在RNA-seq中，主成分分析（PCA）是最常见的多元数据分析类型之一，这期主要介绍一下利用已有的表达差异数据如何分析，别着急，见下文。1. 前言1. 相关背景在RNA-seq中，主成分分析（PCA）是最常见的多元数据分析类型之一。基因表达定量后获得了各样本中所有基因的表达值信息，随后我们通常会期望比较样本之间在基因表达值的整体相似性或者差异程度。基因数量成千上万，肯定不能对每个基因的表达都作个比
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2024-08-21 11:00:34
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一、数据库瓶颈不管是IO瓶颈，还是CPU瓶颈，最终都会导致数据库的活跃连接数增加，进而逼近甚至达到数据库可承载活跃连接数的阈值。在业务Service来看就是，可用数据库连接少甚至无连接可用。接下来就可以想象了吧(并发量、吞吐量、崩溃)。1、IO瓶颈第一种：磁盘读IO瓶颈，热点数据太多，数据库缓存放不下，每次查询时会产生大量的IO，降低查询速度 -> 分库和垂直分表。第二种：网络IO瓶颈，请求
认为来自不同物种的一组基因的进化关系（基因树，gene tree）与这些物种本身的进化关系（物种树，species tree）一定相同，似乎是合理的，因为这些基因存在于这些物种的基因组中。但情况并非如此。基因树不一定与物种树相同。 基因树可以和物种树不同，一种情况如下图所示。祖先种群最先固定了A1等位基因（顶部），但随后发生了A2突变，使该群体变成多态性群体。这种多态性甚至在
随着数据库的读写压力增大及数据量的增加，出现了数据库中间件进行分库分表的场景，现对sharding数据库中间件进行分库分表的实现进行尝试。 分库？单个数据库》多个数据库 分表？单个表》多个表 数据的切分（Sharding）分为水平分库（将数据按某种条件分开存储）和垂直分库（将数据按不同表分开存储）。 maven核心依赖<dependency>
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2023-09-26 09:46:23
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# Java 分表基因法实战
## 引言
在现代应用开发中，处理大量数据时，如何高效存储和查询成为开发者关注的焦点。分表技术是一种解决大数据存储与查询瓶颈的有效手段。本文将围绕“分表基因法”的应用，通过Java实现分表的基本原理，以及一个简单的示例，来帮助读者更好地理解这一技术。
## 什么是分表基因法
分表基因法是一种将数据库表按照某种规则进行拆分的方式。这样做的目的是为了提高数据库的性
原创
2024-09-29 04:31:48
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介绍基因表达(gene expression) 是指将来自基因的遗传信息合成功能性基因产物的过程。基因表达产物通常是蛋白质，但是非蛋白质编码基因如转移RNA（tRNA）或小核RNA（snRNA）基因的表达产物是功能性RNA。所有已知的生命，无论是真核生物（包括多细胞生物）、原核生物（细菌和古细菌）或病毒，都利用基因表达来合成生命的大分子。基因编码并可用于合成蛋白质，这个过程称为基因表达。在像人类这
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2024-05-08 20:02:00
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# 实现mysql大表分库分表基因法
## 1. 概述
在实际开发中，当一个表的数据量非常大时，为了提高查询效率和减少压力，我们通常会考虑对大表进行分库分表操作。本文将介绍如何通过基因法来实现mysql大表的分库分表操作。
## 2. 流程图
```mermaid
gantt
title 分库分表基因法流程图
section 初始设置
初始化数据库连接
原创
2024-03-01 05:29:58
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1、什么时候要进行分库分表引用《阿里巴巴Java开发手册》2、分库分表概念2.1 垂直分库： 垂直拆分的原则一般是按照业务类型来拆分，核心思想是专库专用，将业务耦合度比较高的表拆分到单独的库中。举个形象的例子就是在整理衣服的时候，将羽绒服、毛衣、T 恤分别放在不同的格子里。这样可以解决我在开篇提到的第三个问题：把不同的业务的数据分拆到不同的数据库节点上，这样一旦数据库发生故障时只会影响到某一个模块
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2023-09-15 17:12:08
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跨库连接查询join如果需要join的数据存在于多个库中，那就比较麻烦，解决的思路有如下几种：在应用层把原来数据库的Join操作分成多次的数据库操作。在应用层层面上去对数据库进行操作数据冗余，也就是对一些常用的数据进行冗余，这样可以把原来需要Join的数据变为单表查询。这需要结合具体的业务场景借助外部系统解决一些跨库问题外键约束外键约束的问题比较难解决，不能完全依赖数据库本身来完成之前的功能了。如
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2023-08-21 19:10:33
147阅读
# 实现Java基因算法分表
## 引言
作为一名经验丰富的开发者，你需要教导一位刚入行的小白如何实现“Java基因算法分表”。本文将指导你如何实现这一任务，并通过表格、代码示例和流程图来帮助你理解整个过程。
## 整体流程
首先，让我们通过以下表格来展示整个实现Java基因算法分表的流程：
```markdown
| 步骤 | 描述 |
|------|-
原创
2024-06-05 07:41:43
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前两天我们对GEO数据库来了一个大致的
介绍GEO数据集详细介绍GEO数据库介绍 (一)
。
我们对于目标数据集，我们做的第一个事情就
是差异分析，来寻找有差异的结果。
所有的表达芯片做的差异表达分析都是基于limma的算法来的。
我们今天介绍的这个GEO2R也只是把这个算法更加方便使用了而已。
PS：GEO2R只
现在做生物和医学的，很多都可能会和各种组学数据打交道。其中表达谱数据总是最常用的，也是比较好测的。即使在工作中不去测序，也可以利用已有的数据库去做一些数据挖掘，找一找不同表型（比如癌症）对应的marker或者调控的通路。这里跟大家推荐一款分析表达谱数据的神器GENE-E，亲测比较好用，满足常用需求，可以做各种热图，聚类，箱图，相似分析和标记筛选等等，而且非常小巧。  
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2024-07-30 20:33:23
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正文 中午闲着有点时间，做个demo睡觉去，这个例子网上应该都有，自己只是敲一下给自己做个记录。 public static void main(String[] args) { int[] whitelist = new int[]{12,13,34,56,78,88,99,100}; Array
原创
2021-05-12 21:50:21
988阅读
# 基因法与Java
## 1. 介绍
基因法（Genetic Programming）是一种通过模拟自然进化过程来解决问题的方法。它模仿了生物进化中的遗传、突变和适应性等过程，通过不断迭代和优化，找到最优解决方案。在计算机领域，基因法被广泛应用于解决优化问题、机器学习、人工智能等领域。
Java作为一种广泛应用于软件开发的编程语言，也可以用于实现基因法。本文将介绍如何使用Java编写基因法
原创
2024-06-12 05:46:47
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关于Mycat，它是一个阿里的开源项目，用来解决分库分表的海量数据存储和查询优化，关于它的简介，可以直接参考介绍：Mycat简介。下面对自己的demo做个记录：我之前从192.168.68.3克隆了一台服务器19...
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2019-07-24 09:24:00
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# 实现Java手动分表demo教程
## 一、整体流程
下面是实现Java手动分表的整体流程，我们将通过几个步骤来完成这个任务：
| 步骤 | 描述 |
|------|--------------------|
| 1 | 创建数据库和表 |
| 2 | 编写Java代码 |
| 3 | 测试分表效果 |
原创
2024-07-06 06:05:39
58阅读
关于Mycat，它是一个阿里的开源项目，用来解决分库分表的海量数据存储和查询优化，关于它的简介，可以直接参考介绍：Mycat简介。下面对自己的demo做个记录：我之前从192.168.68.3克隆了一台服务器192.168.68.6（关于克隆可以看我前面的文章），在192.168.68.6上面安装了mysql(mysql安装可以参考我前面的文章)在192.168.68.3中可以没有my...
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2021-07-30 14:11:58
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简化步骤：1.选择，从给出的染色体种群中选择染色体，由随机数决定：可能多次选取同一个染色体。基于原博客并未做出重大改变。提议：可将变异个体加入而不是替换在种群中，进行多次种群选取（选取数量为开始种群个体数量），并最终保留适应度最高的种群作为下一代。2.交叉。修改提议：将相邻个体交叉改为随机个体交叉。3.变异。4.计算最终种群的最优个体，并打印。详细解释可见原文。针对作者代码略作修改后的代码publ
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2024-04-08 14:46:52
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博客分类：
最近需要学习神经网络，对于神经网络问题的求解其中需要用到遗传算法，所以今天学习了一下遗传算法，主要参看了 这篇博客的文章，同时将其使用C++实现的程序用Java再次实现了一遍，不足之处还请指出多包涵 遗传算法：也称进化算法 。 遗传算法是受达尔文的进化论的启发，借鉴生物进化过程而提出的一种启发式搜索算法。因此在介绍遗传算法前有必要简单的介绍生物进化知识遗传算
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2023-10-25 17:04:14
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文章目录前言一、解决的函数二、遗传和变异算子1.交叉2.变异源代码 前言Java遗传算法（GA）简单例子 采用的是实数编码一、解决的函数f（x） = x1²+x2²+x3²//计算适应度，函数式的解
public static double fitness(double[] individual, int N) {
double f = 0;
for (i
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2023-09-26 10:00:09
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