这里有很多非常不错的R包和工具. 该想法来自于awesome-machine-learning.这里是包的导航清单，看起来更方便 >>>导航清单通过这些翻译了解这些工具包，以后干活也就方便多了。不过翻译这个东西的确要靠耐心，翻译，编辑花费了至少一周的空余时间。在编辑本文的过程中，惊喜的发现Awesome系列的其他资源：地址在github：1.DotNet 资源大全中文版
数量性状基因座作图原理与步骤经典的数量遗传分析方法 ->只能分析控制数量性状表现的众多基因的综合遗传效应,无法准确鉴别基因的数目、单个基因在染色体上的位置和遗传效应(1)数量性状基因座(QTL)Quantitative trait loci: QTL 数量性状位点(基因座)所谓QTL是指通过连锁分析来确定位于遗传标记附近的染色体区域中的某些可以确定其位置、数目与效应的控制数量性状的基因.(2
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2024-02-26 19:06:21
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在进化重测序实验（E&R）中，在可控环境下将人工选择持续施加给实验生物群体，并且通过基因组测序比较实验前后等位基因频率变化，以此来识别和选择相关的基因位点。很多实验参数能够影响识别能力，比如群体数量、选择压力大小、实验重复数、实验持续时间长短等。本研究基于模拟数据来探讨在小群体短期高强度的选择压力下，QTL自身相关特性会怎样影响实验识别选择位点能力。这些QTL位点相关的特征包括：影响某一性
原创
2020-12-29 15:08:23
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分享一则报告：用于遗传标记的连锁作图，核心内容概括如下：遗传改良需求全球食品生产需求推动了对作物遗传改良的进展，其中快速鉴定可用于作物育种的遗传基因/标记是关键一步。数量性状的遗传控制作物中大多数具有生物学和经济意义的性状是数量性状，表现为连续变异，受多基因控制，识别这些性状背后的基因较为困难。分子标记技术分子标记技术的发展重新激发了遗传作图的兴趣，特别是RFLP（限制性片段长度多态性）作为首个D
补充基本命令函数> head(data,n=5) #查看data的前五行数据> dim(data) #查看data的行列数> class(data) #查看data类型[1] "data.frame"> mode(data) #查看data类型，返回为list，略有不一[1] "list"> typeof(data)#查看data类型，返回为list，略有不一
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2023-10-30 21:29:07
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1 确保基因型，表型，协变量的样本名完全一致： 比如我的基因型和表型样本名如下所示： 但我的协变量样本名如下所示： 别问为什么协变量样本名由-变为., 问就是R的锅 ...
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2021-08-13 10:56:00
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long long ago，小野记录了关于重测序基因定位和GWAS相关的笔记。打开古老的文件夹，发现有些东西依然不过时，零零散散，随意发布。 QTL定位策略： 群体类型：作图群体，自然群体 选材策略：全群个体分析，选择基因型分析，混合分组分析 优点：适合稀有基因研究；群体可控，目的性和结果预期性强
原创
2024-06-23 12:50:32
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分享一则来自埃及阿斯尤特大学农学院遗传学系的报告，主题为：数量性状位点（QTL）分析及其在植物育种中的应用。 这篇报告的主要内容是关于
跑以下命令时报错： QTLtools cis --vcf file.vcf.gz --bed file.bed.gz --cov covariate.txt --permute 10000 --grp-best --window 100000 --out permutations.txt 其中，纳入 ...
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2021-08-13 16:26:00
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# 利用R语言进行QTL分析与作图
数量性状位点（Quantitative Trait Loci，简称QTL）分析是一种用于研究基因与复杂数量性状之间关系的统计方法。在遗传学研究中，QTL分析能够帮助我们识别影响特定性状的基因区域。本文将介绍如何使用R语言进行QTL分析，并展示如何使用R语言代码进行作图。
## 准备工作
在开始之前，请确保您已经安装了R语言环境以及必要的包。对于QTL分析，
原创
2024-07-21 10:16:47
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QTLQTL是一个访问SQL数据库的C++库，目前支持MySQL和SQLite。QTL是一个轻量级的库，只由头文件组成，不需要单独编译安装。QTL是对数据库原生客户端接口的薄封装，能提供友好使用方式的同时拥有接近于使用原生接口的性能。 使用QTL需要支持C++11的编译器。使用方式打开数据库qtl::mysql::database db;
db.open("localhost", "root",
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2024-09-30 14:26:24
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综述：Genomic Selection in the Era of Next Generation Sequencing for Complex Traits in Plant Breeding 要点： MAS仅对数量较少的主效QTL有效，而GS适用于大量微效QTL控制的复杂数量性状。GS根据分布
原创
2022-09-01 11:14:13
474阅读
QT开发（二十五）——QT模板库一、QTL模板库简介QT模板库（QT Template Library 简称QTL）是一套提供对象容器的模板。QTL提供了对象的链表、对象的矢量（动态数组）、从一个类型到另一个类型的映射（或称为字典）和相关的迭代器和算法。容器是包含和管理其它对象的一个对象，并且提供迭代器对被包含的对象进行访问。1、QT容器类简介 容器是
原创
精选
2016-11-15 21:22:43
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QT开发（二十五）——QT模板库一、QTL模板库简介QT模板库（QT Template Library 简称QTL）是一套提供对象容器的模板。QTL提供了对象的链表、对象的矢量（动态数组）、从一个类型到另一个类型的映射（或称为字典）和相关的迭代器和算法。容器是包含和管理其它对象的一个对象，并且提供迭代器对被包含的对象进行访问。1、QT容器类简介 容器是
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2024-05-06 11:12:31
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首先QTL是数量性状位点，比如身高是一个数量性状，其对应的控制基因的位点就是一个数量性状位点，而
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2023-11-06 14:07:02
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3，数据集的组织和存储方式应便于重新分析。5，使用考虑空间趋势的混合模型增加了显着QTL的数量，这可能是由于性状的狭
原创
2024-09-14 14:06:44
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--sql修改字段长度的语法：ALTER TABLE 表名 MODIFY 字段名 字段类型;--sql修改字段长度的示例代码：ALTER TABLE qtline MODIFY qtl_bidernote VARCHAR(4000);--标准SQL，对任何数据库都适用：ALTER TABLE fzr...
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2015-05-07 09:52:00
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QBuffer为Qtl里面的缓冲区类缓冲区的本质就是一段连续的存储空间在Qt中QBuffer可以看为一个特殊的IO设备文件辅助类（QDataStream ，QTextStream）可以直接作用于缓冲区类#include <QBuffer>#include <QCoreApplication>#include <QDataStream>#include <QDebug>int main(int argc, char *argv[]){
原创
2021-06-17 10:20:17
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GWAS和GS分析中，都有一个假定：假定至少有一个SNP标记与所控制性状的QTL（基因）处于连锁不平衡状态（LD），那怎么满足这个条件呢，就需要覆盖全基因组的标记，需要计算群体LD的衰减距离，进而计算进行GWAS分析时所
原创
2022-02-16 17:13:21
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OSS 图片获取、缩略图/预览图获取 ?x-oss-process=image
提醒：上传的图片最大长宽必须在3万（单位应该是像素），超过三万的可以上传，但是显示会有问题，会报错，报错信息如下所示： OSS对象存储中图片的缩略图/预览图获取1、简单的原图、缩略图请求方式如下：/**
* @Author qtl
* @Description
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2023-07-04 02:52:22
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