目录Nilearn简介Nilearn操作第一步:查看数据第二步:平滑操作第三步:保存结果到文件中本分享为脑机学习者Rose整理发表于公众号:脑机接口社区(微信号:Brain_Computer).QQ交流群:903290195Nilearn简介Nilearn是一个Python模块,用于对神经成像数据进行快速、简单的统计学习。它利用scikit-learn python工具箱进行多变量统计,应...
原创 2021-09-07 13:57:45
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本分享为脑机学习者Rose整理发表于公众号:脑机接口社区(微信号:Brain_Computer).QQ交流群:903290195可视化Nilearn附带的HCP connectome工作台颜色图,可用于在表面上绘制大脑图像。import numpy as npimport matplotlib.pyplot as pltfrom nilearn.plotting.cm import _...
原创 2022-01-25 10:33:14
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本分享为脑机学习者Rose整理发表于公众号:脑机接口社区(微信号:Brain_Computer).QQ交流群:903290195可视化Nilearn附带的HCP connectome工作台颜色图,可用于在表面上绘制大脑图像。import numpy as npimport matplotlib.pyplot as pltfrom nilearn.plotting.cm import _...
原创 2021-09-07 11:45:54
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目录Nilearn简介Nilearn操作第一步:查看数据第二步:平滑操作第三步:保存结果到文件中本分享为脑机学习者Rose整理发表于公众号:脑机接口社区(微信号:Brain_Computer).QQ交流群:903290195Nilearn简介Nilearn是一个Python模块,用于对神经成像数据进行快速、简单的统计学习。它利用scikit-learn python工具箱进行多变量统计,应...
原创 2022-01-25 10:14:26
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目录脑部地图集绘制第一步:下载数据集第二步:可视化Harvard-Oxford 脑部地图集玻璃脑图(Glass brain)绘制本分享为脑机学习者Rose整理发表于公众号:脑机接口社区(微信号:Brain_Computer).QQ交流群:903290195脑部地图集绘制数据集来源:Harvard-Oxford 脑部地图集第一步:下载数据集数据集文件格式为:HarvardOxford-...
原创 2022-01-25 10:32:00
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这是使用Nilearn解码的教程,它以Haxby 2001研究中猫辨别任务的数据为基础。fMRI解码入门教程功能性磁共振成像(FMRI,functional magnetic resona...
这是使用Nilearn解码的教程,它以Haxby 2001研究中猫辨别任务的数据为基础。fMRI解码入门教程功能性磁共振成像(FMRI,functional magnetic resona...
  目录 脑部地图集绘制 第一步:下载数据集 第二步:可视化Harvard-Oxford 脑部地图集 玻璃脑图(Glass brain)绘制   本分享为脑机学习者Rose整理发表于公众号:脑机接口社区 .QQ交流群:903290195 脑部地图集绘制 数据集来源:Harvard-Oxford 脑部地图集 第一步:下载数据集 数据集文件格式为: HarvardOxford-cort-
原创 2021-09-07 15:29:27
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记录人:陈亦新 可以看到,这个脑部的数据下载下来都是nii.gz的数据,是3D的数据。可视化图中似乎是将将脑部的数据划分成不同的区域。如果我们将n_components调整为2,那么可视化的结果为:
原创 2022-11-06 01:19:33
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目录简介案例1.加载ADHD200数据2.将CanICA应用在核磁共振图像3.可视化3.1将所有的组件都放在同一组图片上3.2将所有的ICA组件单独绘制本分享为脑机学习者Rose整理发表于公众号:脑机接口社区(微信号:Brain_Computer).QQ交流群:903290195简介将CanICA应用于静息状态数据的示例。此示例将其应用于ADHD200数据集的30个主题。然后,它绘制一个...
原创 2022-01-25 10:08:40
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  目录 简介 案例 1.加载ADHD200数据 2.将CanICA应用在核磁共振图像 3.可视化 3.1将所有的组件都放在同一组图片上 3.2将所有的ICA组件单独绘制 简介 将CanICA应用于静息状态数据的示例。此示例将其应用于ADHD200数据集的30个主题。然后,它绘制一个地图,所有的组件一起和轴向切割的每个组件分开。CanICA是一种用于fMRI数据组级分析的ICA方
原创 2021-09-07 15:28:40
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目录3D和4D niimgs:处理和可视化第一步:加载数据第二步:可视化可视化4D文件本分享为脑机学习者Rose整理发表于公众号:脑机接口社区(微信号:Brain_Computer).QQ交流群:9032901953D和4D niimgs:处理和可视化第一步:加载数据from nilearn import datasetsimport warningswarnings.filterw...
原创 2022-01-25 10:18:38
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目录3D和4D niimgs:处理和可视化第一步:加载数据第二步:可视化可视化4D文件本分享为脑机学习者Rose整理发表于公众号:脑机接口社区(微信号:Brain_Computer).QQ交流群:9032901953D和4D niimgs:处理和可视化第一步:加载数据from nilearn import datasetsimport warningswarnings.filterw...
原创 2021-09-07 13:38:53
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 Nilearn简介Nilearn使许多先进的机器学习、模式识别和多元统计技术在神经成像数据上的应用变得很容易,如MVPA(Mutli-Voxel pattern Analysis)、解码、预测建模、功能连接、大脑分割、连接体。Nilearn可以很容易地用于任务态和静息态fMRI,或者VBM数据。Nilearn的价值可以被看作是特定领域的特征工程构建,也就是说,将神经成像数据塑造成一个非
最近在学习Nilearn包的使用,现将学习笔记和思考发布在这里,供大家参考。 以下训练的数据均来自于官网的练习数据 haxby2001的数据一、导入核磁数据这个没啥特别的,指定图像地址就好了,唯一要注意的是,需要是4D的nii.gz文件格式,这个可以通过其他软件转换。#导入数据就是命名nii.gz的数据地址 file_name = r'D:\jupyter\nilearn\haxby2001\su
python代码中 修改脑图中连接边的粗细 代码如下: from nilearn import plottingimport numpy as npimport mat4py as mt correlation_matrix = np.load('E:/new_forBrainMap.npy') c ...
转载 2021-07-04 01:16:00
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“ 我们在 Github 上的贡献者和提交者之中检查了用 Python 语言进行机器学习的开源项目,并挑选出最受欢迎和最活跃的项目。 ” 图 1 :在 GitHub 上用 Python 语言机器学习的项目,图中颜色所对应的 Bob, Iepy, Nilearn,