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2023-08-30 20:06:09
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作为非程序猿的各位同志们，可能最擅长的数据整理软件或者统计软件就是——嗯，没有错，它就是集万千宠爱于一身的E~~~~X~~~~O。 咳咳咳，好了。隆重推出我们的主角——Excel 事实上，Excel是个super强大的软件。基本上用它已经能完成大量的统计分析了。 For example 各类数理统计 线性规划（LINGO表示欲哭无泪，你丫的抢我饭碗）。 当然，很久很久之前有这门本神书：
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2023-09-06 16:07:08
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作者：黄天元，
本帖子会简单介绍如何读入并处理栅格数据。首先，我们会用到一个矢量数据，数据来自：https://gadm.org/download_country_v3.html，用到的是澳洲的地图。读取方法如下： # 获得数据的方法之一
# wget --no-check-certificate https://biogeo.ucdavis.edu/data/gadm3.6/gpk
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2023-09-14 16:07:52
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在公司做大数据开发已经四五年了，因此也积累了一些心得体会，便趁着这次机会大体描述下。 首先：数据开发的前提肯定是需要数据的，而数据从哪里来，大部分的数据都存储在Oracle中，而spark的计算 数据来源基本上都是hdfs。虽然oracle也可以与spark进行直接交互，但是如果oracle的表的数据量高达千万、亿 级别，每次的spark的查询都会对oracle数据库产生极大的影响，因
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2023-11-24 13:35:20
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Flink CDC Oracle 完整踩坑指南1. flink-cdc同步oracle表的增量数据试用环境：**Oracle：**11.2.0.4.0（RAC 部署）**Flink：**1.12.0通过 Flink 集群方式部署使用。完整代码实现：package com.nari.cdc.job;
/**
* 同步oracle指定表 发送到kafka
*
* @author gym
*
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2024-02-04 02:13:36
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[甘特图]
```mermaid
gantt
dateFormat YYYY-MM-DD
title R语言读取txt数据流程
section 整理数据
准备txt数据 :active, a1, 2022-01-01, 1d
安装R语言和RStudio :active, a2, after a1, 1d
导入数据 :active, a3
原创
2024-01-29 03:40:12
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## R语言读取MAT数据的步骤
在R语言中，要读取MAT文件，需要使用到matlab包的函数。下面是实现这一步骤的详细流程和代码示例。
### 流程图
```mermaid
journey
title 读取MAT数据的流程
section 步骤1：安装和加载matlab包
section 步骤2：读取MAT文件
section 步骤3：查看MAT文件中的数据
原创
2024-01-04 08:12:48
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# 用R语言读取CSV数据
CSV（逗号分隔值）是一种常用的文件格式，用于存储和传输表格数据。在数据分析和统计领域中，我们经常需要使用R语言来读取和处理CSV文件。本文将介绍如何使用R语言读取和处理CSV数据，并提供相关的代码示例。
## 1. CSV文件的结构
CSV文件由多行组成，每行代表表格中的一行数据。每一行数据由逗号或其他特定字符分隔成多个字段。通常，第一行包含字段的名称，后面的行
原创
2023-08-28 07:16:40
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# R语言读取GEO数据教程
## 1. 简介
在生物信息学领域，GEO（Gene Expression Omnibus）数据库是一个重要的公共数据库，用于存储和共享基因表达数据。读取GEO数据是生物信息学分析的基础步骤之一。本教程将指导你如何使用R语言读取GEO数据。
## 2. 整体流程
下面是读取GEO数据的整体步骤：
| 步骤 | 描述 |
| --- | --- |
| 步骤1 |
原创
2024-02-01 10:10:03
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R语言在读取数据时出现问题，通常会导致数据处理的困难。这里我将分享解决“R语言读取不了数据”的问题的过程，帮助读者们更高效地定位和解决问题。
## 环境准备
在开始之前，我们需要确认R语言及其相关工具的兼容性。确保你的R环境和数据格式是匹配的，这样才能顺利读取数据。
```bash
# 在Ubuntu上安装R语言
sudo apt-get update
sudo apt-get instal
