在17年11月写《小提琴图的画法》一文时,想找小提琴图相关的材料都很费劲,而今天已经是随处可见!感觉能用箱型图展示的数据都已改用小提琴图展示。这也归功于能绘制小提琴图工具越来越多。除了可以用R包(如vioplot,ggplot2等),OmicShare在去年5月份推出了小提琴图工具,之后约半年后,传统的科研作图软件Origin和GraphPad Prism也先后在其最新的版本中加入了小提琴图绘制功
# 如何使用ggplot绘制多组箱图
## 整体流程
下面是使用R语言中的ggplot库绘制多组箱图的整体流程:
```mermaid
journey
title 绘制多组箱图流程
section 数据准备
section 绘制图表
section 添加图表元素
section 设置图表风格
section 保存并展示图表
```
## 数据
原创
2023-09-30 04:28:31
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原创 黄小仙即便小仙同学决定学习R语言来提升自己作图的“逼格”的时候,心中还有有些疑虑的(嘿嘿,我这么懒,可不愿意做无用功了?)。仔细想了想,貌似又找到了两个学习R的理由。一是R可以帮助我们避免重复劳动,实现“一劳永逸”的终极梦想。尽管非常不想承认这一事实,在科研的过程中,小仙同学制造出了大量“无效”的数据(sign…),但也不得不“绞尽脑汁”、“竭尽全力”地进行花式分析,试图找出合理的解释。这时
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2023-09-20 06:38:52
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1.什么是小提琴图?小提琴图是箱线图的变种,展示了任意位置的密度,通过小提琴图可以知道哪些位置的密度较高。外部形状即为核密度估计(在概率论中用来估计未知的密度函数,属于非参数检验方法之一)。本文我们就来讨论一下小提琴图是如何绘制的以及如何对其进行解读。2.绘图前的数据准备 demo数据可以在https://www.bioladder.cn/shiny/zyp/bioladder2/demoData
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2023-07-07 23:34:58
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# R语言小提琴图(Violin Plot)及其绘制方法
在数据可视化中,箱线图是用来展示数据分布和离散程度的一种常用图表,它包含了中位数、上下四分位数和异常值等信息。然而,在某些情况下,箱线图可能无法充分展示数据的累积分布情况,无法揭示数据分布的更多细节。为了解决这个问题,小提琴图(Violin Plot)被提出并广泛应用。
## 什么是小提琴图?
小提琴图是一种通过将核密度估计和箱线图结
原创
2023-08-17 11:46:59
405阅读
# R语言小提琴图多组分析
在生物统计学和数据可视化的领域,小提琴图是一种非常有效的工具。它能够同时显示数据的分布情况和集中趋势,适合多组数据的比较。本文将带你了解如何使用R语言进行小提琴图的多组分析,并提供相关代码示例。
## 什么是小提琴图?
小提琴图结合了箱形图和密度图的优点,能够清晰地表现数据的分布情况。其形状如同一个小提琴,左右两侧的轮廓显示了数据的分布密度,而中间的线则反映了数据
今天又学习了两种新的图形绘制方法,并且学会了全局设置中文字体的方法。全局中文字体设置及负数显示问题plt.rcParams['font.family'] = 'sans-serif'
plt.rcParams['font.sans-serif'] = 'SimHei'#SimHei是一种中文字体如果显示出来是一些小方块而不是中文,那是因为在matplotlib的配置文件下没有找到合适的中文字体 解
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2024-08-16 13:03:06
69阅读
# R语言热图简述与使用教程
## 简介
热图是一种可视化技术,用于展示矩阵型数据中不同值之间的关系和变化趋势。在R语言中,可以使用gplots包来实现生成热图。本篇文章将介绍如何利用R语言和gplots包来生成热图,并提供详细的步骤和代码示例。
## 整体流程
下面是生成热图的整体流程。我们将按照以下步骤进行操作:
| 步骤 | 操作 |
| ---- | ---- |
| 1 | 安
原创
2023-10-13 06:51:32
216阅读
数据格式是这样的。数据第A列是病人ID,B~E列是临床信息,其他列是病人的RNAseq数据。你可以保存副本导出,然后自己读入。library(ggplot2)
library(grid)
library(RColorBrewer)
library(dplyr)
library(SuppDists) #提供rJohnson()函数data <- read.csv("BioInfoNotesDa
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2023-08-28 14:19:27
897阅读
# Python多组数据提琴图的科普介绍
## 概述
提琴图(Violin Plot)是一种结合了小提琴图和箱形图(Box Plot)的数据可视化工具。它能够有效地展示不同组之间的分布情况,适合用来比较多组数据的取值及其分布形态。本文将介绍如何在Python中绘制提琴图,并搭配相应的代码示例。
## 提琴图的特点
1. **密度估计**:提琴图通过核密度估计为每个类别生成一个分布曲线,使得
原创
2024-10-22 04:52:53
136阅读
# R语言ggplot2多组柱状图、误差线
## 引言
在数据分析和可视化领域中,柱状图是一种常用的图表类型,用于展示不同类别或组之间的比较。R语言中的ggplot2包提供了一个强大的工具集,可以轻松创建多组柱状图,并添加误差线以展示数据的不确定性。本文将介绍如何使用ggplot2包创建多组柱状图,并解释如何添加误差线。
## ggplot2简介
ggplot2是R语言中的一个基于格子系统
原创
2023-09-02 14:47:35
729阅读
# 使用R语言ggplot2多组图保存为eps
在数据可视化领域,R语言的ggplot2包是一个非常流行的工具,它可以帮助我们创建美观且具有实用性的图表。在本篇文章中,我们将介绍如何使用ggplot2包创建多组图,并将其保存为eps格式。
## ggplot2简介
ggplot2是一个基于图形语法的绘图系统,它由Hadley Wickham开发并维护。ggplot2的设计理念是将数据、图形和
原创
2024-03-29 03:22:57
347阅读
前言ggplot是一个拥有一套完备语法且容易上手的绘图系统,在Python和R中都能引入并使用,在数据分析可视化领域拥有极为广泛的应用。本篇从R的角度介绍如何使用ggplot2包,首先给几个我觉得最值得的理由:采用“图层”叠加的设计方式,一方面可以增加不同的图之间的联系,另一方面也有利于学习和理解该package,photoshop的老玩家应该比较能理解这个带来的巨大便利适用范围广,拥有详尽的
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2024-05-23 07:27:49
57阅读
# 如何实现“r语言 小提琴图”
## 1. 流程概述
为了帮助你理解如何在R语言中绘制小提琴图,我整理了以下步骤和代码示例。请跟随我的指导逐步实现这个任务。
| 步骤 | 描述 |
| --- | ---- |
| 1 | 安装并加载必要的包 |
| 2 | 准备数据集 |
| 3 | 绘制小提琴图 |
## 2. 具体步骤及代码示例
### 步骤1:安装并加载必要的包
在R语言中,
原创
2024-07-14 09:46:45
45阅读
箱线图 boxplot简述原理绘制方法python - matplotlib加载功能模块加载数据绘制boxplotpython - seaborn加载功能模块加载数据绘制boxplotR - ggplot加载功能模块加载数据绘制boxplot 简述因图形形状如箱子而得名。箱线图常用于展示一组连续型数据的分散情况。学术界普遍认为,箱线图由美国数学家M.E.斯皮尔于1960年提出,由美国统计学家J.
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2024-09-24 12:45:26
74阅读
# 介绍
在数据可视化领域,ggplot是一种非常流行的R语言包,它提供了一种简洁而灵活的方式来创建高质量的图表。本文将介绍如何使用ggplot来绘制Iris数据集的图表,展示出其功能和优点。
# Iris数据集
Iris数据集是一个经典的数据集,包含150个样本和4个特征。每个样本代表一个鸢尾花的观测值,而特征则包括鸢尾花的花萼长度、花萼宽度、花瓣长度和花瓣宽度。这个数据集是非常适合用于数
原创
2023-10-14 09:06:46
94阅读
# 使用 R 与 ggplot2 创建热图
## 1. 热图的创建流程
在 R 中创建热图,最常用的工具是 `ggplot2` 包。下面我们将通过几个步骤来指导你如何使用这个包来创建热图。在开始之前,你可以参考以下流程表。
| 步骤 | 描述 | 代码 |
|------|---
原创
2024-08-25 06:55:33
118阅读
R语言的一个优势就是在于其强大的制图功能,其中ggplot以强大的制图能力著称,ggplot制图系列我会一直慢慢的写下去,除此之外还会更新GraphPad Prism制图系列。今天来说下,ggplot制作条形图,条形图也叫柱形图,用于显示各项之间的比较情况,常见的有单数据条形图,多数据条形图,堆积条形图,百分比条形图。 今天我们使用SPSS自带的汽车销售数据来演示条形图制作,需要使用tidyver
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2023-06-21 20:05:29
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1. DBSCAN算法原理首先介绍该算法的主要概念与参数:(1) ε值:样本与样本之间的距离阈值,如果样本A与样本B的距离小于该阈值,则认为样本A在样本B的邻域内,同时样本B也在样本A的邻域内。(2) minPts:每一个样本的邻域内样本数阈值,如果该样本邻域内的样本数大于等于该阈值,则认为该样本是核心点。(3) 核心点:即邻域内的样本数大于等于minPts的样本。如下图所示,
Python多组小提琴图
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引言
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在数据可视化中,小提琴图(violin plot)是一种用于展示数值型数据分布情况的图表。它通过展示数据的核密度估计曲线和盒图的结合,既能展示数据的分布情况,又能显示数据的中位数、四分位数等统计指标。Python中有多种绘制小提琴图的工具,如seaborn、matplotlib等。本文将介绍如何使用sea
原创
2024-01-25 08:31:36
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