大家好，我是小马老师。继续介绍Atomsk建模方法，本文主要介绍如何使用atomsk建立空位缺陷。atomsk生成空位缺陷的原理：使用“-select”命令选择原子，通过“-remove-atom”删除被选择的原子，从而形成空位缺陷。“-select”命令可选择特定的原子，也可以随机选择一定数量的原子。具体过程如下：
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2022-04-29 15:31:30
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大家好，我是小马老师。本文介绍atomsk孪晶多晶建模方法。atomsk多晶建模的原理是先建立一个晶胞，然后编写一个polycrystal.txt文件，设定最终模型的尺寸和晶粒的个数。atomsk按照晶粒个数随机生成对应的节点node坐标，根据Voronoi算法生成每个晶粒空间，并把最初设定的晶胞填充到晶粒空间内，从而得到多晶文件。如果把最初的晶胞换成孪晶，最终得到的多晶就是孪晶多晶结构。如Al的
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2022-11-05 13:38:16
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每次进行lammps模拟都需要进行建模，前面几篇文章主要介绍了lammps自带的建模命令，比较简单的模型使用lammps建模比较方便。如果模型比较复杂，建议使用其他建模软件，如MS、Atomsk等。建模软件没有优劣之分，我们的目的就是建好模型，满足模拟需要就可以。不同的建模软件适用范围也不一样
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2022-04-29 15:21:36
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每次进行lammps模拟都需要进行建模，前面几篇文章主要介绍了lammps自带的建模命令，比较简单的模型使用lammps建模比较方便。如果模型比较复杂，建议使用其他建模软件，如MS、Atomsk等。建模软件没有优劣之分，我们的目的就是建好模型，满足模拟需要就可以。不同的建模软件适用范围也不一样，灵活搭配使用效果更好。比如，我一般使用MS进行聚合物建模，使用Atomsk进行位错建模，并不局限于一种建
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2022-01-06 17:11:42
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孪晶是指两部分晶体取向沿着一个对称面成镜面对称关系。孪晶的建模方法有很多，在lammps中两次使用lattice orient命令建立两部分晶体，需要提前确定两部分晶体取向和晶体生成位置。而在Atomsk软件建立孪晶相对比较简单，只需要确定一个晶体取向即可，atomsk会自动镜像另一部分晶体。下面以Al为例介绍Atomsk建立孪晶的步骤。1. 生成Al单胞并设定取向使用create命令建立Al
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2022-01-06 17:10:57
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前面已经介绍过使用lammps和Atomsk建立孪晶的建模方法，有粉丝问Atomsk建立大角度晶界的方法。Atomsk建立晶界还是比较方便的，主要的原理是根据多晶建模理论，把晶界上下两部分看成2个大晶粒。每个晶粒部分按照一定的角度旋转即可。下面的例子来自Atomsk官方例程，仅做简单介绍。1.先建立Al的晶胞atoms
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2022-04-29 15:25:28
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在半导体中，电子的能带结构决定了电子允许和被禁止的能量范围，并决定了半导体材料的电学及光学性质。孤立原子的电子占据一定的原子轨道，形成一系列分立的能级。石墨烯的晶格结构非常稳定，电子在轨道中移动所受到的干扰非常小，具有优秀的导电性能。这种结构导致石墨烯独特的电子能带结构，如图1(b)所示，第一布里渊区的六个顶点为费米点（也称为狄拉克点或K点），导带
前面已经介绍过使用lammps和Atomsk建立孪晶的建模方法，有粉丝问Atomsk建立大角度晶界的方法。A
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2022-01-06 17:12:03
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孪晶是指两部分晶体取向沿着一个对称面成镜面对称关系。孪晶的建模方法有很多，在lammps中两次使用lattice orient命令建立两部分晶体，需要提前确定两部分晶体取向和晶体生成位置。而在Atomsk软件建立孪晶相对比较简单，只需要确定一个晶体取向即可，atomsk会自动镜像另一部分晶体。
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2022-04-29 15:21:21
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根据晶体学理论，位错是晶体的一种晶格缺陷，有刃型位错、螺旋位错、混合位错之分。本文
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2022-01-06 17:20:50
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大家好，我是小马老师。本文介绍合金多晶模型的建模过程，使用的软件为Atomsk。Atomsk是一个开源软件，可运行在windows、linux等多种操作系统上，本文使用windows版的Atomsk实现建模，其他操作系统的建模命令基本相同。建模过程如下：1. 生成单晶Fe晶胞atomsk --create fcc 3.65 Fe Fe.xsf2.
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2022-04-29 15:27:50
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大家好，我是小马老师。本文介绍合金多晶模型的建模过程，使用的软件为Atomsk。Atomsk是一个开源软件，
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2022-01-05 11:54:25
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大家好，我是小马老师。今天给大家介绍一种比较有意思的lammps建模方法。如下图所示：用到的软件有：Atomsk、python、Ovito。建模原理：Atomsk可根据掩码文件(mask.txt)对模型进行处理，类似于photoshop中的蒙版。掩码文件是一个包含01两种数字的文本文件，具体描述可参考Atomsk官方手册说明
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2022-04-29 14:47:30
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目标需求：通过Atomsk、Ovito和lammps进行高熵合金的多晶体建模及渲染内容如下：涉及软件及工具：工具列表：AtomskOvitolammps方法实例化：步骤一：Atomsk软件下载及安装Atmosk介绍： Atomsk是一款免费、开源、命令行式程序，致力于分子动力学模拟data文件的创立、操控和格式转换。他不光支持分子动力学可视化和分析软件AtomEye、OVITO等，第一性原理计算软
大家好，我是小马老师。lammps模拟纳米流体时，多数会用到管道类模型，如下图所示。这种管道类模型，可以使用lammps自带的region cylinder命令构建，命令相对复杂，对新手来说并不友好。本文介绍一种相对简单的管道类模型建模方法，用到的软件为Atomsk。在Atomsk中，命令roll可将模型“卷”成一定的角度，类似于材料加工中的滚轧。
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2022-04-29 14:40:58
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大家好，我是小马老师。本文介绍使用Atomsk软件建立不规则界面的方法。在一些lammps模拟中会涉及到不规则界面对模拟结果的影响，如凹凸界面对摩擦力的影响、凹凸界面对纳米流体的影响等等。Atomsk可根据设定条件重新调整原子的位置，从而生成不同的结构。下面以Al板为例介绍不规则界面的建模代码。
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2022-04-29 15:28:57
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上一次文章介绍了Atomsk软件建立孪晶的方法(Atomsk建模方法-孪晶模型)，有朋友咨询使用lammps自带命令建立孪晶的方法。本文以Cu为例介绍lammps孪晶建模方法。使用lammps建模，关键是确定xyz坐标轴对应的晶向指数。以面心立方晶体[11-2]孪晶面为例，孪晶面上下两侧的xyz轴对应的指数可以设为[11-2][111][1-10]和[-1-12][111][-110]。设置方法并
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2022-01-06 17:18:14
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