本文主要是自己的在线代码笔记。在生物医学本体Ontology构建过程中,我使用Selenium定向爬取生物医学PubMed数据库的内容。 PubMed是一个免费的搜寻引擎,提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要。它的数据库来源为MEDLINE(生物医学数据库),其核心主题为医学,但亦包括其他
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2024-10-17 18:45:39
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之前用maxent进行中文分词,发现效果不是特别理想,所以又实验了下用CRF来进行中文分词。这里先简单介绍下什么是CRF(条件随机场):introduction
Conditional random fields (CRFs) are a probabilistic framework for labeling and segmenting structured data, such as seq
Acceptor splice site --- The boundary between the 3’ end of an intron and the 5’ end of the following exon. Also called 3’ sp
原创
2023-11-07 14:04:16
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Gene flow --- Gradual diffusion of genes from one population to another across a barrier. The barrier may be physical o
原创
2023-11-07 14:11:57
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CG (or CpG) island --- Any region of the genome containing an unusually high concentration of the dinucleotide sequence 5’-CG-3’. Ofte
原创
2023-11-07 14:12:12
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Microarray --- Miniaturized wafer (“chip”) made of glass, plastic, or silicon onto which a large number of different nucleic acids have been i
原创
2023-11-07 14:12:31
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Relative risk --- A comparison of the risk for a disease or trait in individuals who share a particular factor (such as genotype, an environmental ex
原创
2023-11-07 14:05:51
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Spectral karyotyping (SKY) --- A procedure that uses the fluorescence in situ hybridization (FISH) technique to stain each of the 24 human chro
原创
2023-11-07 14:11:35
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Pharmacodynamics --- The effects of a drug or its metabolites on physiological function and metabolic pathways.药效学:药物或其代
原创
2023-11-07 14:11:42
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Immunoglobulin gene superfamily --- A family of evolutionarily related genes composed of human leukocyte antigen (HLA) class I and class II
原创
2023-11-07 14:11:49
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Deformation syndrome --- A recognizable pattern of dysmorphic features caused by extrinsic factors that affect the fetus in utero.变形综合征:子宫
原创
2023-11-07 14:12:23
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# Python 在医学中的应用
## 引言
随着科技的不断进步,Python 逐渐成为医学研究和临床应用领域的重要工具。它以其简易的语法和丰富的库支持,帮助科研人员处理大量数据,进行生物信息学分析,以及机器学习模型的构建。本文将介绍 Python 在医学中的一些应用场景,并带有相关代码示例。
## Python 的主要应用场景
### 1. 数据分析
医学领域通常涉及大量的实验数据,P
# Python 相近词汇
Python 是一种高级编程语言,被广泛用于数据分析、机器学习、人工智能等领域。在学习 Python 这门语言时,我们经常会遇到一些相近词汇,这些词汇可能会让初学者感到困惑。本文将为大家介绍一些 Python 中常见的相近词汇,并举例说明它们之间的区别。
## 相近词汇
在 Python 中,有一些相近词汇容易让人混淆,比如 `list` 和 `tuple`、`d
原创
2024-07-10 05:59:36
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对于一个刚刚进入实验室的学生而言,尤其是本科可能还是临床专业的。对于科研这方面基本上就没有接触的情况下,在一进入实验室的时候可能都不知道要干嘛。这里,就根据笔者自己的经验来给刚刚进入实验室的小朋友们,分享一下我们在进入医学科研这个领域的时候,都需要有哪些技能。以下只代表自己的个人观点,要是有哪些遗漏的欢迎补充。我们在科研最后呈现的时候,其实都是通过文章来进行呈现的。所以其实我们需要具备的一切的技能
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2023-10-24 23:15:21
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### 使用Python进行医学数据分析的入门指南
在现代医学研究中,数据分析起着至关重要的作用。Python以其简单易学和强大的数据处理能力,成为医学数据分析中的热门语言。本文将带你了解如何从零开始实现“Python 语法 医学”,并逐步引导你掌握这一过程。
#### 整体流程
以下是实现“Python语法 医学”的总体步骤。
| 步骤 | 描述
# Python医学图像的实现流程
## 1. 简介
在医学领域,图像处理是非常重要的一项技术。Python作为一种简单易用的编程语言,也可以用于医学图像的处理和分析。本文将介绍如何使用Python进行医学图像的处理。
## 2. 实现步骤
下面是实现医学图像处理的一般步骤:
| 步骤 | 描述 |
| ---- | ---- |
| 1. 安装必要的库 | 确保已经安装了所需的Pyth
原创
2023-09-16 13:19:35
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# 如何实现一个基本的Python医学应用
在这个的数字化时代,医学应用程序在医疗行业中发挥着重要的作用。对于刚入行的小白来说,构建一个简单的Python医学应用需要几个步骤。本文将为您详细介绍流程、代码实现以及如何构建和部署这些步骤。
## 整体流程
我们将创建一个简单的应用,帮助用户输入病人的症状并返回可能的疾病。下面是实现这个应用的步骤:
| 步骤 | 任务描述
原创
2024-09-11 07:43:38
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今天给大家介绍一款交互式医学影像标注工具MD.ai,他的新颖之处在于一方面他是基于web模式的一款专业的医学影像标注工具,另一方面就是他是第一个创建的交互标注的工具,是一个多机构,多国专家可以联合标注的数据集标注工具。
我们知道在医学AI图像数据标注中,数据集标注的优劣,直接影响到机器训练的结果,数据标注一般都是由经验丰富的医师来进行标注,自从COV
整理了部分Python基础用法和应用代码,后续会继续完善。一、数据输入二、while循环2.1 简单实例 2.2 猜数字游戏2.3 九九乘法表 三、for循环3.1 简单实例3.2 for循环嵌套 四、continue和break4.1 continue实例代码 4.2 break实例代码 五、ran
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2023-11-10 22:39:52
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原标题:资料|400集Python基础全面讲解助力医学科研汪,人生苦短我用Python不知道你是否会有这样的烦恼文献看来几百条,方向灵感一点都没有想用公开的数据但是又找不到合适的数据预处理繁琐又耗时间并且分析也分析不对熬夜头秃,焦虑易胖我......到底该拿论文肿么办哇!!!不要急不要慌试试Python?。。。。。。。。。。。。。。。。。400集Python基础全面讲解+内附软件下载教程安装包和5
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2023-09-20 19:27:04
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