p值还是 FDR ?差异分析如何筛选显著性差异基因,p value, FDR 如何选经常有同学询问如何筛选差异的基因(蛋白)。已经计算了表达量和p value值,差异的基因(蛋白)太多了,如何筛选。其中最为关键的是需要对p value进行校正。基本概念:零假设:在随机条件下的分布。p值:在零假设下,观测到某一特定实验结果的概率称为p值。假阳性:得到了阳性结果,但这个阳性结果是假的。假阴性:得到了阴
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2023-09-18 15:02:22
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# 如何实现 Python 中的双样本 p 检验
在数据分析中,双样本 p 检验是一种用于比较两个独立样本均值差异的统计方法。它能帮助我们判断两组数据是否来自同一总体。接下来,我将指导你实现 Python 中的双样本 p 检验,确保你能理解整个过程。
## 操作流程
首先,我们需要明确实现这一功能的步骤。以下是整个过程的流程表:
| 步骤 | 描述
原创
2024-09-28 04:49:59
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假设检验 通常设定两个假设:零假设和备择假设,然后通过拒绝零假设,来接受备择假设,从而完成检验。p值 p值中p表示概率,指的是零假设若成立,得到测里样本情况的概率。基本上是探测到零假设极端情况的概率。单侧检验 p值在数据集的一侧,由备择假设决定具体在哪一侧。双侧检验 p值在数据的两侧的检验。z统计量与t统计量 当样本容里很小时,样本均值抽样分布不应该采用正态分布,而应采用t分布。z统计里服从正态分
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2024-01-02 13:03:57
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Two Sample t-test两样本t检验用于检验两个总体的均值是否相等。两总体都是未知的,且我们不想或不易测量出总体所有的个体,来求得总体均值。所以我们从总体中随机抽样得到样本。对两样本进行统计检验,来看两样本差异是否显著。案例若我们想知道两个不同物种的乌龟的平均重量是否相等。我们可以进行随机抽样选择部分乌龟来代表总体乌龟。由于存在误差,两个物种样本的平均重量是存在差异的。而我们可以通过tw
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2024-01-23 19:45:43
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在数据分析的过程中,双样本t检验是一个重要的统计工具,广泛应用于比较两个独立样本的均值差异是否显著。在本文中,我们将通过一些可视化的关系图和流程图,深入探讨如何使用Python实现双样本t检验,旨在为大家提供一个清晰的理解框架。
## 协议背景
双样本t检验(Two-Sample t-Test)用于比较两个组样本的平均值,特别当两个组的方差未知且不相等时,本检验尤为重要
本文通过一个实际案例介绍假设检验的一种类型:双独立样本检验。一、案例测试背景:两款布局不一样的手机键盘(A版本,B版本),想知道哪种键盘布局的用户体验更好。衡量目标:用户打错字的数量。数据采集:随机抽取实验者并将其分成2组,每组25人,A组使用键盘布局A,B组使用键盘布局B。让他们在30秒内打出标准的20个单词文字消息,然后记录打错字的数量。数据集说明:数据记录在CSV文件中,A列是使
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2023-12-18 14:11:47
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t检验是通过比较不同数据的均值,研究两组数据之间是否存在显著差异。p值是一组数据的均值(以及比这种数据更极端的数据的均值)在另一组数据的均值所代表的总体中出现的概率。当p值越小,说明两者差异越显著,因为这说明一组数据是另一组数据所代表的总体中的样本的可能越小(因为两者的均值差异)。接下来是我转自知乎上的一个通过一个例子来详尽的解析T检验及P值的文章,我看完颇有启发。关于T检验以及各种假设检验的操作
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2023-12-12 13:25:03
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曼-惠特尼U检验(Mann-Whitney检验)How the Mann-Whitney test worksMann-Whitney检验又叫做秩和检验,是比较没有配对的两个独立样本的非参数检验。思想是这样的:假定要检验两组数据之间有没有差异。首先,不管分组把所有数据排序。按照数值大小给定一个值叫做秩。最小的值秩为1,最大的为N(假定两个样本总共有N个观察值)。如果有相同的值,就得到相同的秩。相同
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2024-01-10 09:10:40
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# Python双样本t检验p值的理解
在科学研究和实验分析中,我们常常希望比较两个样本的均值,以确定它们之间是否存在显著差异。在这种情况下,双样本t检验是一种常见的统计方法。这篇文章将向你详细讲解双样本t检验的概念,p值的意义,以及如何使用Python进行相应的分析。
## 什么是双样本t检验
双样本t检验(Two-sample t-test)是一种假设检验方法,用于比较两个样本均值的差异
原创
2024-09-07 04:26:05
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一、简单介绍A/B测试A/B测试为同一个目标制定两个版本,一部分用户使用A版本,另一部分用户使用B版本,记录用户使用数据,比较各个版本对于改进目标的转化效果,选择更好的版本。二、数据集介绍有两种键盘的布局A版和B版,给随机抽取的用户A组和B组使用,这是独立的双样本。两组人数均为25人,记录各组实验者在规定时间内记录打错字的数量。三、描述统计分析#A/B测试
import numpy as np
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2023-10-16 17:06:00
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One Sample t-test单样本t检验用于检测一个总体的均值\(\mu\)是否等于某个特定值。通常该总体均值\(\mu\),未知不易测量,我们通过抽样得到样本均数\(\bar{X}\)来代表总体均数\(\mu\)。通常抽样存在一定误差,不太可能等于总体均数\(\mu\),所以我们需要关注样本均数\(\bar{X}\)与特定值之间的差异是否存在统计学意义。案例若我们想知道某地乌龟的平均重量是
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2023-10-15 22:57:39
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# 在Python中实现双样本T检验的完整指南
## 引言
双样本T检验用于比较两组数据的均值是否存在显著差异,这是统计学中常用的假设检验方法之一。在这篇文章中,我们将通过一个实际的示例,详细讲解如何在Python中实现双样本T检验。本文内容将分为几个步骤,并通过代码演示每一个环节的操作。
## 流程概述
在进行双样本T检验前,我们首先需要了解整个流程。下面是实现双样本T检验的主要步骤:
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一、简单介绍A/B测试A/B测试为同一个目标制定两个版本,一部分用户使用A版本,另一部分用户使用B版本,记录用户使用数据,比较各个版本对于改进目标的转化效果,选择更好的版本。二、数据集介绍有两种键盘的布局A版和B版,给随机抽取的用户A组和B组使用,这是独立的双样本。两组人数均为25人,记录各组实验者在规定时间内记录打错字的数量。 三、描述统计分析 #A/B测试
import nump
在论文中,总能看到类似于这种数据评价方法: 在找了一圈之后明白了这个是使用T分布来进行数据间的相关性分析,参照这里:https://zhuanlan.zhihu.com/p/29284854 那么什么是T检验呢: t检验是用t分布理论来推论差异发生的概率解决什么问题 从而比较两个平均数的差异是否显著公式以及参数含义 t检验分为单总体检验和双总体检验。单总体t检验是检验一个样本平均数与一个已知的总体
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2023-12-12 18:25:42
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One Sample t-test单样本t检验用于检测一个总体的均值\(\mu\)是否等于某个特定值。通常该总体均值\(\mu\),未知不易测量,我们通过抽样得到样本均数\(\bar{X}\)来代表总体均数\(\mu\)。通常抽样存在一定误差,不太可能等于总体均数\(\mu\),所以我们需要关注样本均数\(\bar{X}\)与特定值之间的差异是否存在统计学意义。案例若我们想知道某地乌龟的平均重量是
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2024-03-14 10:03:04
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IBM SPSS Statistics的比较平均值分析法属于参数型的检验法,是以已知总体分布的前提下,检验样本数据与总体数据的差异,其中包含了平均值、单样本T检验、独立样本T检验、配对样本T检验以及单因素ANOVA检验的分析方法。其中,单样本T检验、独立样本T检验、配对样本T检验都是运用T分布理论来分析差异发生的概率,从而比较两个平均数的差异是否显著的分析方法。那么,这三种T检验的分析方法有什么不
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2024-01-31 01:54:22
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双样本异方差t检验在 Python 中的应用
在数据分析过程中,我们常常需要比较两个独立样本的均值是否存在显著差异。双样本异方差t检验(也称为Welch's t-test)是用来处理两个样本方差不等的情况的一种统计检验方法。本文将深入探讨双样本异方差t检验在Python语言中的应用,包括适用场景、具体实现及实用指南。
### 适用场景分析
双样本异方差t检验适用于以下场景:
- **医学研究
我们都知道p值是用来说明数据间显著性差别的统计值,p值的由来以及计算方法可谓是非常有意思,所以在这里介绍给大家。 我们从一个经典的例子开始: 小明闲的蛋疼抛硬币玩,他连续抛出一枚硬币5次,并得到了(正 正 正 正 反)的结果,这时小明就想了:“这枚硬币的质量分布一定不均匀!否则我不会抛出4次正面!” &nb
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2024-02-05 07:16:55
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【推断统计】
1. 样本和总体
总体:目标事件的全体
样本:总体的一部分(总体的子集)
2. 推断统计:
用样本数据对总体进行归纳的统计过程
假定:样本对总体具有代表性
3. 假设检验:
两个假设:原假设+备择假设
原假设:表述为一个处理没有影响--(小概率事件)H0
备择假设:表述为该处理有影响 H1
4. 抽样误差:
样本和总体之间的差别(样本越少,样本和总体之间的差别越大)
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2023-08-10 14:56:46
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从清北男神母校学生的身高比较看两独立样本t检验~独立样本t检验用于检验两个独立样本是否来自具有相同均值的总体,即检验两个正态分布总体的均值是否相等。提出问题:北大、清华所有男生平均身高是否相等?1、抽样:比如北大、清华分别抽取100名男生。2、做出假设:假设北大、清华男生总体的平均身高相等(零假设)。用 分别代表北大、清华男生总体的平均身高,那么零假设可表示为
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2024-08-13 10:44:03
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