查看原文>>>R语言生物群落（生态）数据统计分析与绘图R 语言作的开源、自由、免费等特点使其广泛应用于生物群落数据统计分析。生物群落数据多样而复杂，涉及众多统计分析方法。本内容以生物群落数据分析中的最常用的统计方法回归和混合效应模型、多元统计分析技术及结构方程等数量分析方法为主线，通过多个来自经典研究中的实例，详细讲述各方法的R语言实现途径。本文主要特点为聚焦生态学研究领域，从R
Introduction统计分析在生物信息学中具有非常重要的意义，因为生物信息学研究的数据量庞大、复杂性高，而统计分析可以帮助我们更好地理解和解释这些数据。下面是统计分析对生物信息学的几个重要意义：数据清洗和预处理：生物信息学研究中经常需要处理大规模的数据，而这些数据可能存在噪声、错误和缺失值等问题。统计分析可以帮助我们对数据进行清洗和预处理，以确保数据的质量和可靠性。数据可视化：统计分析可以帮助
R 语言作的开源、自由、免费等特点使其广泛应用于生物群落数据统计分析。生物群落数据多样而复杂，涉及众多统计分析方法。本课程以生物群落数据分析中的最常用的统计方法回归和混合效应模型、多元统计分析技术及结构方程等数量分析方法为主线，通过多个来自经典研究中的实例，详细讲述各方法的R语言实现途径（详见教学内容）。主要特点为聚焦生态学研究领域，从R语言基础操作和作图、数据准备整理，到各种数量分析方法的应用情
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2023-10-17 23:00:14
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R 语言作的开源、自由、免费等特点使其广泛应用于生物群落数据统计分析。生物群落数据多样而复杂，涉及众多统计分析方法。本文以生物群落数据分析中的最常用的统计方法回归和混合效应模型、多元统计分析技术及结构方程等数量分析方法为主线，通过多个来自经典研究中的实例，详细讲述各方法的R语言实现途径。本文的主要特点为聚焦群落生态学研究领域，从R语言基础操作和作图、数据准备整理，到各种数量分析方法的应用情景分析，
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2023-06-25 08:55:57
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文章目录基本统计分析1基本方法summary()函数apply()函数lapply()函数sapply()函数2.常见的描述指标标准误binom.test (二项分布精确检验)变异系数极差偏度系数（skewness）3分组计算描述性统计量aggregate()函数by()函数频数表和列联表列联表生成频数表一维列联表二维列联表3多维列联表非参数检验假设检验（Hypothesis Testing）符
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2023-09-18 21:54:12
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1.为何使用R与起源于贝尔实验室的S语言类似，R也是一种为统计计算和绘图而生的语言和环境，它是一套开源的数据分析解决方案，由一个庞大且活跃的全球性研究型社区维护。但是，市面上也有许多其他流行的统计和制图软件，如Microsoft Excel、SAS、IBM SPSS、Stata以及Minitab。为何偏偏要选择R？ R有着非常多值得推荐的特性。 多数商业统计软件价格不菲，投入成千上万美元都是可
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2023-08-17 16:48:23
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这个问题，作为理论计算机科学的核心问题，其声名早已经超越了这个领域。它是Clay研究所的七个百万美元大奖问题之一，在2006国际数学家大会上，它是某个1小时讲座的主题。
要说起P和NP是什么东西，得先从算法的多项式时间复杂度谈起，注意，这里面的两个P都是指Polynomial(多项式)。
一个问题的规模指的是输入的总位数，比如一个n个数的排序问题，输入规模就是n。注意，
R 语言作的开源、自由、免费等特点使其广泛应用于生物群落数据统计分析。生物群落数据多样而复杂，涉及众多统计分析方法。本内容以生物群落数据分析中的最常用的统计方法回归和混合效应模型、多元统计分析技术及结构方程等数量分析方法为主线，通过多个来自经典研究中的实例，详细讲述各方法的R语言实现途径（详见教学内容）。主要特点为聚焦群落生态学研究领域，从R语言基础操作和作图、数据准备整理，到各种数量分析方法的应
目录①R语言生物群落（生态）数据统计分析与绘图 ②R语言多元数据统计分析在生态环境中的实践应用①R语言生物群落（生态）数据统计分析与绘图暨融合《R语言基础》、《tidyverse数据清洗》、《多元统计分析》、《随机森林模型》、《回归及混合效应模型》、《结构方程模型》、《统计结果作图》七合一版本教学方案R 语言作的开源、自由、免费等特点使其广泛应用于生物群落数据统计分析。生物群落数据多样而
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2023-10-14 22:50:09
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作者：黄天元，复旦大学博士在读，热爱数据科学与开源工具（R/Python），致力于利用数据科学迅速积累行业经验优势和科学知识发现，涉猎内容包括但不限于信息计量、机器学习、数据可视化、应用统计建模、知识图谱等。前文提要：HopeR：全自动机器学习项目启动HopeR：全自动机器学习：自动特征筛选（A）本次试验要做的是，采用一些通用的方法来做自动特征筛选。尽管后面有想法自己做轮子，但是在自己做之前，我们
目的： 1. 计算自定义模序在所有蛋白质的匹配位点和次数 2. 输出超过阈值的蛋白质序列到Hit_sequences.fasta 3. Hit_sequences.fasta中序列用小写字母，匹配用大写字母 4. 返回一个数据框，内容包存储ID、注释行(anno)括——、长度(len)、匹配位置（Position），匹配次数(Hits)，相应序列（tag）一、问题思考：1. 如何快速计算匹
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2023-08-23 16:19:03
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8月月底参加了菲沙基因的生信线上课程，直播听了一节，讲得有些啰嗦，听不下去，自己又有一些基础，于是凭课件自学。第一章为R背景及基础介绍，没有做过多改动，有兴趣学习的同学可以参加他们的线上课程。1.1 R语言背景
R语言是诞生于1976年左右的S语言的一个分支。而S语言是由A&T贝尔实验室的John Chambers于1976年开发的一种用来进行数据探索、统计分析、作图的解释
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2023-07-07 14:48:35
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基础操作 #获取当前脚本所在位置
getwd()
#更改脚本位置
setwd(dir = "C:/Users/LG/Desktop/R") #注意斜杠是正斜线
#查看当前目录下存在的文件
dir()x<-5 #赋值给局部变量
y<<-3 #赋值给全局变量x <- sum(1,2,3,4,5)
y <- 5
rm(x,y)
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2023-10-25 20:59:02
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【R语言数据科学】(十四)：随机变量和基本统计量✨本文收录于【R语言数据科学】本系列主要介绍R语言在数据科学领域的应用包括： R语言编程基础、R语言可视化、R语言进行数据操作、R语言建模、R语言机器学习算法实现、R语言统计理论方法实现。文章目录【R语言数据科学】(十四)：随机变量和基本统计量前言1.随机变量2.抽样模型3 随机变量的概率分布4.基本统计量5.总体方差和样本方差前言在数据科学中，我们
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2023-06-07 12:47:26
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“ 本章节是数据预处理的第一步：了解数据（集）。只有充分了解了数据，我们才能对数据做进一步的预处理和后续深入的分析。”目录1 数据结构str()dim()head()2 描述性统计分析summary()psych::describe()分组计算doBy::summaryBy分组计算psych::describeBy3 频数和列联表table 一维计数xtabs 多维（交叉）计数gmo
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2023-06-21 18:32:19
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Chapter 2 Data Collection本篇是第二章，内容是数据收集。1.数据来源做科学研究离不开数据，而数据的来源有哪些呢？ 这里比较简单地将数据来源分为两类：直接（一手）数据和间接（二手）数据。 直接数据的数据获取来源包括：观测、调查、实验。 间接数据的数据获取来源包括：出版物、互联网等。 接下来分别谈谈这几个来源。 观测——自然科学里有观测，如气象气候、植物生长期等，社会科学同
在数据挖掘中，统计学习方法常常用到R语言，因此，我们后面将对R语言在统计学习中的应用进行专题介绍，方便从理论上对统计学习有进一步深入的认识。1初始步骤开始运营R很简单，一种可以从系统菜单启动，双击图标或在系统命令行中输入命令”R“。这将产生一个控制台窗口，或在当前终端窗口启动一个交互式程序。在这两种情况下，R都是通过问答模式工作，即输入命令行并按下Enter键，然后程序运行，输出相关结果，继续要求
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2023-08-30 20:53:51
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一、R语言的安装我所做的R语言学习主要是为应对工作上的生信分析，如果你是往这个方向走，那么这篇文章很大可能会帮助你。如果你也是有python基础的话，那我写的可能会更対你口味。不过现在看到这篇文章可能比较杂乱，到时候等我学完会做个完整的系统整理。第一步，安装R：https://www.r-project.org/第二步，安装RStudio：http://www.rstudio.com/ide至于背
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2023-06-20 14:48:44
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一、 统计学习概述 统计学习是指一组用于理解数据和建模的工具集。这些工具可分为有监督或无监督。1、监督学习：用于根据一个或多个输入预测或估计输出。常用于商业、医学、天体物理学和公共政策等领域。2、无监督学习：有输入变量，但没有输出变量，可以从这些数据中学习潜在关系和数据结构。以下简单的用3个数据集来说明。1、工资数据 我们希望了解雇员的年龄、教育和年份
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2023-10-25 10:22:36
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目的: 1.描述性统计分析 2.频数表和;列连表 3.相关系数和协方差 4.t检验 5.非参数统计在上一节中使用了图形来探索数据,下一步就是给出具体的数据来描述每个变量的分布和关系1.描述性统计分析 探究案例:各类车型的油耗如何?对车型的调查中,每加仑汽油行驶的英里数分布是什么形式(均值,标准差,中位数,值域等) 1.1使用内置的summary函数来获取最小值,最大值,四分位数和数值
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2023-08-22 11:29:50
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