1.类的继承俗话说：龙生龙，凤生凤，老鼠的儿子会打洞。在古代我们的祖先就已经在大量的观察中总结出了孩子会继承父母一些特质的结论，现代的生物遗传学也确实证实了子类会表现出父类的一些特质是通过DNA的遗传，亲代会将自己的遗传物质DNA传递给后代，而且遗传的性状和物种会保持相对的稳定。遗传物质在生物进程之中得以代代相承，从而使后代具有与前代相近的性状。 这一现象在python中其实也存在，只不过它的遗传
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2023-12-24 13:30:46
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NCBI官网：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ BioPython官方文档：https://biopython-cn.readthedocs.io/zh_CN/latest/bioPython是生物信息领域用于基因序列比对的一个工具，在搭建本地化blast的时候很实用。 以下笔记内容是在开发过程中参考官方文档 第七章：BLAST 后的相关问题及解决记录。首先，使用NCBI
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2023-12-18 20:46:25
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1. 基因转录本亚型 蛋白质亚型或“蛋白质变体“是一组高度相似的蛋白质成员，这些成员来源于单个基因或基因家族，是遗传差异造成的结果。虽然许多具有相同或相似的生物学作用，但一些亚型具有独特的功能。这些高度相似的蛋白质亚型可以由可变剪
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2024-07-07 14:56:59
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突变信号（Mutational Signatures）首次2013年在《nature》进行报道。并做了相关的定义：细胞在成长过程中，基因组不断受到内源性和外源性DNA损伤的威胁，正是由于这些威胁，使得细胞基因组不断发生变化，并最终发生一些突变的积累。每一个突变过程都会留下一个不同的基因组标记，也就称为突变信号。前 言研究人员对TCGA数据的深度挖掘，从而提出的一个统计学概念。文章研究了30种癌症，
1.构建DGEList对象2.TMM标准化3.估算离散值4.差异基因分析 参考链接：http://blog.sciencenet.cn/blog-3406804-1188480.html#加载包和数据
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
if (!requi
好久没写博客了，最近看了个东西，觉得不错，整理了一下：遗传算法遗传算法 ( GA , Genetic Algorithm ) ，也称进化算法 。 遗传算法是受达尔文的进化论的启发，借鉴生物进化过程而提出的一种启发式搜索算法。因此在介绍遗传算法前有必要简单的介绍生物进化知识。一.进化论知识作为遗传算法生物背景的介绍，下面内容了解即可：种群(Population)：生物的进化以群体的形式进行，这样的一
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2024-03-08 14:43:48
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本周四（11月4日）下午三点，Molecular Plant 和Plant Communications 联合启动MPlant在线讲座—2021前沿技术系列，邀请了华南农业大学的夏瑞教授和陈程杰老师在线讲解了生物信息学工具TBtools的开发历程、主要功能、新的插件等内容并进行了应用演示。本次讲座吸引了一千三百多人在线参加和讨论，反响十分热烈。本次讲座视频录播已上传至bilibili网站，供大家在
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2023-12-21 14:01:57
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目录1. 表达式树【★★★★】1.1 开放阅读框（ORFs）2. 基因的结构和功能组织【★★★★】3. 翻译后的相互作用和连接函数【★★★】4. 其他术语【★】4.1 Karva语言:GEP的语言5. 参考书籍 1. 表达式树【★★★★】【ps：这里先看懂表达式树是怎么转换为数学式子PS：注意结合前边内容基因表达式编程(GEP)自学 第【1】天 Python 实现】1.1 开放阅读框（ORFs）
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2023-10-12 21:20:51
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# Java 查找附近门店的实现方法
在现代的应用开发中，尤其是在移动和Web应用中，查找附近的门店是一项常见的功能。本文将介绍如何利用Java语言和一些相关的API来实现这一功能。我们将从构建一个简单的门店数据库开始，再通过地理位置获得用户附近的门店。
## 1. 项目准备
首先，我们需要准备一个项目环境。确保你已经安装了Java Development Kit (JDK) 和一个合适的I
原创
2024-08-18 06:05:52
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# Python 查找附近坐标的入门指南
在现代应用中，地理位置服务（Location-Based Services, LBS）越来越普遍，开发者常常需要在应用中使用坐标数据进行位置查找、距离计算以及附近设施推荐等功能。本篇文章将介绍如何在 Python 中查找附近的坐标，并通过代码示例进行演示。
## 什么是坐标？
坐标是一个用来表示地理位置的数学概念，通常用一对经度和纬度来表示。例如，北
原创
2024-08-23 08:43:02
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使用redis geo 实现查找附近的人，附近的地区功能
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2021-09-15 14:19:47
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1. 前言老板突然要上线一个需求，获取当前位置方圆一公里的业务代理点。明天上线！当接到这个需求的时候我差点吐血，这时间也太紧张了。赶紧去查相关的技术选型。经过一番折腾，终于在晚上十点完成了这个需求。现在把大致实现的思路总结一下。图12. MySQL 不合适遇到需求，首先要想到现有的东西能不能满足，成本如何。MySQL是我首先能够想到的，毕竟大部分数据要持久化到MySQL。但是使用MySQL需要自行
原创
2021-05-04 09:56:52
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今天花了挺久时间写的一个序列提取的小程序，运行成功了，但可能在效率和实现方面存在不足，以后再改进，并希望大佬们提供宝贵的指导意见以及思路准备文件1.存放基因id号的txt文件 2.某物种的全部蛋白序列生成文件生成所需基因的序列文件代码实现一实现思路：1.将所需要的基因ID存放于列表中，gene_list 2.将全部序列的fasta文件按行存放于列表中,all_seq_list 3.获取对应基因的序
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2023-07-06 11:32:29
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文章目录根据经纬度计算指定范围内或者附近的人（java）前言实现 根据经纬度计算指定范围内或者附近的人（java）前言最近项目中有一个需求，就是在地图中随便标一个点位，然后根据这个点位显示出附近所选范围内的人员。这里说一下人员的经纬度是app实时上传更新的。说白了就是要根据指定的坐标计算所选半径内的在线人员。实现思路： 这个大概有两种方式，各位大佬要是有好的建议还请分享一下。 1、在sql中直接
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2023-07-18 18:21:04
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# 使用 Java 和 Redis 实现查找附近的人
在当今的移动互联网时代，“附近的人”功能已经成为许多社交应用的标配。这种功能一般会基于用户的位置来推荐周围的人，提供更好的社交体验。本文将通过一个简单的示例，介绍如何使用 Java 和 Redis 来实现查找附近人的功能。
## 一、项目背景
在本示例中，我们将使用 Redis 来存储用户的位置信息，利用 GeoHash 编码来快速查找附
随着移动互联网的兴起，越来越多的App中加入了LBS的元素。而在各种LBS应用中，查找附近的地点是一种最基本也是最常见的形式。前段时间项目中加入了一个新的特性，需要根据用户所在的位置，查找附近的用户和用户发表的广播。本文将对此项目中使用的一些关键技术和遇到的问题做个简单的介绍。 在进行具体的技术介绍之前，需要先从产品层面做一些基本的条件设定。首先，地理位置信息是有时效性的，用户A一个月前来过某
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2024-07-09 22:09:25
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fastq与fasta文件格式解析一、fasta格式二、fastq格式2.1 格式说明2.2 碱基质量计算2.3 Quality Score简化三、二代测序的fastq文件格式介绍四、补充说明4.1 illumina测序仪4.2 illumina测序方法4.3 测序流程参考文章 一、fasta格式fasta格式是一种非常简单的储存序列的格式（主要是把序列存储到数据库中的一种形式），可以储存核酸序
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2023-12-27 21:42:48
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# 使用Biopython获取某个物种所有基因的序列
在生物信息学领域，Biopython是一个非常有用的Python工具包，用于处理生物信息学数据。在本文中，我们将介绍如何使用Biopython获取某个物种所有基因的序列的方法，并提供相关的代码示例。
## 问题描述
假设我们想要获取某个物种（比如大鼠）所有基因的序列，我们可以使用Biopython提供的工具来实现这个目标。这样做可以帮助我
原创
2024-04-28 03:53:48
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BioPython简介Biopython工程是一个使用Python来开发计算分子生物学工具的国际团体。(http://www.python.org) Python是一种面向对象的、解释型的、灵活的语言，在计算机科学中日益流行。Python易学，语法明晰，并且能很容易的使用以C，C++或 者FORTRAN编写的模块实现扩展。Biopython官网(http://www.biopython.org)为
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2023-12-07 14:28:01
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其实对于那种地理位置不会变的两个主体之间的距离，最好是直接将结果静态化。也就是直接写死在配置里。比如，找自己家附近的地铁站。这种情况下，一般而言“家”这个主体是不会轻易“跑来跑去”的。每次查询都计算一次距离没什么意义。最好是直接将距离持久化后直接查询。另一种情况：获取APP用户所在位置附近的地铁站这种情况下，用户的地理位置是变动的。所以每次都得实时计算实际距离。思路将地球当做一个标准的球体，使用球
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2024-07-08 10:48:05
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