1 简介 HMDB数据集是当前识别动作研究领域最为重要的几个数据集之一。随着每天近10亿个在线视频的观看，计算机视觉研究的一个新兴前沿领域是视频识别和搜索。尽管人们在收集和注释包含数千种图像类别的大型可伸缩静态图像数据集方面付出了大量努力，但人类行为数据集却远远落后于此。 为此，Brown university大学于2011年发布HMDB51数据集，该数据集视频多数来源于电影，还有一部分来自公共数
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2023-10-26 17:54:12
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一、定义数据库（DB）：数据库是将大量数据保存尔来，通过计算机加工而成的可以进行高效访问的数据集合；数据库管理系统（DBMS）:是一种操纵和管理数据库信息的大型管理软件，用于建立，使用和维护数据库；二、DBMS的优势 1. 共享数据 2. 实现了数据读写以及编辑自动化 3.解决了从大量数据中提取信息困难的问题 4. 解决了误删、系统故障突发事故引起的数据丢失问题三、DBMS的种类 1.
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2023-12-21 02:02:58
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NetCDF(nc)数据读取与格式转换NetCDF(network Common Data Form)网络通用数据格式是由美国大学大气研究协会(University Corporation for Atmospheric Research，UCAR)的 Unidata 项目科学家针对科学数据的特点开发的，是一种面向数组型并适于网络共享的数据的描述和编码标准。目前，NetCDF广泛应用于大气科学、水
# HMDB数据库与Python的结合应用
HMDB（Human Metabolome Database）是一个重要的生物信息学数据库，专注于人类代谢组的研究。它包含详细的代谢物信息，如代谢物的结构、功能、浓度、化学性质等，为生命科学和医学研究提供了强有力的支持。本文将介绍如何使用Python访问HMDB数据库，并提供一些代码示例帮助读者理解。
## HMDB数据库的基本结构
HMDB数据库
HDMB网站有一个特别不友好的地方是： 搜索相应太慢，成功率还低，这个简直太不爽了。不过白天体验明显好于晚上体验…原因自己品吧效果图工具使用部分效果根据HMDBID下载结果设置搜索条件搜索结果解析成Excel文件...
原创
2022-04-12 13:43:24
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一 模块介绍1、什么是模块？#常见的场景：一个模块就是一个包含了python定义和声明的文件（文件名就是模块名字加上.py的后缀），模块可以被导入使用。
#但其实import加载的模块分为四个通用类别：
1 使用python编写的.py文件
2 已被编译为共享库或DLL的C或C++扩展
3 把一系列模块组织到一起的文件夹（注：文件夹下有一个__init__.py文件，该文件夹
HMDB数据库（Human Metabolome Database）是一个包含人类代谢物的综合数据库，提供了丰富的代谢物信息以及其相关的生物信息。本文将逐步展示如何使用Python下载和解析HMDB数据库，整个过程会涵盖环境预检、部署架构、安装过程、依赖管理、扩展部署和最佳实践多个方面。
## 环境预检
在进行HMDB数据库的下载和解析之前，我们首先需要对环境进行预检，确保我们的机器具备必要的
一边学习，一边总结，一边分享！写在前面关于GO背景基因集文件的制作，我们在很早以前也发过。近两天，自己在分析时候，也是被搞了头疼。想重新制作一份GO背景基因集，进行富集分析。但是结果，也不如意。以及在制作的过程中，也是跟随着以前的教程制作，发现以前整理的教程比较乱，那么借此机会，也进行整理，重新进行记录。本期教程前言我们在做转录组数据分析时，大多数都会进行功能富集分析，预测目的基因所具有的的功能。
数据可视化是数据处理工作中的一个重要部分，在项目早期阶段，我们常常需要做很多数据分析来深入了解数据。创建数据可视化能帮我们更清楚和容易的理解数据集，特别是高维度数据集。Matplotlib 是一个很受欢迎的 Python 程序库，用它可以很容易的创建数据可视化。不过，每次开展新项目时我们都要设置数据、参数、图表和绘图等，这会非常麻烦和混乱。在本文我们会讨论 5 种数字可视化方式，用 Python
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2023-07-28 20:05:07
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。网页爬虫需要我们了解URL的结构、HTML语法
原创
2023-05-07 23:06:42
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golang逐行读取文件内容1. 背景周末花了两天写了一个爬取、并解析HMDB数据库的工具，为了能够根据下载定义HMDB-I
原创
2022-04-29 06:27:11
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golang读取JSON文件1. 背景周末花了两天写了一个爬取、并解析HMDB数据库的工具，为了能够根据需要修
原创
2022-04-29 06:27:04
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golang判断文件是否存在1. 背景周末花了两天写了一个爬取、并解析HMDB数据库的工具。这个网站搜索功能特别难用：响应时
原创
2022-04-29 06:27:16
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目录Environment 环境Reference 参考链接Video Datasets 视频数据集 & 加载加载 UCF101 数据集加载 HMDB51 数据集加载 Kinetics 400 数据集Video I/O 视频 I/O 操作torchvision.io.read_video()to
1、数据集下载官方链接：https://serre-lab.clps.brown.edu/resource/hmdb-a-large-human-motion-database/#Downloads百度网盘连接：https://pan.baidu.com/s/1sSn--u_oLvTDjH-BgOAv_Q?pwd=xsri提取码: xsri &n
下面Python代码是把视频格式是avi的视频转换为一帧一帧的图片import os
import numpy as np
import cv2
video_src_src_path = 'data/hmdb_data_demo' #数据集路径
label_name = os.listdir(video_src_src_path)
label_dir = {}
index = 0
for i i
原创
2021-06-03 10:41:19
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本文只主要有两个贡献。 ImageNet表明在足够大的数据集上训练网络之后，在其他的数据集甚至其它类型的任务上直接使用pre trained参数初始化能够取得很好的效果。本文探究了在足够大的视频数据集Kinetics上训练了之后在UCF101和HMDB51上能够得到非常好的效果，可以达到在目前最好的
原创
2021-05-24 12:03:45
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视频理解学习笔记（一）：双流卷积神经网络两句话总结双流卷积神经网络论文概览方法详解Spatial stream ConvNetTemporal stream ConvNet测试方法光流什么是光流怎么预处理光流数据集UCF101（已被刷爆）HMDB51ExperimentsReferences 两句话总结双流卷积神经网络两个神经网络，一个学习空间信息，一个学习时序信息。在学习时序信息的网络中，传统
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2023-11-06 23:39:21
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导读MetaboAnalyst是一款基于网络的用于代谢组学数据分析、注释，并整合其他组学数据的工具套件。本文介绍了这一实用工具的更新版本——MetaboAnalyst 4.0。这次更新增加了四个新的关键特性，并重新设计了用户界面，其基础知识库的更新也基于人类代谢组数据库（HMDB）的最新数据。论文ID原名：MetaboAnalyst 4.0: towards more transparent an
环境准备接着上一篇文章Oracle11gDataGuard物理备用数据库搭建与配置(第1部分主数据库实例创建)在我的测试环境中，我准备了两台CentOS7.4虚拟机，并同时都安装了Oracle11gR2的11.2.0.1.0企业版的数据库软件，其中只有主服务器创建一个数据库实例，备用服务器仅安装Oracle数据库软件。主数据库:OS:CentOS7.4Hostname:hmdb11dg-db1Or
原创
2018-03-23 17:03:07
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