新手们总是会困惑，LAMMPS为什么要提供special bonds这个独特的命令。因为在别的软件中，使用全原子力场，基本不会涉及到这个概念。在LAMMPS里面，这个参数特别重要，对应使用全原子力场做模拟的LAMMPS用户来说，稍有不慎，会错的离谱。那么special bonds到底是何方神圣，对模拟影响那么大呢（这里指全原子模拟），且听iSimuLy给你唠叨唠叨。对于这个问题的理解，首先我们大脑
1.概念陈述接触力(contact force):只有相互接触才会发生的力叫做接触力，接触力分为弹性力和摩擦力，因为它们在本质上都是由电磁场引起的，属于电磁力.非接触力(non-contact force):非接触力即为不接触的两个物体之间的相互作用，一般场力皆属于非接触力.电磁力(electromagnetic force):电磁力是电荷、电流在电磁场中所受力的总称，也有称载流导体在磁场中受的力
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2017-08-31 23:14:00
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分子力场根据量子力学的波恩-奥本海默近似，一个分子的能量可以近似看作构成分子的各个原子的空间坐标的函数，简单地讲就是分子的能量随分子构型的变化而变化，而描述这种分子能量和分子结构之间关系的就是分子力场函数。分子力场函数为来自实验结果的经验公式，可以讲对分子能量的模拟比较粗糙，但是相比于精确的量子力学从头计算方法，分子力场方法的计算量要小数十倍，而且在适当的范围内，分子力场方法的计算精度与量子化学计
电场驱动电荷，形成电流（感应电流）；LC 电路是由电容、电感、电阻等元件和电子器件组成的能够产生振荡电流或具有滤波作用的电路，由电感线圈 L 和电容器 C 相连而成的 LC 电路是最简单的一种 LC 电路。1. LC 电路的电磁原理介绍电磁场的概念具有高度的概括性，这是一个内涵很丰富的概念，它虽然包括静电场和电流的磁场，但是电磁场不是电场和磁场简单的相加。 （1）关于磁场产生电场按照磁场时变的几种
目录给下一届-分子动力学相关系统选择Win和Linux软件安装LAMMPS安装Python](https://www.python.org/)及[Anaconda安装Moltemplate安装（粗粒化建模）（目前在用）[Materials Studio（MS）](https://3dsbiovia/products/collaborative-science/biovia-materia
pcl点云特征提取 法线估计 PFH FPFH NARF 惯量偏心矩 RoPs特征 视点特征直方图VFH GASD特征如果要对一个三维点云进行描述，光有点云的位置是不够的，常常需要计算一些额外的参数， 比如法线方向、曲率、文理特征、颜色、领域中心距、协方差矩阵、熵等等。 如同图像的特征（sifi surf orb）一样，我们需要使用类似的方式来描述三维点云的特征。 常用的特
文件目录atomtypes.atp(5.2.1)aminoacid related filesaminoacids.rtp(5.6.1)aminoacids.r2b(5.6.2)aminoacids.hdb(5.6.4)aminoacids.c.tdb(5.6.5)aminoacids.n.tdbaminoacids.vsd(5.6.6)summarizing brieflyff filesff
# 如何实现 VASP 机器学习力场
机器学习在材料科学中正变得越来越重要，而使用 VASP （Vienna Ab-initio Simulation Package）进行计算的过程中，通过机器学习力场可以大大提高模拟的效率。本文将指导您如何实现 VASP 机器学习力场。以下是整个流程的概述，接下来我们将逐步解释每一个步骤。
| 步骤 | 描述 |
8. 基础知识此部分描述了如何使用 LAMMPS 为用户和开发人员执行各种任务。术语表页面还列出了 MD 术语，以及相应 LAMMPS 手册页的链接。 LAMMPS 源代码分发的 examples 目录中包含的示例输入脚本以及示例脚本页面上突出显示的示例输入脚本还展示了如何设置和运行各种模拟。8.1.通用基础知识8.2. 设置入门8.3. 分析入门8.4.
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2024-07-21 09:10:19
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原文：3 Machine Learning Algorithms You Need to Know 作者：Eleni Markou 翻译：Vincent译者注：决策树 & 聚类算法 & 线性回归：应该使用哪种机器学习算法？使用它的原因是什么?作者在本文中详细介绍了这些内容。以下为译文。假设有一些跟数据相关的难题需要你去解决。之前你已经听过机器学习算法的厉害之处了，因此你自己也想
全原子力场中各参数的含义及其在LAMMPS中的应用OPLSAA力场参数是分子动力学中广泛应用的力场。但有些同学对力场中的参数含义不是很了解。下面就OPLSAA力场参数如何应用于LAMMPS做一个简单的介绍。PART 1 力场定义这一部分是OPLSAA的介绍，已经在上一篇博客中有介绍，这里不再赘述。PART 2 原子类型定义第二部分主要是原子类型的定义，第二列是原子编号，第五列是对该原子的一个归类，
力场力场(Force Field, 常简写为FF)这个物理学名词听起来有点高深, 可如果理解了它的含义你就会觉得这是很自然的一个概念, 没有什么特别之处.在中学物理或者初等力学中, 研究物体的运动都是从分析其受力出发的, 可以说是以力为基础, 这也是称为力学的原因. 牛顿第二定律直接将物体的受力与其加速度联系起来, 这样只要知道了物体的受力情况, 就能计算出其运动轨迹. 在力学中, 一般将力作为一
今天遇到了一个需要用map解决的问题和大家分享一下冷血格斗场查看提交统计提问总时间限制:
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为了迎接08年的奥运会，让大家更加了解各种格斗运动，facer新开了一家冷血格斗场。格斗场实行会员制，但是新来的会员不需要交入会费，而只要同一名老会员打一场表演赛，证明自己的实力。我们假设格
一、UIDynamic是从iOS 7开始引入的一种新技术，隶属于UIKit框架。可以认为是一种物理引擎，能模拟和仿真现实生活中的物理现象，重力、弹性碰撞等，游戏开发中很常见，例如愤怒的小鸟。二、UIDynamic实现物理仿真效果步骤： （1）创建一个物理仿真器（Dynamic Animator）（顺便设置仿真范围） （2）创建相应的物理仿真行为（Dynamic Behavior）（顺便添加物理
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2024-07-12 15:17:18
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就像我们之前学过的静电场，所谓场就是在连续空间内连续存在的，而不是个别几何点那么场强E就作为位置r的函数，其存在于空间D中我们考虑一个空间内空气的流动，就会有一个流场。对应的还会有该场上各个物理量的场，例如密度场、温度场、速度场等等，他们都是空间D中位置r的函数。这些物理量分为标量和矢量。如果某个物理量的场是随时间变化的（刚才说到的是静止的情况），那么该物理量除了位置r以外，同时也是时间t的函数。
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2023-12-13 12:22:36
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lammps模拟设置中，力场的设置非常重要，力场设置合理才能准确的描述原子之间的受力。如果两种原子之间没有键连接，可以使用pair_style命令设置这两种原子的力场。pair_style能够设置的力场类型比较多，比如LJ、MORSE、EMA、MEAM等。本文主要介绍最常用的力场：lj/cut。lj/cut力场公式比较简单：在lammps使用lj/cut只需要设置3个参数：epsilon、sigm
原创
2022-01-06 17:18:37
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# VASP机器学习力场训练及应用
## 引言
机器学习在材料科学中的应用越来越广泛，特别是在训练力场模型的过程中，利用基于量子力学的计算结果，能够加速材料的研究与开发。而VASP（Vienna Ab initio Simulation Package）作为一种常用的第一性原理计算软件，常与机器学习结合来训练力场，以实现对材料性质的高效预测。本文将讨论如何利用VASP的计算结果来训练机器学习力
原创
2024-10-20 06:38:45
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随着计算机技术的发展和计算能力的提升，以模拟和计算的方式去探究实验科学中无法看到的分子机制和细节对目前的科
原创
2023-05-18 09:52:17
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# VASP机器学习力场算例实现指南
在计算材料科学中，VASP（Vienna Ab-initio Simulation Package）是一款广泛应用的第一性原理计算软件。而机器学习力场（MLFF）是通过使用机器学习算法来近似描述材料系统的力场。本文将为小白开发者提供一个关于如何实现“VASP机器学习力场算例”的详细步骤。
## 一、整体流程
在进行VASP机器学习力场算例时，通常需要遵循
一、VASP全称Vienna Ab-initio Simulation Package，是维也纳大学Hafner小组开发的进行电子结构计算和量子力学-分子动力学模拟软件包。它是目前材料模拟和计算物质科学研究中最流行的商用软件之一。二、输入文件VASP一般来说最简单的输入文件有：INCAR,POSCAR,POTCAR,KPOINTS；如果是在服务器上计算的，那么还需要一个提交任务的脚本。三、INCA
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2023-10-17 19:30:42
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