前言（个人学习笔记，供学习参考，如有不足之处，还请大佬们批评指正！！）theme() 的语法有自己的一套风格，我感觉和ggplot2总体的风格类似，个人理解：它是针对图像的不同层次命名函数，并进行修改，并且后边的设置可以覆盖前面的设置，例子应该更能形象生动的展现。 在上一篇ggplot2-概述学习的结尾，也有讲到一部分theme的理解~：【R语言-ggplot2学习-概览】接下来跟着官方帮助文档学
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2023-09-19 12:24:56
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文章目录综括==apply函数==利用apply函数实现利用循环实现定义一个结果的数据框定义for循环利用R的特性三种方法消耗时间比较==lapply函数====sapply函数==vapply函数==mapply函数====tapply函数==rapply函数eapply函数 综括apply函数
apply函数是最常用的代替for循环的函数。apply函数可以对矩阵、数据框、数组(二维、多维)
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2023-07-06 16:47:22
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apply() 函数算是R语言中很基础的一个函数，同时还有 sapply() lapply() tapply() 函数精简了 apply() 函数的用法。apply() 函数是一个很R语言的函数，可以起到很好的替代冗余的for循环的作用，R语言中的循环操作for和while都是基于R语言本身来实现的，而向量操作是基于底层的C语言函数实现的，所以使用apply()函数家族进行
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2023-06-25 15:27:34
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3.1 使用图形使用代码保存图形：保存为PDF—pdf(filename)，其它格式：win.metafile( ), png( ),jpeg( ),bmp( ),tiff( ),xfig( ),postcript( )打开新的图形窗口的方法：第一种方法：dev.new( )
statements to create graph 1
dev.new( )
statements to create
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2023-06-25 14:58:24
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R语言数据集一、向量向量介绍：向量可以保存六种数据类型：逻辑，整数，双精度，复杂，字符和原始向量的创建data_1 <- c(1,3,4,6)
data_2 <- c("aa", "dd")
data_3 <- c(1,4,3,"cc") # 数据类型将会转化成字符串类型，数值类型将转化为字符串向量的访问data <- c(1,3,4,6)
data[1] # 输出1
da
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2023-06-25 14:27:04
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4. 因子 因子提供一种简单而又紧凑的形式来处理分类数据。因子用level来表示所有可能的取值。对于数据集中取值个数固定的分类数据，因子特别有用，图形函数和汇总函数就充分利用了因子这种优点。 R软件内部以数值编码方式来存储因子值，这
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2023-06-25 15:24:18
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#初步使用R语言进行作图
#绑定数据框mtcars这样之后作图就可以直接使用mtcars中的数据了
attach(mtcars)
#打开一个图形窗口并生成一副散点图，横轴表示车身重量，纵轴表示每加仑行驶的英里数
plot(wt,mpg)
#向图形中添加一条最优拟合曲线
abline(lm(mpg~wt))
#添加标题
title("Regression of MPG on Weight")
#解除
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2023-08-11 17:44:48
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前面我们看到的代码都是顺序执行的，也就是先执行第一条语句，然后是第二条、第三条……一直到最后一条语句，这称为顺序结构。但是对于很多情况，顺序结构的代码是远远不够的，比如一个程序限制了只能成年人使用，儿童因为年龄不够，没有权限使用。这时候程序就需要做出判断，看用户是否是成年人，并给出提示。在C语言中，使用if和else关键字对条件进行判断。请先看下面的代码：#include
int main()
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2024-06-19 20:25:35
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limma 包的normalizeBetweenArrays和其他数据矫正方法2.normalizeBetweenArrays只能是在同一个数据集里面用来去除样本的差异，不同数据集需要用limma 的 removeBatchEffect函数 去除批次效应数据矫正前.png可以看到，肿瘤样品的表达量整体就比正常对照样品的表达量高出一大截，这样的数据进行后续分析，就会出现大量的上调
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2023-09-21 10:22:37
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mega 2560板子在3d打印机中相当于大脑，控制这所有的3d打印配件来完成复杂的打印工作，但mega2560不能直接使用，需要上传（upload）固件（firmware）才可以使用。 1、下载固件——Marlin由于Marlin固件的强大功能和简单易用，所以这里暂时只介绍Marlin固件。Marlin原版下载地址（很多参数都需要自己配置）：我自己配置的Marlin固件大部分参数已经改好：htt
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2023-12-20 22:13:39
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工作空间函数名称功能getwd()/dir.create()显示/创建当前目录setwd("dir")设置当前目录savehistory("file")/loadhistory("file")保存/读取历史命令save.image("file")/load("file")保存/读取工作空间输入输出执行脚本 source("file")
文本输出 sink("file") e.g sink("out
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2023-07-21 20:28:01
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这里总结一下，今天老师上课的内容。我觉得跟着老师，我能学到好多东西。我要消化。我突然觉得自己很卑微，因为有那么多东西需要学习的。但是 复习的侧重点在：什么是自己知道的？什么是自己不知道的？缺什么补什么？R基础知识整理（查漏补缺）S1：identicalidentical(a,i) #既检验数值又检验数据类型
i==m== 仅仅是数值的比较；identical 则同时包括数值和属性的比较；S2: s
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2023-09-08 23:08:28
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R的基本运算a = c(1,2,3,4)
b = c(3,4,5,6)
print(a + b)
print(a ^ b) # a ** b
print(a %% b) # 整除取余
print(a %/% b) # 整除
v <- a # 向左赋值
b -> w # 向右赋值
ls() # 列出所有变量
print( 1 %in% v) # 相当于 in
print
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2023-07-09 17:37:54
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聊一聊R的基本绘图参数
砍柴问樵夫 R语言除了具有优秀的数据处理能力外，对于数据的展现也具有极其灵活和强大的作用。 R语言绘图函数主要包括：低级绘图函数，高级绘图函数，扩展绘图包函数。 基本绘图参数。 我们浏览一下R语言中的基本图形参数。 pch：点的符号，指定绘制点时使用的符号。x<-rep(1:5,times=6)
y<-rep(1:6,each=5)
pl
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2023-10-25 22:02:31
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我们在建立数据模型后通常希望在外部数据验证模型的检验能力。然而当没有外部数据可以验证的时候，交叉验证也不失为一种方法。交叉验验证（交叉验证，ＣＶ）则是一种评估模型泛化能力的方法，广泛应用中于数证据采挖掘和机器学习领域，在交叉验证通常将数据集分为两部分，一部分为训练集，用于建立预测模型；另一部分为测试集，用于测试该模型的泛化能力。在如何划分2个集合的问题上，统计学界提出了多种方法：简单交叉验证、留一
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2024-06-24 10:38:10
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创建数据集基本概念数据结构向量(vector）矩阵（matrix）基本用法矩阵下标的用法数组(array)数据框(dataframe)创建数据框提取数据框中的元素detach（）函数和attach（）函数cbind()函数和rbind（）函数列表综合实例实例1：数据框实例2：图形处理 基本概念数据集通常是由数据构成的一个矩形数组，行表示观测，列表示向量。（不同行业对于数据集的行和列叫法不同）数据
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2023-06-25 14:26:52
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euro #欧元汇率，长度为11，每个元素都有命名
landmasses #48个陆地的面积，每个都有命名
precip #长度为70的命名向量
rivers #北美141条河流长度
state.abb #美国50个州的双字母缩写
state.area #美国50个州的面积
state.name #美国50个州的全称
state.divisi
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2023-06-25 14:25:18
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创建数据集什么叫数据集？ 数据集通常是由数据构成的矩形数组，行表示观测，列表示变量 如下面的病例数据集patientID age diabetes status
1 1 25 Type1 Poor
2 2 34 Type2 Improved
3 3 28 Type1 Excellent
4 4
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2023-09-19 12:25:33
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R语言具有较强的数据分析能力，但是对于数据处理，尤其是面对较大数据量时，就有很多的不足之处，为了解决处理较大数据集的问题，R中涌现了一系列数据处理的包，data.table包就是其中之一。data.table是对data.frame的扩展类型，因此适用于data.frame的函数也同样适用于data.table，不同的是data.table增加了索引设置，
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2023-09-24 10:17:43
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1. ggplot中的scale_*_*()函数借助代码：help(package = "ggplot2")获取ggolot2中的所有函数名称，检索到scale_*_*，可以看到有近百个函数，总结下来，可以分为几个大类，分别是：scale_alpha_*() 【设置透明度】scale_color_*() 或 scale_colour_*() 【设置边框/散点颜色】scale_fill_*（) 【设
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2023-10-10 08:59:32
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