tophat -p 4 -G filter.gtf \-o /SRR222 \/index \SRR222.fastqtophat -p 4 -G filter.gtf \-o /SRR222 \/index \SRR717.fastq,SRR718.fastqtophat -p 4 -G filt...
原创
2023-11-06 15:15:57
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一、边缘提取常用算子1、sobel算子边缘检测//Sobel梯度算子
void imageSobel(){
const char* name = "lena.tif";
IplImage* image = cvLoadImage(name, CV_LOAD_IMAGE_GRAYSCALE);
if (image == NULL){
printf("image load failed.\n
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2024-06-29 20:23:56
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（1）安装cufflinks tophat http://5527lok.blog.163.com/blog/static/6475158201242823917220/ （2）使用Tophat分析RNA-seq结果 http://5527lok.blog.163.com/blog/static/6
原创
2023-11-08 09:06:11
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tophat输出结果junction.bedBED formatBED format provides a flexible way to define the data lines that are displayed in an annotati
原创
2023-11-07 09:28:32
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samtools flagstat /SRA111111/SRR111222/accepted_hits.bam 78406056 + 0 in total (QC-passed reads + QC-failed reads) (1)0 + 0 duplicates78406056 + 0 mapped (100.00%:-nan%) (2)78406056 + 0 pai
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2023-11-06 15:20:34
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Cole Trapnellsaid：there are three strategies:1) merge bams and assemble in a single run of Cufflinks2) assemble each bam an
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2023-11-06 15:07:36
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欢迎关注”生信修炼手册”!tophat-fusion 是一款利用RNA_seq 数据鉴定融合基因的工具，官网
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2022-06-21 06:21:26
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引言RNA-Seq技术的产生大大推动了转录组学的研究范围和规模，然而面对RNA-seq惊人的数据量，刚入门的新手难免感觉有些无所适从。因此如何对RNA-seq数据进行分析，挖掘其中蕴含的宝贵信息，可以说是RNA-seq分析中的重中之重。分析RNA-seq的软件众多，但没有哪个软件是万能的。研究人员可以根据自己的研究对象和目标，制定不同的分析策略。RNA-
原创
2021-03-28 06:58:41
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1. 概述本设计采用FPGA技术，实现CMOS视频图像的Tophat形态学滤波，并通过以太网传输(UDP方式)给PC实时显示。2. 硬件系统框图CMOS采用MT9V011(30万像素)，FPGA采用ALTERA公司的CYCLONE IV，以太网卡采用REALTK公司的100M网卡芯片，硬件框图如下：硬件平台采用ETree的FPGA开发板，如下图所示：3. 算法原理Tophat变换是原图像与开运算结
原创
2017-10-28 11:00:40
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learn opencv website: https://www.learnopencv.com/ learn opencv github:https://github.com/spmallick/learnopencv
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2022-07-21 08:25:18
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一、openCV介绍 Open Source Computer Vision Library.OpenCV于1999年由Intel建立，如今由Willow Garage提供支持。OpenCV是一个基于BSD许可（开源）发行的跨平台计算机视觉库，可以运行在Linux、Windows、MacOS操作系统上。它轻量级而且高效——由一系列 C 函数和少量C++类构成，同时提供了Python、Ruby、M
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2024-04-18 22:33:46
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isContinuous 参考 1. opencv_isContinuous; 完
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2022-07-11 12:51:40
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1 前言本人小白，想利用MFC实现摄像头的开关、截图、录像、手动亮度和对比对调整以及控件自适应变化等基本功能，程序基本上都是参考网上的教程和博客，但中间遇到过摄像头打不开、opencv造成内存泄露、摄像头运行一段时间后会自动关闭等各种小问题，所以想借此记录下自己调试的过程，也希望能有所帮助。本文主要是利用MFC中的OnTimer函数定时截取摄像头所获图像，再对图像进行亮度和对比度调整，然后利用Op
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2024-05-08 19:05:16
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函数AreaDotProduct用于计算每个面的法向，函数PointDotProduct用于计算每个顶点的法向（需要调用AreaDotProduct函数），得到的法向值存储在顶点结构体中。用glNormal3f函数将存储的法向赋给顶点，设置光照的时候就会自动产生效果了。 fractal.h#pragma once
#include <gl/glut.h>
#in
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2024-03-18 12:44:19
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一、下载OpenCV1.打开OpenCV官网Home - OpenCV2.点击Library，选择Raleases 3.跳到如下页面（其中有OpenCV-4.6.0、OpenCV-4.5.5、OpenCV-4.5.4多个版本，依照自己需要选择，这里选择的是OpenCV-4.6.0）在OpenCV-4.6.0中点击Windows 4.跳转如下页面（电脑绿环提示将会在5秒后开始自动
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2024-02-27 21:31:39
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使用opencv实现camera calibration(摄像机校准/标定)使用opencv提供的demo(源码为calibration.cpp)实现单目摄像头的image的camera calibration的基本处理过程一般步骤分为两个部分，如下：获取camera的内外参和畸变相关系数从图片列表中读取图像，或从camera中获取图像。cvtColor，把图像转换成灰度图；基于BGR图像，使用
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2024-02-27 09:54:24
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引言本篇主要想总结一下Ubuntu下opencv对于CPU的编译全过程，以及遇到的一些坑。依赖项安装首先我们需要CMake来配置安装，GCC进行编译，Python-devel和Numpy来构建Python绑定等。sudo apt-get install cmake
sudo apt-get install gcc g++一般云服务器是没有cmake的，而本地服务器的cmake也可能会版本比较低，如
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2024-02-29 17:17:18
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前言： 什么是OpenCV?可能还有人不清楚吧，简单地说，OpenCV——Open Source Computer Vision Library,即开源计算机视觉库，它是基于C语言和部分C++语言来开发，可用于计算机视觉、图像处理以及模式识别和跟踪。一、准备工作：1.下载OpenCV安装包： 到OpenCV的官网（http://opencv.or
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2024-03-21 21:55:47
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