原核蛋白表达是指利用原核生物(主要是大肠杆菌 (Escherichia coli),也包括枯草芽孢杆菌等)作为宿主,将外源目标基因导入并在其细胞内进行转录和翻译,从而合成重组蛋白的过程。该系统因培养快速、成本低廉、表达量高而广泛应用于科研与工业,但其缺乏真核生物的复杂后翻译修饰,且部分蛋白易形成包涵体,需要通过优化表达条件和纯化策略来获得功能性蛋白。原核蛋白表达宿主菌株与表达载体的选择1. 宿主菌
在生物技术与分子生物学中,原核蛋白表达体系(尤其是大肠杆菌蛋白表达)因操作简便、生长速度快、成本低廉,是获取重组蛋白的重要途径。然而,在高水平表达时,目标蛋白往往以包涵体蛋白形式沉淀,形成不可溶的聚集物。这种现象虽影响生物活性蛋白得率,但其高表达量、易纯化等特性使得包涵体蛋白纯化成为不可忽视的技术路线。因此,在工程过程中,提升可溶性蛋白表达与完善包涵体蛋白的纯化与复性策略,是实现高效、活性蛋白回收
蛋白在细胞膜中发挥着重要的生物学功能,包括信号转导、物质运输和细胞识别等。然而,由于其疏水性和结构复杂性,膜蛋白的表达、纯化和结构解析一直是生物学研究中的难题。近年来,无细胞蛋白表达系统(cell-free protein synthesis, CFPS)作为一种替代传统细胞表达的方法,因其高效、可控和灵活等优势,成为膜蛋白研究的重要工具。无细胞蛋白表达系统的原理无细胞蛋白表达系统是一种在体外重
大肠杆菌(Escherichia coli)作为最常用的原核宿主系统之一,在重组蛋白表达方面具有生长快、成本低、遗传操作简便等优点。然而,由于异源蛋白表达过程中常出现蛋白易聚集成包涵体、降解或表达水平低等问题,导致可溶性表达效率不高。因此,实现重组蛋白在 E. coli 中的可溶表达,是确保后续纯化、结构功能研究与应用的关键。可溶性蛋白表达的背景与挑战E. coli 表达系统是目前广泛使用的重组蛋
# 使用Biopython获取蛋白序列的方案 Biopython是一个用于生物信息学的Python库,它提供了许多用于处理生物信息数据的功能。在这里,我们将使用Biopython来获取特定蛋白的序列。 ## 问题描述 假设我们想要获取蛋白号为"Q14344"的蛋白序列,我们将通过Biopython来实现这个目标。 ## 解决方案 ### 1. 导入Biopython库 首先,我们需要导
原创 2024-02-21 07:14:50
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酵母是真核生物中最常用的异源蛋白表达平台之一。它不仅具备微生物生长迅速、培养成本低廉和遗传操作简便等优点,同时还能进行真核细胞所特有的翻译后修饰,如糖基化、二硫键形成和蛋白折叠修复等,在重组蛋白的基础研究与工业化生产中被广泛采用。目前应用最为广泛的宿主包括酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)和甲醇酵母(又称毕赤酵母,Pichia pastoris,现命名为 Komagata
实验目的熟悉蛋白质序列和结构的主要分析内容在实践中逐步理解蛋白质序列和结构的主要分析算法的基本原理实验内容综合使用多种在线工具,对蛋白质的一级、二级和三级结构进行分析和预测综合使用多种在线工具,对蛋白质的跨膜结构、翻译后修饰、亚细胞定位等进行分析和预测实验题目第一题:Nanog分析Nanog是2003年5月发现的一种转录因子,是一个有助于胚胎干细胞自我更新的关键因子,被认为在胚胎干细胞的全能性维持
与经验性方法相似的另一种办法是结构规律提取方法,这是更一般的方法。该方法从蛋白质结构数据库中提取关于蛋白质结构形成的一般性规则,指导建立未知结构的蛋白质的模型。有许多提取结构规律的方法,如通过视觉观察的方法,基于统计分析和序列多重比对的方法,利用人工神经网络提取规律的方法。同源模型化方法通过同源序列分析或者模式匹配预测蛋白质的空间结构或者结构单元(如锌指结构、螺旋-转角-螺旋结构、DNA结合区域等
CPTAC蛋白质差异分析文章目录CPTAC蛋白质差异分析@[toc]1. CPTAC数据下载2. 数据补缺校正3. 数据分组4. 蛋白质组差异分析1. CPTAC数据下载根据自己的需求选择对应的癌症,然后下载,这里就不展开讲了。以下为下载的数据目录2. 数据补缺校正从CPTAC下载的蛋白质数据很多都是有缺失值的,这样不利于我们后期分析,所以需要对这些缺失值进行补缺,然后校正(归一化)。首先新建空文
在生信研究中经常需要寻找蛋白序列的Domain,蛋白序列的Domain对于蛋白质来说是最重要的一部分,一般来说会有发挥功能的区域,结合其它物质的区域,二聚化区域等等。现在的蛋白质数据库已经很多了,但寻找Domain可以直接考虑NCBI的CD-search功能,其中包含了NCBI自带的CDD库(link),PRK库(link),以及外部的Pfam数据库(link),COG库(link),SMART库
哺乳动物瞬时蛋白表达(Transient Gene Expression, TGE)是通过将目标基因导入哺乳动物细胞,实现短时期内重组蛋白表达的方法。相比于稳定表达系统,TGE省略克隆筛选等冗长步骤,具备快速、高效的优点,尤其适用于早期药物研发、抗体表达、新型抗原生产等应用场景。常用的宿主细胞包括 HEK293 细胞系列(如 293T、293F)和 CHO 细胞系列(如 CHO-S、DG44 等)
blast基本介绍BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较。BLAST结果中的得分是对一种对相似性的统计说明。blastp是蛋白序列到蛋白库中的一种查询。库中存在的每条已知序列将逐一地同每条所查序列作一对一的序列比对。blastx是核酸序列到蛋白
 《引》       机会是需要你去铺垫创造,你去抢机会(你自己铺垫的机会也有可能被别人抢走),你去有能力抓住机会,机会并不是别人送给你的,机会是转瞬即逝的,你懂吗?       我想给大家分享一下关于文案人员,我一下子想起了王文华写过的一篇小说《蛋白质女孩》,因为我们要找的文案就是这个样子。  “她日月座是狮子和双鱼,同时会讲日文和法语。她早起,起床后先跑半小时,吃了麦片才去公司。她贤慧,每天做
原创 2020-12-30 16:07:55
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一、蛋白表达的定义蛋白表达(Protein Expression)在自然界中,基因经转录和翻译形成蛋白质,这是生命活动的基本过程。在实验和工业生产中,人们通过重组DNA技术将目标基因导入宿主细胞,使其按照设定条件大量表达,从而获得功能性蛋白蛋白表达技术是分子生物学、结构生物学和生物制药研究的重要支撑手段,为蛋白功能研究、抗体开发、疫苗制备以及酶工程等领域提供了基础。二、蛋白表达的工作流程一个完整
# 如何实现“biopython蛋白链名” ## 整体流程 为了帮助你理解如何使用Biopython来获取蛋白链名,我将整个过程分解为几个步骤,并在下面的表格中展示每个步骤所需的操作: | 步骤 | 操作 | | ---- | ---- | | 1 | 从NCBI获取蛋白链序列 | | 2 | 解析蛋白链序列 | | 3 | 获取蛋白链名 | ## 具体步骤 ### 步骤1:从NCBI获
原创 2024-04-27 03:34:45
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基因组编辑是在基因组水平对基因进行精确、定向修饰的一种高效生物技术方法。简单、高效的CRISPR/Cas9编辑体系的出现给生命科学带来了新的技术革命。CRISPR/Cas9通常在基因组靶向位点造成DNA碱基的添加或删除,导致基因功能的缺失。近日,中国科学院遗传与发育生物学研究所高彩霞研究组建立了一个通过CRISPR/Cas9高效调控内源mRNA翻译的方法。该方法可通过提高蛋白质翻译效率,增加目标基
# Python计算蛋白大小的科普文章 蛋白质是生命的基本构件之一,它们在生物体中发挥着重要的作用。蛋白质的大小和结构直接影响其功能。今天,我们将探讨如何使用Python编程语言来计算蛋白质的大小(分子量)以及其他相关知识。 ## 1. 蛋白质的基本知识 蛋白质由氨基酸通过肽键连接而成。在人体内,常见的氨基酸大约有20种。每种氨基酸都有不同的分子量,通常用道尔顿(Da)或千道尔顿(kDa)来
原创 8月前
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重组蛋白的高效表达是现代生物技术、结构生物学以及生物制药产业的核心环节。常见的蛋白表达系统包括原核细菌、大肠杆菌、酵母以及哺乳动物细胞。大肠杆菌表达速度快、成本低,但缺乏复杂的翻译后修饰 (post-translational modifications, PTMs);酵母能完成部分修饰,但糖基化模式与人类差异较大;哺乳动物细胞系统修饰最接近天然环境,但建立稳定细胞株耗时长,且生产成本较高。相比之
一、功能分类: 多序列比对二、软件官网:http://www.drive5.com/muscle/三、软件介绍: MUSCLE(Multiple Protein Sequence Alignment)。它是一款非常简单好用的软件,muscle也是肌肉的意思,也寓意此款软件功能强劲有力。 muscle是在2004年公布的一款蛋白质水平多序列比对的开源软件,在速度和精度上都优于Clustal
药物靶标的主要类型和结构特征1. 蛋白质2. 蛋白质作为药物靶标的几种常见类型2.1 酶2.2 受体2.3 离子通道3. 糖类4. 核酸参考文献 药物发挥药效,需要与生物体内具有特定功能的生物大分子结合,这个生物大分子就是药物靶标。药物可作用的靶标绝大多数是蛋白质,少量为核酸和糖。那么,它们有什么样的结构特征呢? 1. 蛋白蛋白质是构成生物体最基本的结构和功能物质,几乎参与了所有生命活动过程
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