什么是CNV？ copy number variation (CNV) A copy number variation (CNV) is when the number of copies of a particular gene varies from one individual to the
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2021-05-07 14:49:00
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单细胞测序主要涉及单细胞基因组测序和转录组测序两个方面，分别针对单细胞DNA及RNA进行序列分析和比较。单细胞测序一直是科学家关注的一个热点。单细胞基因组测序目前主要有两种扩增方法：MALBAC方法及MDA方法，而单细胞转录组目前主要有三种方法：SMART扩增技术、10×genomics技术及Andeplete技术。要实现单细胞转录组测序，需要解决2个难题： 1.PCR偏差：单个细胞含有
文章目录摘要研究意义转录组学意义技术比较研究方法细胞筛选文库构建测序实验方法实验流程常见问题分析内容（重点）分析内容总览细胞亚群分类细胞类型频率统计Marker基因分析富集分析样本差异分析逆时分析WGCNA细胞通讯分析转录因子分析总结 摘要本篇笔记为基迪奥单细胞转录组第一节课程笔记，感觉他们家的课程比之前的同行水平要高一些，并且价格公道，整体课程性价比较高，鼓励大家学习，这里记录一下课程重点。研
欢迎关注”生信修炼手册”!single cell RNA sequencing,简称scRNA_seq, 指
原创
2022-09-05 13:34:57
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普通转录组的思路也可以应用到单细胞转录组。普通转录组相当于把一群细胞或一
原创
2023-04-21 12:53:50
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标准化加高变基因选择NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析 （Nature重磅综述|关于RNA
原创
2023-05-02 21:50:35
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前言NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析 （Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、C
原创
2023-05-02 21:51:46
1263阅读
聚类可视化NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你
原创
2023-05-07 22:58:26
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一、涉及的新概念参考（reference）：将跨个体，跨技术，跨模式产生的不同的单细胞数据整合后的数据集 。也就是将不同来源的数据集组合到同一空间（reference）中。 从广义上讲，在概念上类似于基因组DNA序列的参考装配。查询（query）：单个实验产生的数据集转化学习（transfer learning）：产生一个于参考数据集（reference）上进行训练的模型，可以将信息再重新...
原创
2022-03-08 14:34:50
1755阅读
欢迎关注”生信修炼手册”!在传统的测序技术中，上机测序的样本是由多个细胞构成的，最后分析得出的结论也只是基于
原创
2022-06-21 05:56:59
461阅读
在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 （原理、代码和评述）)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘（典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) - Lim...
原创
2023-05-07 22:57:59
534阅读
文章目录一、介绍二、预处理三、获取细胞周期分数四、在数据缩放期间回归出细胞周期得分五、备用工作流程
一、介绍前置知识：原创 Seurat 包图文详解 | 单细胞转录组(scRNA-seq)分析02使用Seurat包来运行，主要实现两个功能：通过marker基因计算细胞周期评分基于评分在预处理过程中，减轻单细胞转录组数据中细胞周期异质性影响
二、预处理数据来自
原创
2022-03-11 17:57:59
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分析（七）-导入10X和SmartSeq2数据Tab...
原创
2023-05-02 22:26:44
520阅读
Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（一）Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（二）Hemberg-lab单细胞
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2023-05-07 23:03:08
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单细胞测序实验方法开发scRNA-seq的新实验方法和操作手册
原创
2023-07-26 14:59:58
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Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（一）Hemberg-lab单
原创
2023-07-26 15:25:23
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整合版以网页和PDF格式发布于易生信平台。关于课程采用高通量测序技术获取单细胞水...
原创
2023-05-02 22:28:57
132阅读
Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（一）Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（二）Hemberg
原创
2023-05-07 23:03:01
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Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（一）Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（二）Hemberg-l
原创
2023-05-07 23:03:53
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欢迎关注”生信修炼手册”!对于单细胞转录组数据，通过聚类分析，我们可以得到细胞亚型，再通过差异分析，可以得到
原创
2022-06-21 05:56:15
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