uniq 重复,-c (count )计重复的数量
帮助文档 https://bioinf.shenwei.me/seqkit/[https://bioinf.shenwei.me/seqkit/...
原创 2022-03-18 10:17:12
1123阅读
 下面分别介绍这两种格式FASTAFASTA常作为存储有顺序的序列数据的文件后缀,包括我们常用的参考基因组序列、蛋白质序列、编码DNA序列(coding DNA sequence,CDS)、转录本序列等文件。后缀常用.fasta,也有用.fa 或 .fa.gz (gz压缩) 。 FASTA文件主要有两个部分:序列头信息(有时包括一些其他描述信息):头信息独占一行,以(>)开头作为识
常规方法 Bioseq模块方法 单行命令
原创 2022-05-31 21:22:41
119阅读
1、FASTA文件的格式在生物信息学中,FASTA格式(又称为Pearson格式)是一种基于文本的、用于表示核苷酸序列或氨基酸序列的格式。在这种格式中碱基对或氨基酸用单个字母来表示,且允许在序列前添加序列名及注释。FASTA文件以序列表示和序列作为一个基本单元,各行记录信息如下:第一行是由大于号">"开头的任意文字说明,用于序列标记,为了保证后续分析软件能够区分每条序列,单个序列的标识必须具
欢迎关注”生信修炼手册”!在NGS数据分析中,常常需要对fasta/fastq文件进行一些处理,fastx_
原创 2022-06-21 05:51:59
1175阅读
uniq常用于管道中,用来删除已使用sort排序完成的重复记录。 uniq有3个好用的选项: -c 可在每个输出行之前加上该行重复的次数; -d 仅显示重复的行 -u 仅显示未重复的行
转载 2017-01-01 01:26:00
60阅读
2评论
1、一行代码实现1--100之和In [1]: sum(range(1,101))Out[1]: 50501-100求和2、如何在一个函数内部修改全局变量a=520deffun():globalaa=1314fun()print(a)3、列出5个python标准库sys通常用于命令行参数datatime日期相关函数os与操作系统相关函数time时间相关函数re正则表达式4、字典如何删除键和合并两个
uniq重选项:-c:重后,统计出现的次数,重的时候必须得先排序,因为uniq只能去重挨着的查看日志前10访问量的ipawk'{print$1}'access.log|sort|uniq-c|sort-k1-nr|head-10#默认是10行
原创 2020-10-27 17:51:57
4053阅读
0.代码(读取方法):package org.bdge
原创 2023-01-04 10:54:46
146阅读
在Linux操作系统中,uniq命令是一种用于查找和删除重复行的实用工具。uniq命令通常与sort命令结合使用,这样可以对文件进行排序并找出其中的重复行。uniq命令的一大特点是它可以显示重复行的次数,这对于处理数据文件中的重复信息非常有用。 uniq命令的基本语法是: ``` uniq [options] [input_file [output_file]] ``` 其中,input_f
sort -u 和 uniq都能起到删除重复信息的功能,那么他们的区别究竟在哪呢?$ cat test              jasonjasonjasonfffffjason下面分别执行三个命令1:sort -u testsort -u testfffffjason2: uniq test$uniq test jasonf
转载 精选 2014-05-05 11:55:32
955阅读
重复行通常不会造成问题,但是有时候它们的确会引起问题。此时,不必花上一个下午的时间来为它们编制过滤器,uniq 命令便是唾手可得的好工具。了解一下它是如何节省您的时间和精力的。 进行排序之后,您会发现有些行是重复的。有时候该重复信息是不需要的,可以将它除去以节省磁盘空间。不必对文本行进行排序,但是您应当记住 uniq 在读取行时会对它们进行比较并将只除去两个或更多的连续行。下面的示例说明了它实际
转载 2010-10-14 06:05:38
439阅读
重复行通常不会造成问题,但是有时候它们的确会引起问题。此时,不必花上一个下午的时间来为它们编制过滤器,uniq 命令便是唾手可得的好工具。     了解一下它是如何节省您的时间和精力的。进行排序之后,您会发现有些行是重复的。有时候该重复信息是不需要的,可以将它除去以节省磁盘空间。不必对文本行进行排序,但是您应当记住 uniq 在读取行时会对它们进行比较并将只除去两
转载 精选 2008-12-30 09:45:00
277阅读
命令uniq经常用于去除一个文本中的重复行。用sort命令也可以去除重复行,但二者有较大区别:用sort去除重复行时,sort将整个文本中的多个重复行去除,仅保留一行,而uniq会将多个连续重复的行去除,仅保留一行。 命令格式: uniq [option] [input [output]] 常用选项: c:输出重复行的重复次数。 d:仅输出重复的行。 f:忽略一些字段,...
转载 2013-12-09 09:21:00
203阅读
2评论
1、查找文件内的关键字  1 cat test | grep "key" //非全词匹配 2 grep "key" test //非全词匹配 3 grep -w "key" test //全词匹配 4 grep -i "key" test //忽略大小写 2、
注意:需要先排序sort才能使用去重。 Linux uniq命令用于检查及删除文本文件中重复出现的行列。 uniq可检查文本文件中重复出现的行列。 语法 参数: 实例 文件testfile中第2 行、第5 行、第9 行为相同的行,使用uniq命令删除重复的行,可使用以下命令: testfile中的原
转载 2017-07-16 05:05:00
864阅读
2评论
uniq只可以将相邻行重复数据进行重处理:[root@localhost /data/mysql/mysql3306]#last
转载 2017-07-27 13:33:00
75阅读
2评论
uniq只可以将相邻行重复数据进行重处理:[root@localhost /data/mysql/mysql3306]#last | cut -d ' ' -f 1 | tail -15 > test#将用户登录信息last的输出以空格分隔,截取首列(注意一行的文字内容之间可能有多个空格,所以用cut -k 1,5这样的参数得不到想要的(显示第一和第五列)结果),因为内容过多,仅取用末15
原创 2017-07-27 13:32:58
1475阅读
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5