# 理解Cox比例风险模型及其在R语言中的应用 在生物统计学和流行病学中,Cox比例风险模型是一种广泛用于生存分析的方法。它通过分析时间至事件(如死亡、疾病复发等)和一组解释变量之间的关系来建模风险。本文将详细介绍Cox比例风险模型的基础知识,并提供在R语言中实现该模型的代码示例。 ## 什么是Cox比例风险模型? Cox比例风险模型(Cox Proportional Hazards Mod
原创 11月前
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我们在临床研究中,经常要研究疾病与生存率的关系,cox回归是用得比较常见的模型之一。Cox 比例风险模型依赖于风险随时间变化的假设(PH假设),意思是协变量对结局的影响随着时间变化是固定的。然而现实中常有不满足于PH假设的情况。如文章:All-cause and cause-specific mortality associated with diabetes in prevalent hemod
plot() 函数(1) plot(x, y) 其中x和y是向量,生成y关于x的散点图。 (2) plot(x) 其中x是一时间序列,生成时间序列图形。如果x是向量,则产生x关于下标的散点图。如果x是复向量,则绘出复数的实部与虚部的散点图。 (3) plot(f) plot(f, y) 其中f是因子,y是数值向量。第一种格式生成f的直方图;第二种格式生成y关于f水平的箱线图。 (4) plot(d
转载 2023-08-31 09:16:19
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多元线性回归是研究一个连续型变量和其他多个变量间线性关系的统计学分析方法,如果在自变量中存在分类变量,如果直接将分类变量和连续性变量统一纳入模型进行分析是有问题的,尤其是无序分类资料,即使进入了模型,也难以解释,因此分类资料纳入模型最佳的方式是设置哑变量。在SPSS软件中,做Logistic回归时,直接有选项可以将分类变量设置哑变量,但是在做多元线性回归时,分析过程中没有设置哑变量的选项,就需要对
单变量的线性回归模型就不再细说了,这里只记录多变量线性回归中几个需要实现的步骤和函数,其他内容在课程中的讲义和习题中都有详细描述。特征标准化,对应featureNormalize函数 作用:消除不同特征间的量纲,提高梯度下降的速度,缩短收敛时间需要在featureNormalize.m文件中填充的代码:mu = mean(X); % 计算每个特征的均值 sigma = std(X);
注: 本文是R语言sf包的核心开发者和维护者——来自德国明斯特大学的地理信息学教授: Edzer Pebesma 的一篇关于sf包的简介,发表于2018年7月的R语言期刊,主要讲述了sf的定位、功能、开发现状及现存问题和今后展望,sf包是一个非常了不起的工具,在R语言中引入了空间数量分析领域通用的标准规范(simple feature),结合tidyverse工具箱组合
1.单因素方差分析:适用于单因素A有两个水平或以上,研究个水平对因变量的影响正态假设条件:W检验shapiro.test():原假设为数据来自正态分布方差齐性条件:Bartlett检验(主要用于正态分布的数据) bartlett.test(x, g, ...)x是数据向量或列表(list);g是因子向量,如果x是列表则忽略g。 当使用数据集时,也可以通过formula调用函数&
转载 2023-06-25 20:40:28
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http://blog.sina.com.cn/s/blog_597fcb450100c3um.html  【转】R与SAS、SPSS的比较  (2009-03-05 20:29:40) 转载 标签: 教育分类: 学习R与SAS、SPSS的比较R语言 R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R
作者:圈圈Getting Data In and Out of R(一)读取数据读取数据所需的几种函数:read.table、 read.csv:最常用的读取列表数据函数,可返回数据框形式。readLines:逐行读取文本文件,返回一个字符向量source:读取R代码、脚本dget:读取R代码(读取的是以逆句法分析后以文本文件储存的R对象)load、 unserialize:把
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 下载和安装Windows环境的R1.进入主页,点击 蓝色加粗的 download R 2.随便点击一个镜像,这里点击的是http://mirror.fcaglp.unlp.edu.ar/CRAN/ 3.点击Download R for Windows  4.点击install R for the first time. 5.点击 Dow
转载 2023-11-03 09:07:58
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一、预备知识1.使用图形 #绑定数据框mtcarsattach(mtcars)#打开一个图形窗口并生成散点图plot(wt,mpg)#添加一条最优拟合曲线abline(lm(mpg~wt))#图形名称title("aaa")#数据框解除绑定detach(mtcars)2.图形的保存 pdf() 、 win.metafile()、png()、jpeg()、bmp()、tiff()、xfig()等其他
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高级数据管理数值和字符处理函数数学函数函数描述np.abs(x)绝对值np.sqrt(x)平方根np.ceil(x)大于x的最小整数np.floor(x)小于x的最大整数np.trunc(x)向0截取x中的整数部分np.round(x, decimals=2)将x舍入为指定位的小数np.cos(x)/sin(x)/tan(x)余弦/正弦/正切np.arccos(x)/arcsin(x)/acrta
转载 2024-07-12 18:50:33
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R语言和集算器吸引人的地方之一在于,它们的代码风格都比较敏捷,用简短的代码就可以实现丰富的功能。比如都可以写出”Vector Computing”表达式,对判断语句都进行了简化,都可以把基础函数扩展成高级函数,都支持泛型。其中向量化计算的特点是用函数和运算符处理批量数据,避免循环语句。这将带来2个优点:使程序员可以轻松掌握,降低学习成本;方便实现计算,提高性能。下面用几个例子来比较一下R和集算器在
转载 2023-08-18 13:01:45
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加载可能用到的包library(xml2) library(rvest) library(reshape2) library(ggplot2) library(dplyr)读取数据打开数据来源的链接,鼠标点击右键检查,将内容复制到文本文件中,我这里命名为new1.txtpage"new1.txt") JokicJokic[[9]] list(Jokic) df1colnames(df1)首先看一看
 (注明:以下文章均在Linux操作系统下执行)一、R语言简介R语言是用于统计分析,图形表示和报告的编程语言和软件环境。R语言由Ross Ihaka和Robert Gentleman在新西兰奥克兰大学创建,目前由R语言开发核心团队开发。R语言的核心是解释计算机语言,其允许分支和循环以及使用函数的模块化编程。R语言允许与以C,C ++,.Net,Python或FORTRAN语言编写的过程集
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R 语言实战(第二版)## part 3 中级方法-------------第8章 回归------------------#概念:用一个或多个自变量(预测变量)来预测因变量(响应变量)的方法 #最常用:OLS——普通最小二乘回归法,包括简单线性回归、多项式回归、多元线性回归 #过程:拟合OLS回归模型——>评价拟合优度——>假设检验——>选择模型 #OLS回归 #目标:减少因
下面录入文法文件,运行ANTLRWorks点击“File– New”菜单新建文法文件,在新文件中将前面的文法录入。(我的网站中有本书所有示例源代码,但我建议您还是手工录入一遍。这样您会有更好的学习效果。)录入文法后点击“File – Save” 菜单文件名为“E.g”。然后点击“Generate–GenerateCode”,如果ANTLRWorks提示“The grammar has been s
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基本理论知识ARMA模型称为自回归移动平均模型,是时间序列里常用的模型之一。ARMA模型是对不含季节变动的平稳序列进行建模。它将序列值表示为过去值和过去扰动项的加权和。模型形式如下: yt=c+a1yt−1+a2yt−2+...+apyt−p+ϵt−b1ϵt−1−b2ϵt−2−...−bqϵt−qyt=c+a1yt−1+a2yt−2+...+apyt−p+ϵt−b1ϵt−1−b2ϵt−2−...
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R语言︱情感分析—基于监督算法R语言实现笔记。可以与博客 R语言︱词典型情感分析文本操作技巧汇总(打标签、词典与数据匹配等)对着看。 词典型情感分析大致有以下几个步骤:训练数据集、neg/pos情感词典、分词+数据清洗清洗(一、二、三级清洗步骤)、计算情感得分、模型评价 ————————————————————————————————————————————&nbsp
R语言中,因子(factor)表示的是一个符号、一个编号或者一个等级,即,一个点。例如,人的个数可以是1,2,3,4......那么因子就包括,1,2,3,4.....还有统计量的水平的时候用到的高、中、低,也是因子,因为他是一个点。与之区别的向量,是一个连续性的值,例如,数值中有1,1.1,1.2......可以作为数值来计算,而因子则不可以。如果用我自己的理解,简单通俗来讲:因子是一个点,向
转载 2023-06-21 22:48:48
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