%% step1: 清理运行环境 clc; clear; close all; %% step2: 读入数据 Iris = uiimport('iris.data'); Iris = cellfun(@(x) regexp(x,',','split'), Iris.iris,'UniformOutp ...
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2021-09-24 09:16:00
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K-means算法是最简单的一种聚类算法。算法的目的是使各个样本与所在类均值的误差平方和达到最小(这也是评价K-means算法最后聚类效果的评价标准)K-means聚类算法的一般步骤:初始化。输入基因表达矩阵作为对象集X,输入指定聚类类数N,并在X中随机选取N个对象作为初始聚类中心。设定迭代中止条件,比如最大循环次数或者聚类中心收敛误差容限。进行迭代。根据相似度准则将数据对象分配到最接近的聚类中心
上一篇博客中简单介绍了K均值聚类算法,在本篇博客中介绍一下关于谱聚类算法,简单谈一谈自己的心得。简单介绍一下谱聚类算法谱聚类算法建立在谱图理论基础上,与传统的聚类算法相比,它具有能在任意形状的样本空间上聚类且收敛于全局最优解的优点。该算法首先根据给定的样本数据集定义一个描述成对数据点相似度的亲合矩阵,并且计算矩阵的特征值和特征向量 , 然后选择合适 的特征向量聚类不同的数据点。谱聚类算法
文章目录1、谱聚类概览2、谱聚类构图3、拉普拉斯矩阵4、切图聚类4.1RatioCut4.2Ncut5、总结流程 1、谱聚类概览谱聚类演化于图论,后由于其表现出优秀的性能被广泛应用于聚类中,对比其他无监督聚类(如kmeans),spectral clustering的优点主要有以下:1.过程对数据结构并没有太多的假设要求,如kmeans则要求数据为凸集。
2.可以通过构造稀疏similarity
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2024-04-30 18:38:56
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谱聚类(spectral clustering)是广泛使用的聚类算法,比起传统的K-Means算法,谱聚类对数据分布的适应性更强,聚类效果也很优秀,同时聚类的计算量也小很多,更加难能可贵的是实现起来也不复杂。在处理实际的聚类问题时,个人认为谱聚类是应该首先考虑的几种算法之一。下面我们就对谱聚类的算法原理做一个总结。1. 谱聚类概述谱聚类是从图论中演化出来的算法,后来在聚类中得到了广泛的应用。它的主
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2024-03-18 19:21:17
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# 如何实现谱聚类算法的 Python 代码
谱聚类(Spectral Clustering)是一种基于图论的聚类算法,在许多应用中表现出色。它通过先在特征空间中构造一个相似度矩阵,然后对其进行特征分解,从而找到数据点的低维表示。本文将带你逐步实现谱聚类算法的 Python 代码。
## 流程步骤
为了便于理解,下面是实现谱聚类的主要步骤:
| 步骤 | 描述
小白入门谱聚类算法原理与实现小白入门谱聚类算法原理与实现1. 谱聚类是什么?2.谱聚类步骤2.1 谱聚类构图2.2 谱聚类切图2.2.1RatioCut2.2.2Ncut3谱聚类实现 小白入门谱聚类算法原理与实现文章结构主要分为下面三个部分 ①谱聚类是什么 ②谱聚类怎么进行聚类 ③谱聚类应用例子1. 谱聚类是什么?首先回顾一下聚类的概念:聚类:对大量未知标注的数据集,按数据的内在相似性将数据集划
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2023-08-24 13:17:21
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鸢尾花(Iris)数据集是一个经典的数据集
原创
2023-05-06 00:54:57
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谱聚类算法将数据集中的每个对象看作是图的顶点V,将顶点间的相似度量化作为相应顶点连接边E的权值,这样就得到一个基于相似度的无向加权图G(V, E),于是聚类问题就可以转化为图的划分问题。基于图论的最优划分准则就是使划分成的子图内部相似度最大,子图之间的相似度最小。虽然根据不同的准则函数及谱映射方法,谱聚类算法有着不同的具体实现方法,但是这些实现方法都可以归纳为下面三个主要步骤:1) 构建表示对象集
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2024-05-23 17:44:09
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谱聚类(spectral clustering)是广泛使用的聚类算法,比起传统的K-Means算法,谱聚类对数据分布的适应性更强,聚类效果也很优秀,同时聚类的计算量也小很多,更加难能可贵的是实现起来也不复杂。在处理实际的聚类问题时,个人认为谱聚类是应该首先考虑的几种算法之一。下面我们就对谱聚类的算法原理做一个总结。1. 谱聚类概述谱聚类是从图论中演化出来的算法,后来在聚类中得到了广泛的应用。它的主
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2024-04-02 18:05:05
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本文对其中的难懂的地方做一些备注 谱聚类(spectral clustering)是广泛使用的聚类算法,比起传统的K-Means算法,谱聚类对数据分布的适应性更强,聚类效果也很优秀,同时聚类的计算量也小很多,更加难能可贵的是实现起来也不复杂。在处理实际的聚类问题时,个人认为谱聚类是应该首先考虑的几种算法之一。下面我们就对谱聚类的算法原理做一个总结。1. 谱聚类概述 谱聚类是从图论中演化出来的
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2024-02-29 10:49:55
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如果说 K-means 和 GMM 这些聚类的方法是古代流行的算法的话,那么这次要讲的 Spectral Clustering 就可以算是现代流行的算法了,中文通常称为“谱聚类”。由于使用的矩阵的细微差别,谱聚类实际上可以说是一“类”算法。Spectral Clustering 和传统的聚类方法(例如 K-means)比起来有不少优点:和 K-me
一,谱聚类原理谱聚类算法原理可以参考如下链接。这个视频推导出了拉普拉斯矩阵,但没有更新后续优化问题。可以搭配视频笔记食用:详细及全面讲解参考:谱聚类是从图论中演化出来的算法,后来在聚类中得到了广泛的应用。1,构图谱聚类过程主要有两步,第一步是构图,将采样点数据构造成一张网图,表示为G(V,E),V表示图中的点,E表示点与点之间的边,如下图: 图1 谱聚类构图(来源wiki)在
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2024-01-08 19:42:18
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本文我们继续介绍聚类家族中的另一个成员——谱聚类(Spectral clustering)。谱聚类最早来源于图论,后来由于性能优异,被广泛应用于聚类中。相比K-Means等聚类算法,谱聚类对数据分布的适应性更强(如kmeans要求数据为凸集,谱聚类对数据结构并没有太多的假设要求),聚类效果也很优秀,同时聚类的计算量也小很多(意味着更快的速度),也无需像GMM一样对数据的概率分布做假设,更加难能可贵
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2024-05-24 16:39:22
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谱聚类谱聚类是一种基于图论的聚类方法,通过对样本数据的拉普拉斯矩阵的特征向量进行聚类,从而达到对样本数据聚类的母的。谱聚类可以理解为将高维空间的数据映射到低维,然后在低维空间用其它聚类算法(如KMeans,c-均值聚类)进行聚类。相似图构造相似图,用来刻画数据点局部的近邻关系。顶点对应一个样本点。k-近邻图 如果是的近邻,那么和之间存在一条边。由于每个样本点的近邻情况不完全相同,因此这种方法构造的
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2024-03-17 10:05:48
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谱聚类算法是目前最流行的聚类算法之一,其性能及适用场景优于传统的聚类算法如k-均值算法,本文对谱聚类算法进行了详细总结,内容主要参考论文《A Tutorial on Spectral Clustering》,下载链接:https://github.com/zhangleiszu/machineLearning,若对谱聚类算法有不理解的地方,欢迎交流。目录1. 谱聚类模型的优化思想2. 图的表示方法
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2023-09-06 12:28:47
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谱聚类算法建立在谱图理论基础上,与传统的聚类算法相比,它具有能在任意形状的样本空间上聚类且收敛于全局最优解的优点。该算法首先根据给定的样本数据集定义一个描述成对数据点相似度的亲合矩阵,并且计算矩阵的特征值和特征向量 , 然后选择合适 的特征向量聚类不同的数据点。谱聚类算法最初用于计算机视觉 、VLS I 设计等领域, 最近才开始用于机器学习中,并迅速成为国际上机器学习领域的研究
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2024-05-21 11:28:11
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文章目录简介1. 准备工作1.1 邻接矩阵1.2 度矩阵1.3 拉普拉斯矩阵1.3.1 非归一化拉普拉斯矩阵1.3.2 归一化拉普拉斯矩阵1.4 相似图1.4.1
ϵ
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2024-03-27 20:25:21
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谱聚类是基于矩阵SVD分解的一种聚类方法,就矩阵分解而言,并没有什么新奇的,但是利用矩阵分解来解决问题的思路值得研究一下
解决的问题 实现图的最佳分割 优化目标切割目标,切割成本最小,分割后的数据规模差不多大。通俗的说,就是集群内部,节点联系尽量紧密,群集外部连接越少。 解决过程步骤一建立拉普拉斯矩阵(度矩阵-连接矩阵)这个矩阵第一个巧妙之处在于它的最小特征向量,这样后面的特征向量因为
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2024-04-14 06:27:50
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#进行SpectralClustering
#查看默认的谱聚类效果
y_pred = SpectralClustering().fit_predict(cluster_data)
print("Calinski-Harabasz Score", metrics.calinski_harabaz_score(cluster_data, y_pred))#默认使用的是高斯核,需要对n_cluster
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2023-06-21 21:49:46
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