前言最近加入了一个研究基因大数据的项目组,要学习基因相关知识QAQ,所以开始一个新系列梳理知识和激励自己学习。本系列参考了https://zhuanlan.zhihu.com/p/54142276Needleman-Wunsch算法Needleman-Wunsch算法是基于动态规划的算法,记不清楚的可以看下我之前的动态规划的文章,简单总结就是将一个问题分解为很多相互联系并且逐渐扩大的小问题,依次解
# Python实现局部比对算法
随着生物信息学的发展,越来越多的研究者开始关注DNA、RNA等生物序列的比对问题。局部比对算法是其中一种常用的比对方法,能够有效地找到两个序列之间的局部相似性,常用于寻找同源基因、蛋白质结构等方面。本文将介绍如何使用Python实现局部比对算法,并通过代码示例演示其运行过程。
## 局部比对算法简介
局部比对算法是一种用于比较两个序列的方法,主要关注序列之间
原创
2024-04-08 04:21:06
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# Python 双序列局部比对工具实现流程
## 1. 简介
在本文中,我将教会你如何使用Python实现一个双序列局部比对工具。该工具可以用于比较两个序列,并找出它们之间的相似性。
## 2. 流程概述
下面是实现该工具的步骤概述:
| 步骤 | 描述 |
| -------- | ----------- |
| 步骤 1 | 读取输入的两个序列 |
| 步骤 2 | 计算序列之间的相似
原创
2023-10-27 05:36:42
60阅读
生物序列局部比对之Blast算法 算法基本原理: Blast算法是1990年由Altschul等人提出的两序列局部比对算法,采用了一种短片段匹配算法和一种有效的统计模型来找出目的序列和数据库之间的最佳局部比对效果。Blast算法是一种基于局部序列比对的序列比对算法。广泛被使用在蛋白质DNA序列的分析问题中,在其他序列相似性比对中也有应用。传统的基于动态规划的局部性比对性算法采用的是精确的序列比对
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2024-01-26 08:15:29
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本节概要基础环境 ipython基础 前言这是18年的第一篇blog,因为boss对于我的工作上的一些期望,需要着手做一些数据分析的工作,所以开始撰写这个系列的blog。分类的内的主要内容基本都是楼主鉴于阅读《利用python进行数据分析》一书所写的基本要点。 首先大环境就不需要多说了,为什么要用python做这些事,为什么要选择numpy跟pandas来进行数据
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2023-11-16 11:19:05
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1.序列比较算法(全局序列比对及局部序列比对的python实现)前言算法思想介绍实现功能及实现方法运行结果演示源代码遇到的问题及总结 前言阶段性地完成了DNA序列比较算法,还有很多不足和需要完善的地方有待日后改进。算法思想介绍一个很详细完整的算法介绍双序列全局比对及算法 Needleman-Wunsch 算法:动态规划法 输入值:两条序列、替换记分矩阵以确定不同字母间的相似度得分,以及空位罚分双
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2024-01-08 14:29:21
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很多部门、岗位的工作,都有大量零零散散的excel文件,或是日积月累的,或是终端店面、用户提交上来的,往往一股脑儿的放在一个或几个目录里,一般来说一个目录下excel文件里表的格式基本一致。久了,总会某天老板或领导突然冷冷地将一个目录丢过来:把里面的excel数据合并成起来,甚至更进一步要求按年月或数据里某个地区项归类加合并...看看目录,文件少则几十个,多则成百上千,甚至上万,咋搞?手动一个个打
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2024-07-27 12:23:03
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在这篇博文中,我们将深入探讨如何使用 Python 进行比对操作。无论是文本、数据还是其他类型的对象,Python 为我们提供了强大的工具和方法。为了确保我们的方法可靠且高效,本文将详细介绍环境预检、部署架构、安装过程、依赖管理、服务验证和故障排查等各个方面。
### 环境预检
在开始之前,我们需要详细了解所需的环境。在这里,我们将使用四象限图和兼容性分析来确保我们所选择的工具和库是最合适的。
需求分析近期需要一个脚本将录入员录入的两个Excel文件进行比对,检查二者录入的内容是否相同,将有错的内容以log日志的方式输出到.txt文件中,输出的内容是“文件1的路径”+“文件2的路径”+“哪个sheet表”+“第几列出问题”。这样方便人员进行确认并重新找出进行检查。根据这样的需求,首先确定了所使用的工具和程序编写架构:读取Excel表的数据:使用Python中的Panda库,其中的函数可以
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2023-06-16 15:13:37
423阅读
每当我们经过停车场的时候,都会看到在道闸机旁边会有摄像机,有的时候摄像机还会比较特殊,向安装的位置,摄像机的类型,这是什么情况呢?其实,在如今的智能停车场系统中有图像对比功能和车牌识别功能,而二者之间有这比较大的区别,主要是看客户的需求满足什么样的功能。 停车场图像对比:停车场的图像对比功能,很简单,主要有车辆出入口摄像机、停车场管理系统软件组成。其功能的作用更多的体现在停车场安全管理
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2023-12-28 05:18:01
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在Python中,具有相同数据类型的序列可以通过关系运算符进行比较。对序列进行比较大小,实际上就是对序列中的数据以“在字典中的顺序”(lexicographical ordering)进行比较,也就是出现在一本字典前面的数据要比后面的数据小。1 比较的方法1.1 当两个序列长度相同时对于比较两个长度相同的序列,先按照字典顺序,比较这两个序列的第一个数据值,如果能够比较出大小,则该结果即为这两个序列
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2023-05-28 18:02:44
680阅读
# Python 轮廓比对
## 引言
轮廓比对(Contour Matching)是计算机视觉领域中的一个重要技术,主要用于形状识别、图像分析和目标检测等任务。通过比对不同轮廓的相似性,算法可以快速识别同类对象。在本篇文章中,我们将探讨如何使用 Python 实现轮廓比对,并通过代码示例来展示这一过程。
## 理论基础
在进行轮廓比对之前,我们需要明确几个重要概念:
- **轮廓**:
在本篇文章中,我们将探讨如何使用 Python 实现语音比对。语音比对指对两个语音样本(如录音或实时音频)进行特征提取与相似度计算,从而判断其在说话人身份或内容上的相似程度。这项技术在语音识别、身份验证、以及声纹识别等领域具有重要应用。随着深度学习和信号处理技术的发展,Python 已成为实现这一解决方案的热门选择。
> “语音比对是指将两个或多个语音信号进行特征提取并比对,从而判断其相似度的过
# 使用Python进行JSON比对的详细指南
在现代软件开发中,JSON(JavaScript Object Notation)是一种广泛使用的数据交换格式。随着数据的增多,比较和分析不同的JSON对象变得越来越重要。本文将向你介绍如何使用Python来比对JSON数据,并且提供一个详细的步骤说明和代码实例。
## 流程概述
为了更好地理解JSON比对的步骤,我们可以将整个流程分为五个主要
# Python Blast 比对实现教程
## 1. 整体流程
下表展示了使用Python进行Blast比对的步骤和对应的代码:
| 步骤 | 描述 | 代码 |
| --- | --- | --- |
| 1 | 安装Biopython库 | `pip install biopython` |
| 2 | 准备比对序列和数据库 | - |
| 3 | 执行Blast比对 | `resul
原创
2023-12-10 11:39:28
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# Python CSV比对教程
在数据处理和分析的过程中,经常需要比较两个CSV文件的内容。本文将一步步教你如何使用Python实现CSV比对。我们将从流程概述开始,然后深入到每一步的代码实现。
## 流程概述
下面是使用Python进行CSV比对的步骤:
| 步骤 | 描述 |
|------|-----------
# Python文本比对的实用指南
文本比对是信息处理中的一个重要任务,尤其是在文本分析、数据清洗、文档管理等领域。利用Python语言,可以轻松实现文本比对。本文将介绍文本比对的基本概念、各种方法以及相关的代码示例,并用甘特图和旅行图帮助我们更好地理解这个过程。
## 什么是文本比对?
文本比对(Text Comparison)是指对两个或多个文本进行比较,以发现它们之间的差异和相似之处。
# Python中的JSON比对
## 引言
在现代互联网中,数据传输和存储是非常重要的,而JSON(JavaScript Object Notation)已经成为了一种常用的数据交换格式。它简洁、轻量且易于阅读和编写,被广泛应用于Web服务的API、配置文件和日志等领域。在Python中,我们可以使用内置的`json`模块来处理JSON数据。本文将介绍如何在Python中进行JSON比对,并通
原创
2023-12-23 05:28:51
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大家好,本文将围绕python文件对比结果生成txt文件展开说明,python数据比对怎么做是一个很多人都想弄明白的事情,想搞清楚python 比对文件内容需要先了解以下几个事情。Source code download: 本文相关源码 大家好,又到了 Python 办公自动化专题如果你经常与 Excel 或 Word 打交道,那么从两份表格 / 文档中找到不一样的元素是一件让人很头疼的工作,当
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2024-08-20 09:25:38
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python因为其简单易学,数据开源,并且功能强大,因此受到很多程序员的欢迎,下面我来手把手的教你用python做项目,希望能够帮到各位。为了方便大家的了解,我对各个函数的功能和代码都加了注释,一般即使没有编程经验的人也能够轻而易举的看懂以下代码(该代码复制后也可以直接运行,不过其中加载的库本地需要安装得有,比如difflib库,win32api等)。下面简单介绍该项目的内容:该项目是为了实现对文
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2023-09-08 19:47:42
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