简介基因表达调控机制是后基因组时代一个重要的研究内容。基因表达调控包括转录水平、转录后水平和翻译水平的调控。转录水平调控 转录水平的调控是指通过改变转录速率从而改变基因表达的水平,其对遗传信息的传递的准确性和多样性具有重要的作用。真核生物的转录调控包括多种形式,例如DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑、转录因子等。转录后水平调控 真核生物基因转录在细胞核内进行,而翻译则在细胞质中进行,因此转录后调
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2024-08-19 10:34:07
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今天来说说单细胞转录组数据的细胞轨迹分析,学会这些分析结果,距离发文章就只差样本的选择了,有创新性的样本将成为文章的亮点,并不是分析内容了!这期继续介绍 Monocle 3 软件包用于研究细胞拟时性分析也就是细胞的生长发育轨迹分析。前 言单细胞转录组测序(scRNA-seq)实验使我们能够发现新的细胞类型,并帮助我们了解它们是如何在发育过程中产生的。Monocle 3包提供了一个分析单细胞基因表达
摘要癌症是由正常基因表达失调所致,所以基因调控研究对癌症研究至关重要。
为了深入了解调控癌症中异常基因表达模式的转录和表观遗传因子,刘小乐团队开发了Cistrome癌症网络资源(http://cistrome.org/CistromeCancer/)。他们整合了来自癌症基因组图谱(TCGA)的超过10,000个肿瘤分子谱的模型,以及超过23,000个
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2021-03-26 09:02:00
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GENIE3 GENIE3(GEne Network Inference with Ensemble of trees), 使用基于树的集成学习算法,来通过基因表达数据来推断基因调控网络。 小知识点: GENIE3末尾的3并不是指GENIE的第三版本,而是因为通过法语口音来发音的话, tree 和 ...
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2021-05-08 21:36:00
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问题:调控黄瓜叶片苦味的基因是()。参考答案如图所示
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2024-02-03 10:19:44
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植物花器官的类型(如萼片、花瓣、雄蕊和心皮等)有限,但
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2023-05-02 22:31:50
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欢迎关注”生信修炼手册”!本文解读的文献标题如下Exon-intron circular RNAs regu
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2022-06-21 06:23:08
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单细胞测序 基因调控网络 Gene regulatory networks基因不是独立发挥作用的。相反,基因的表达水平是由与其他基因和小
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2023-10-31 14:45:11
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类似篇:转录因子motif TSS区域富集分析 | motif enrichment | HOMER | FIMO | MEME 一个新的领域,现在我关注的是可变剪切调控因子,如PTBP1,它们有特定的RNA结合motif,类似TF。 相同点: 都是蛋白质的序列结合区域 有特定的序列motif 不同 ...
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2021-08-08 23:12:00
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中新社上海4月10日电 (记者 许婧)记者10日从同济大学获悉,同济大学研究团队与剑桥大学研究团队合作,发现了人类基因新型调控密码,为发育异常和癌症等各类疾病的个性化治疗提供新思路。
相关成果9日23时在线发表于《自然》(Nature)杂志。
人体生长发育所需要的一切信息都蕴藏在人类基因组中。转录因子常以协同作用的方式解读不同DNA序列所蕴含的各类信息,通过调控基因的时空特异性
在2019/08/07的Nature刊中,中科院景乃禾课题组发表了文章——M
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2023-05-07 23:00:54
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▼述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析(ChIP-seq基本分析...
原创
2023-05-02 22:50:41
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了,如何快速查找指定基因的调控网络介绍了使用在线查询数据库 (http://evexdb.org/)对PubMed和PubMed Central中发表文章的摘要和全文为依据进行文本挖掘探寻基因直接可能的相互作用的工具。反响很好,但现在网站似乎出了点问题,获得的相互作
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2023-07-19 13:17:41
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还是有邹全老师,但毕竟也是成都的大学,这很正常,有合作,我是没搞懂,倒是有代码和数据集,但是我是处理不了
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2023-08-13 11:06:33
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从hub基因到TF-miRNA-mRNA网络的构建,核心是“多数据库预测提效+实验验证去伪+临床背景锚定”。需注意每一步的筛
2024年4月3日,Peter R. Girguis、Sergey Ovchinnikov、Yunha Hwang、Andre L. Cornman和Elizabeth H. Kellogg几人在Nature Communi
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2024-04-24 11:07:17
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在对动植物杂交种(或F1子代)的基因组和转录组的关联研究中,要回答这么一个问题:基因组变异到底与基因表达有什么关系? 这个问题很难,因为涉及影响基因表达调控的因素可太多了!多少科研人员围绕着这个问题研究毕生。 但不可避免的要做等位基因特异性表达(allele-specific expression,
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2022-09-01 11:37:39
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项目背景众所周知,电力是推动经济社会发展重要的基础设施建设之一。目前,我国的电力行业发展已经处于全球领先水平,电力工业遵循新发展理念,不断加快调整优化,转型升级,着力构建清洁低碳、安全高效的现代电力工业体系,积极惠及广大电力用户,支撑和保障经济社会持续健康发展。 在我国电力建设的过程中,西藏自治区由于特殊的自然地理与社会历史原因,电力发展一直处于相对滞后的地位,是我国电网孤网运营最多的地
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2024-01-14 15:22:46
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为充分理解组织中单细胞的基因表达调控,需要在单细胞水平以空间分辨率的方式集成不同分子信息的不同层面,包括表观基因组和转录组数据。虽然单细胞多组学方法可以捕捉来自不同分子层的信息,但是空间组学方法到目前为止主要局限于一层分子。张等人 (Spatial epigenome–transcriptome co-profiling of mammalian tissues)在 Nature 上介绍了两种用于
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2024-03-20 22:38:23
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