一、边缘提取常用算子1、sobel算子边缘检测//Sobel梯度算子
void imageSobel(){
const char* name = "lena.tif";
IplImage* image = cvLoadImage(name, CV_LOAD_IMAGE_GRAYSCALE);
if (image == NULL){
printf("image load failed.\n
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2024-06-29 20:23:56
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tophat -p 4 -G filter.gtf \-o /SRR222 \/index \SRR222.fastqtophat -p 4 -G filter.gtf \-o /SRR222 \/index \SRR717.fastq,SRR718.fastqtophat -p 4 -G filt...
原创
2023-11-06 15:15:57
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（1）安装cufflinks tophat http://5527lok.blog.163.com/blog/static/6475158201242823917220/ （2）使用Tophat分析RNA-seq结果 http://5527lok.blog.163.com/blog/static/6
原创
2023-11-08 09:06:11
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tophat输出结果junction.bedBED formatBED format provides a flexible way to define the data lines that are displayed in an annotati
原创
2023-11-07 09:28:32
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samtools flagstat /SRA111111/SRR111222/accepted_hits.bam 78406056 + 0 in total (QC-passed reads + QC-failed reads) (1)0 + 0 duplicates78406056 + 0 mapped (100.00%:-nan%) (2)78406056 + 0 pai
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2023-11-06 15:20:34
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Cole Trapnellsaid：there are three strategies:1) merge bams and assemble in a single run of Cufflinks2) assemble each bam an
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2023-11-06 15:07:36
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欢迎关注”生信修炼手册”!tophat-fusion 是一款利用RNA_seq 数据鉴定融合基因的工具，官网
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2022-06-21 06:21:26
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引言RNA-Seq技术的产生大大推动了转录组学的研究范围和规模，然而面对RNA-seq惊人的数据量，刚入门的新手难免感觉有些无所适从。因此如何对RNA-seq数据进行分析，挖掘其中蕴含的宝贵信息，可以说是RNA-seq分析中的重中之重。分析RNA-seq的软件众多，但没有哪个软件是万能的。研究人员可以根据自己的研究对象和目标，制定不同的分析策略。RNA-
原创
2021-03-28 06:58:41
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1. 概述本设计采用FPGA技术，实现CMOS视频图像的Tophat形态学滤波，并通过以太网传输(UDP方式)给PC实时显示。2. 硬件系统框图CMOS采用MT9V011(30万像素)，FPGA采用ALTERA公司的CYCLONE IV，以太网卡采用REALTK公司的100M网卡芯片，硬件框图如下：硬件平台采用ETree的FPGA开发板，如下图所示：3. 算法原理Tophat变换是原图像与开运算结
原创
2017-10-28 11:00:40
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learn opencv website: https://www.learnopencv.com/ learn opencv github:https://github.com/spmallick/learnopencv
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2022-07-21 08:25:18
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一、openCV介绍 Open Source Computer Vision Library.OpenCV于1999年由Intel建立，如今由Willow Garage提供支持。OpenCV是一个基于BSD许可（开源）发行的跨平台计算机视觉库，可以运行在Linux、Windows、MacOS操作系统上。它轻量级而且高效——由一系列 C 函数和少量C++类构成，同时提供了Python、Ruby、M
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2024-04-18 22:33:46
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isContinuous 参考 1. opencv_isContinuous; 完
原创
2022-07-11 12:51:40
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参考：https://github.com/spmallick/learnopencvOpenCV中使用forEach进行并行像素访问在本教程中，我们将比较Mat类的forEach方法的性能和访问和转换OpenCV中像素值的其他方式。 我们将展示如何使用at方法甚至高效地使用指针算法，forEach比使用at方法快得多。OpenCV中有隐藏的宝石，有时不是很知名。 其中一个隐藏的宝石是Mat类的f
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2024-07-02 05:30:21
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spring boot整合OpenCV4.5第一步：选择安装的OpenCV包第二步：解压OpenCV包并放至项目目录下面第三步：导入jar包第四步：配置动态链接库文件(dll)第五步：测试程序可能出现的问题：1.Failed to execute goal org.apache.maven.plugins:maven-surefire-plugin:2.22.2:test (default-te
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2024-04-09 19:25:55
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OpenCV是什么，相信搞机器视觉的朋友都清楚。但是很多搞机器视觉的朋友却是对他又爱又恨。爱它因为它是免费的，如果能够好好掌握它，并运用到自己的机器视觉项目中，还是可以一定程度上降低项目成本。恨它是因为它不太好学习。原因有以下几个：1、国内有关OpenCV的中文著作太少了，就2本，而且还是1.1版本的，已经和现在最新版本2.4.3差别太大，就算是学习了，过渡到最新版也要
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2024-05-25 16:55:46
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引言本篇主要想总结一下Ubuntu下opencv对于CPU的编译全过程，以及遇到的一些坑。依赖项安装首先我们需要CMake来配置安装，GCC进行编译，Python-devel和Numpy来构建Python绑定等。sudo apt-get install cmake
sudo apt-get install gcc g++一般云服务器是没有cmake的，而本地服务器的cmake也可能会版本比较低，如
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2024-02-29 17:17:18
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前言： 什么是OpenCV?可能还有人不清楚吧，简单地说，OpenCV——Open Source Computer Vision Library,即开源计算机视觉库，它是基于C语言和部分C++语言来开发，可用于计算机视觉、图像处理以及模式识别和跟踪。一、准备工作：1.下载OpenCV安装包： 到OpenCV的官网（http://opencv.or
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2024-03-21 21:55:47
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Opencv是一个用户基础非常多的视觉开发库，可以用来实现人脸识别等功能，由于涉及到大量的调用与计算，所以对硬件的条件要求很高，并且还需要时时刻刻注意内存溢出这个问题，怎么样？很刺激吧。从这篇文章开始我们从最基础学起，不同于其他学习博客，这个系列文章真的会是从最基础的开始讲解。本文主要讲解Opencv的数据类型，已经最关键的类：Mat所拥有的强大的特性。Opencv的C++类和函数都定义在命名空间
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2024-03-23 14:42:30
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