又是编程基础系列,本次主题是R的程序控制。掌握程序控制能力是学习系统性的构建程序的重要过程。在我看来,程序控制能力的体现在编程者能够掌握程序运行中的错误、识别低效率环节、监控程序状态、增强程序稳定性、关键点控制,这些能力跟程序本身的功能无关,但对提升工作效率及降低错误概率很有帮助。本次简单介绍一些R程序控制基础技能,以及一些我的看法。写log如果你的程序有非常多的循环,甚至是循环嵌套,那记录每次循
目录一、read.table() 读取工作路径下的纯文本文件(.txt)(.csv)1、工作路径的设置2、head函数——只显示数据前几行3、read.table()的其他一些参数二、与read.table相类似的函数三、read.table()读取网络上的文本文件三、读取非文本文件1)XML包—— readHTMLTable函数2)foreign包中的函数3)将文件格式转换成会读取的方式,或RS
4. 因子        因子提供一种简单而又紧凑的形式来处理分类数据。因子用level来表示所有可能的取值。对于数据集中取值个数固定的分类数据,因子特别有用,图形函数和汇总函数就充分利用了因子这种优点。        R软件内部以数值编码方式来存储因子值,这
转载 2023-06-25 15:24:18
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limma 包的normalizeBetweenArrays和其他数据矫正方法2.normalizeBetweenArrays只能是在同一个数据集里面用来去除样本的差异,不同数据集需要用limma 的 removeBatchEffect函数 去除批次效应数据矫正前.png可以看到,肿瘤样品的表达量整体就比正常对照样品的表达量高出一大截,这样的数据进行后续分析,就会出现大量的上调
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R的基本运算a = c(1,2,3,4) b = c(3,4,5,6) print(a + b) print(a ^ b) # a ** b print(a %% b) # 整除取余 print(a %/% b) # 整除 v <- a # 向左赋值 b -> w # 向右赋值 ls() # 列出所有变量 print( 1 %in% v) # 相当于 in print
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这里总结一下,今天老师上课的内容。我觉得跟着老师,我能学到好多东西。我要消化。我突然觉得自己很卑微,因为有那么多东西需要学习的。但是 复习的侧重点在:什么是自己知道的?什么是自己不知道的?缺什么补什么?R基础知识整理(查漏补缺)S1:identicalidentical(a,i) #既检验数值又检验数据类型 i==m== 仅仅是数值的比较;identical 则同时包括数值和属性的比较;S2: s
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聊一聊R的基本绘图参数 砍柴问樵夫 R语言除了具有优秀的数据处理能力外,对于数据的展现也具有极其灵活和强大的作用。 R语言绘图函数主要包括:低级绘图函数,高级绘图函数,扩展绘图包函数。 基本绘图参数。 我们浏览一下R语言中的基本图形参数。 pch:点的符号,指定绘制点时使用的符号。x<-rep(1:5,times=6) y<-rep(1:6,each=5) pl
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工作空间函数名称功能getwd()/dir.create()显示/创建当前目录setwd("dir")设置当前目录savehistory("file")/loadhistory("file")保存/读取历史命令save.image("file")/load("file")保存/读取工作空间输入输出执行脚本 source("file") 文本输出 sink("file") e.g sink("out
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mega 2560板子在3d打印机中相当于大脑,控制这所有的3d打印配件来完成复杂的打印工作,但mega2560不能直接使用,需要上传(upload)固件(firmware)才可以使用。 1、下载固件——Marlin由于Marlin固件的强大功能和简单易用,所以这里暂时只介绍Marlin固件。Marlin原版下载地址(很多参数都需要自己配置):我自己配置的Marlin固件大部分参数已经改好:htt
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R语言与统计分析之 探索性数据分析篇 一、R语言中的统计概念 1、随机实验: 可在相同 2、随机事件 均值u:这个很好理解 R函数:mean中位数:对序列排序后,排在中间的数,需要特别注意的是如果序列为偶数,中位数是中间两个数平均值.  R函数:median百分位数:也是顺序统计量,设百分数为p,n是样本个数,则p位数指:np为小数,ceiling(np)+1,np为整数,则p位数:(x
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数据的分布特征:分布的集中趋势,反应各数据向其中心值靠拢或聚集的程度(平均数,中位数,四分位数,众数)分布的离散程度,反应各数据远离其中心值的趋势(极差,四分位差,方差,标准差,离散系数)分布的形状,反应数据分布的偏斜程度和峰度(偏态系数,峰度系数)#######################平均数(均值):一组数据相加后除以数据的个数而得到结果,称为平均数(mean)中位数:一组数据排序后处于
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前言上面一章我们已经成功爬取了链家网的数据。按照同样的方法爬取,又成功爬取了3w条上海二手房源的数据,那么这一章就写写关于上海二手房的分析。用到的软件:R,Tableau一开始还是在R中画的图,后来觉得不是很好看,所以用tableau。首先读取文件1library(ggplot2) 2house_info <- read.csv("house_inf0.csv",stringsAsFacto
apply() 函数算是R语言中很基础的一个函数,同时还有 sapply()  lapply()  tapply() 函数精简了 apply() 函数的用法。apply() 函数是一个很R语言的函数,可以起到很好的替代冗余的for循环的作用,R语言中的循环操作for和while都是基于R语言本身来实现的,而向量操作是基于底层的C语言函数实现的,所以使用apply()函数家族进行
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文章目录综括==apply函数==利用apply函数实现利用循环实现定义一个结果的数据框定义for循环利用R的特性三种方法消耗时间比较==lapply函数====sapply函数==vapply函数==mapply函数====tapply函数==rapply函数eapply函数 综括apply函数 apply函数是最常用的代替for循环的函数。apply函数可以对矩阵、数据框、数组(二维、多维)
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R语言之for循环注:来源为李东风R语言教程 使用for循环的注意事项: 如果对向量每个元素遍历并保存结果, 应在循环之前先将结果变量产生等长的存储, 在循环内为已经分配好存储空间的输出向量的元素赋值。 为了产生长度为n的数值型向量,用numeric(n); 为了产生长度为n的列表,用vector(“list”, n)。 对一个向量元素遍历时如果用下标访问, 需要用seq_along(x)的做法而
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     R语言      R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。R语言特点   R作为一种统计分析软件,是集统计分析与图形显示于一体的。它可以运行于UNIX、Windows和Macintosh的操作系统上,而且嵌入了一个
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#初步使用R语言进行作图 #绑定数据框mtcars这样之后作图就可以直接使用mtcars中的数据了 attach(mtcars) #打开一个图形窗口并生成一副散点图,横轴表示车身重量,纵轴表示每加仑行驶的英里数 plot(wt,mpg) #向图形中添加一条最优拟合曲线 abline(lm(mpg~wt)) #添加标题 title("Regression of MPG on Weight") #解除
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delta方法上面的流程跑通之后,对于中介分析,我们需要报告间接效应的估计值和置信区间,还有中介比例的估计值和置信区间,类似下面的这样:但是其实我们是光跑孟德尔是得不到上面的需要的值的(比如间接效应的标准误,中介比例的标准误),此时需要借助的方法之一叫做delta method。As individual level data is not available in summary data MR
转载 2023-09-26 21:33:29
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