Description三核苷酸是组成DNA序列的基本片段。具体来说，核苷酸一共有4种，分别用’A’，’G’，’C’，’T’来表示。而三核苷酸就是由3个核苷酸排列而成的DNA片段...
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2019-04-18 19:50:00
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三核苷酸是组成DNA序列的基本片段。具体来说，核苷酸一共有4种，分别用’A’，’G’，’C’，’T’来表示。而三核苷酸就是由3个核苷酸排列而成的DNA片段。三核苷酸一共有64种，分别是’AAA’，’AAG’，…，’GGG’。给定一个长度为L的DNA序列，一共可以分辨出（L-2）个三核苷酸。...
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2018-01-20 16:53:00
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三核苷酸是组成DNA序列的基本片段。具体来说，核苷酸一共有4种，分别用’A’，’G’，’C’，’T’来表示。而三核苷酸就是由3个核苷酸排列而成的DNA片段。三核苷酸一共有64种，分别是’AAA’，’AAG’，…，’GGG’。给定一个长度为L的DNA序列，一共...
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2018-01-20 16:54:00
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在线序列转换的工具： Nucleotide Sequence Translation Protein Sequence Back-translation http://bio.lundberg.gu.se/edu/translat.html http://www.ebi.ac.uk/Tools/st
原创
2023-11-06 14:58:45
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定义主要指基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的 DNA 序列多态性。
在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。即：在不同个体的同一条染色体或同一位点的核苷酸序列中，绝大多数核苷酸序列一致而只有一个碱基不同的现象。首先来看看多态性（polymorphism）的英文解释Polymorphism*the quality or state of existing in or assum
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2023-06-26 17:10:21
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核苷及核苷酸是机体内的一种重要的内源物质，参与细胞的多种生命进程，如 DNA 和 RNA 合成，信号转导及代谢等。核苷及核苷酸类似物是人工合成的，经过一定化学修饰的物质，可以模拟机体内核苷及核苷酸，参与细胞调控，如阻断细胞分裂或病毒复制等。核苷及核苷酸类似物是治疗癌症及病毒感染的一类重要药物，另外在高尿酸血症、免疫抑制，神经及心脏保护方面也有一定的治疗效果。核苷及核苷酸类似物在细胞中发挥作用的机制
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2023-12-23 21:38:10
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# Python 根据人类基因组提取绝对位置核苷酸
## 一、流程图
下面是实现该功能的整个流程图：
```mermaid
classDiagram
class Developer {
- beginner: Developer
- experienced: Developer
}
class Beginner {
+ e
原创
2023-09-27 15:06:54
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variable sites informative sites nucleotide diversity 信息位点的定义：在两个及以上分类单元...
原创
2022-03-18 11:44:13
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叶绿体基因组的文章中通常会有一小部分内容是运用DnaSp软件来进行核苷酸多态性π分析，断断续续看了也好长时间了，今天终于重复出了结果，简单记录自...
原创
2022-03-09 10:42:40
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概念 双核苷酸由任意2个碱基组成 测试1 测试2 结果 AA AT AC TG
原创
2022-05-31 21:39:12
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今天推文的主要内容参考 链接 https://wurmlab.github.io/genomicscourse/2016-SIB/practic...
原创
2022-03-18 10:56:10
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# 如何使用Python对蛋白质序列进行氨基酸转换
## 简介
作为一个经验丰富的开发者，我将会指导你如何使用Python对蛋白质序列进行氨基酸转换。这是一个非常常见的任务，尤其在生物信息学领域中。我们将使用Python的BioPython库来完成这个任务。
## 流程图
```mermaid
flowchart TD
A(获取蛋白质序列) --> B(使用BioPython进行转换)
原创
2024-05-22 03:23:01
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整体步骤分为如下几步选择一个氨基酸将该氨基酸的分子条状结构显示出来根据该氨基酸分子条状结构与其他氨基酸之间形成的氢键确定其他氨基酸将其他氨基酸变成特殊颜色0.1 首先要安装pymol0.2 然后打开pymol，load进来你所要处理的结构文件前提是你本地已经下载好了你要处理的结构文件1.选择一个氨基酸在pymol最上面的工具栏勾中Display-> Sequence 然后就会看到你load进
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2023-10-09 15:14:21
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PyMOL可视化蛋白质写在前面的上次推文介绍了如何用多种方法批量快速下载高通量测序数据，主要介绍了Aspera的用法和axel用法。这里再额外提一句，Aspera的使用需要足够的学习，学会如何解决报错，如何解决网络协议问题。 这次我再介绍一个简单使用的软件——PyMOL的使用，昨天晚上，我的好朋友反馈给我说这个软件教程密密麻麻一堆，不知道如何下
在处理“Python布尔原酸夫”这一问题时，首先理解什么是布尔原酸夫以及它在实际应用中的影响至关重要。布尔原酸夫的主要挑战涉及到布尔对象的处理与优化，尤其是在计算复杂的逻辑关系时，性能往往成为制约程序效率的因素。
> **用户反馈：** “我们的代码在处理大量布尔逻辑时变得非常慢，希望能找到加速的解决方案。”
> **时间轴：**
> - **第一阶段**（2023年1月）：首次收到性能下
1. 目的：比较motif和一条长的氨基酸序列的相似性，其中motif长度比较短(4-30左右)，另一条序列长度较长(150-1500左右)。2. 思路：将整个motif看作一个移动单元，从长氨基酸序列的N端开始，向C端移动。在此之前规定motif和长序列对应位置上的氨基酸相似性评分规则，具体如下：假设aa1是motif上每个位置的氨基酸，aa2是长序列上每个位置的氨基酸。1. 当 aa1 ==
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2024-01-08 12:07:52
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Canny边缘检测方法被誉为边缘检测的最优方法。import cv2
import numpy as npimg = cv2.imread('handwriting.jpg', 0)
edges = cv2.Canny(img, 30, 70) # canny边缘检测
cv2.imshow('canny', np.hstack((img, edges)))
cv2.waitKey(0)cv
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2023-07-01 14:56:40
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# Python统计氨基酸序列
氨基酸是构成蛋白质的基础单位，而蛋白质在生物体内执行着众多重要的生理功能。为了深入认识生物体内的蛋白质，分析氨基酸序列的组成和分布是一个核心环节。在本文中，我们将介绍如何使用Python编程语言统计氨基酸序列，并且提供代码示例和简要的解释。
## 氨基酸序列的基本概念
氨基酸序列是通过苯丙氨酸、丙氨酸、赖氨酸等20种标准氨基酸链接而成的线性链。这些氨基酸通过肽
