# R语言 生存分析 HR值
生存分析是一种常用的统计学方法，用于研究事件发生的概率和时间。在生存分析中，一个非常重要的指标就是风险比（Hazard Ratio，HR值），它可以帮助我们比较不同因素对事件发生的影响。本文将介绍如何使用R语言进行生存分析，并计算HR值。
## 生存分析基础
生存分析通常用于研究时间直至特定事件发生的概率。常见的应用包括治疗效果评估、生物学研究和流行病学调查等。
原创
2024-05-27 06:16:42
1681阅读
生存分析定义生存分析：既考虑结果又考虑生存时间的一种统计方法，并可充分利用截尾数据所提供的不完全信息，对生存时间的分布特征进行描述，对影响生存时间的主要因素进行分析。 生存分析不同于其它多因素分析的主要区别点：生存分析考虑了每个观测出现某一结局的时间长短。 生存分析不用于其他的统计方法的地方在于既需要考虑结果又需要考虑结果发生的时间。 癌症的生存分析最终结局为生存或死亡。生存分析目的 估计：根据样
转载
2024-03-30 21:12:52
176阅读
本节书摘来华章计算机出版社《R的极客理想——高级开发篇 A》一书中的第2章，第2.2节，作者：张丹 更多章节内容可以访问云栖社区“异步社区”公众号查看。2.2 PageRank算法R语言实现问题如何用R语言实现PageRank算法？引言Google搜索，早已成为我每天必用的工具，我无数次惊叹它搜索结果的准确性。同时，我也在做Google的SEO，推广自己的博客。经过几个月尝试，我的博客PR到2了，
一、背景 数据集展示了X市常住外来人口的基本情况，包括人口学变量和一些行为特征。假定这些变量的取值在观测期间内都保持不变，仔细查看和分析数据情况，试利用生存分析法完成下面的题目。二、要求和代码#*********************************前期数据处理***********************************
#1
#①利用R读取数据。注意：不要事先改动样本的数据内
转载
2023-08-28 13:25:37
193阅读
今天给大家写写生存分析：Survival analysis corresponds to a set of statistical approaches used to investigate the time it takes for an event of interest to occur.生存分析研究的我们感兴趣的事件发生的时间的分布情况。这里面的“生存”不一定指存活，因为生存分析在医学随
转载
2024-01-29 00:40:11
146阅读
survminer是专门用来进行生存分析可视化的R包，主要函数如下：生存曲线ggsurvplot():arrange_ggsurvplots():ggsurvevents():surv_summary():surv_cutpoint():pairwise_survdiff():Cox模型的诊断ggcoxzph():ggcoxdiagnostics():ggcoxfunctional():Cox模型
转载
2023-09-06 11:04:21
980阅读
目录1.什么是生存分析？2.生存分析方法的种类？3.生存分析使用的方法？4.什么是生存曲线？5.卡普兰-迈耶生存分析的计算方法？6.代码实现1.什么是生存分析？生存分析是研究生存时间的分布规律，以及生存时间和相关因素之间关系的一种统计分析方法。生存分析可用来预测在某一时间点上的事件是否会出现，它需要通过时间的维度来完成事件在某一时间发生概率的预测。2.生存分析方法的种类？（1）参数法：知道生存时间
转载
2023-06-20 15:47:28
346阅读
生存分析全人群肿瘤登记资料常用的统计分析指标包括发病率、死亡率、现患率以及生存率等，其中肿瘤生存率是评估肿瘤治疗效果和肿瘤负担的必要指标，其计算涉及肿瘤患者的发病、 死亡和随访三个方面的资料， 数据整理和计算过程均较为复杂， 如何及时、 准确地计算肿瘤生存率， 并使其可以在不同地区、 不同人群、不同时期间被客观公正地比较和评价，仍然是统计学家们一直在研究的主题。人群肿瘤登记生存率的分析指标包括观察
转载
2023-08-28 10:07:37
337阅读
RMI规范--第三章 主题： Stub 与 skeleton 远程方法调用中的线程使用 远程对象的垃圾收集 动态类的加载 通过代理服务器透过防火墙的 RMI 3.1 Stub 与 skeleton 在与远程对象的通信过程中，RMI 将使用标准机制（用于 RPC 系统）：stub 与 skeleton。远程对象的 stub 担当远程对象的客户本地代表或代理人角色。 调用程序将调用本地 stub 的方
转载
2024-10-23 22:00:39
24阅读
今天被粉丝发的文章给难住了，又偷偷去学习了一下竞争风险模型，想起之前写的关于竞争风险模型的做法，真的都是皮毛哟，大家见笑了。想着就顺便把所有的生存分析的知识和R语言的做法和论文报告方法都给大家梳理一遍。什么时候用生存分析当你关心结局和结局发生时间的时候，就要考虑生存分析了，这种既有结局又有时间的数据叫做生存数据，英文叫做Time-to-event data. 只不过因为这个方法医学上用来分析存活情
转载
2024-05-16 12:46:50
25阅读
文章目录R语言进行生存分析1.下载示例数据2.R语言代码实例详解3.难点解读4.补充：如何用R语言 手动计算生存率 R语言进行生存分析1.下载示例数据示例数据连接2.R语言代码实例详解#示例数据输入
clinical <- read.table("clinical_clust.txt",header = T, row.names = 1, sep = "\t", check.names =
转载
2023-08-04 13:52:57
90阅读
生存分析研究的是某个事件发生之前过去的时间，在临床研究中最常见的应用就是死亡率的估计(预测患者的生存时间)，不过生存分析也可以应用于其他领域如机械故障时间等。在R中，survival包中有很多函数可以对生存数据进行建模，可以使用survfit()函数来估计删失数据的生存曲线，使用coxph()函数用来拟合Cox比例风险模型。在survminer包中，可以使用plot()函数、ggsurvplot(
转载
2023-08-08 08:42:48
1453阅读
R语言：利用survminer包实现生存分析及可视化总述下载和安装单一组别生存曲线的绘制两组生存曲线的绘制基本方法改变文字大小，字体和颜色只改变字号同时改变文字大小，字体和颜色改变图例位置，图例标题和图例名称改变曲线类型和颜色添加风险表扩大x轴的坐标范围Transform survival curves累积发病率图危险率函数Arbitrary function多组生存曲线的绘制参考网站和相关推荐
转载
2023-10-18 15:16:53
486阅读
https://bioconnector.github.io/workshops/r-survival.html[https://bioconn...
原创
2022-03-18 10:14:30
202阅读
# R语言生存分析代码实现指南
作为一名经验丰富的开发者，我将教会你如何使用R语言实现生存分析代码。在本文中，我将通过以下步骤详细介绍如何进行生存分析，并提供相关的代码示例。
## 1. 数据准备
首先，我们需要准备用于生存分析的数据。通常，生存分析需要包含以下几列数据：
- 时间（Time）：表示事件发生或最后一次观测的时间。
- 事件（Event）：表示事件是否发生，通常用1表示发生，
原创
2023-10-21 10:00:29
122阅读
前言生存分析对应于一组统计方法，用于调查感兴趣事件发生所花费的时间。生存分析被用于各种领域，例如：癌症研究为患者生存时间分析，“事件历史分析”的社会学在工程的“故障时间分析”。在癌症研究中，典型的研究问题如下：某些临床特征对患者的生存有何影响？个人三年存活的概率是多少？各组患者的生存率有差异吗？目标：本文的目的是描述生存分析的基本概念。在癌症研究中，大部分生存分析使用以下方法：Kaplan-Mei
原创
2021-03-26 08:56:14
2932阅读
今天被粉丝发的文章给难住了，又偷偷去学习了一下竞争风险模型，想起之前写的关于竞争风险模型的做法，真的都是皮毛哟，大家见笑了。想着就顺便把所有的生存分析的知识和R语言的做法和论文报告方法都给大家梳理一遍。什么时候用生存分析当你关心结局和结局发生时间的时候，就要考虑生存分析了，这种既有结局又有时间的数据叫做生存数据，英文叫做Time-to-event data. 只不过因为这个方法医学上用来分析存活情
转载
2023-09-15 22:00:42
1013阅读
# 生存分析中位生存时间的实现——R语言指南
生存分析是一种统计方法，用于分析事件发生时间的数据。中位生存时间是指一半的样本在该时间之前发生事件，而另一半在该时间之后。本文将详细介绍如何使用R语言进行生存分析并计算中位生存时间。
## 流程概览
在开始之前，让我们先看看实现生存分析的基本流程，下面是一个简易步骤表格：
| 步骤 | 描述
文章目录主要函数描述性统计比较均值增强R中的ANOVA事后检验（post-hoc）比较比例比较方差计算效应量相关性分析计算相关性重塑相关矩阵相关矩阵取子集可视化相关矩阵添加P值和显著性标记提取统计信息数据处理辅助函数其他安装和加载描述性统计t检验单样本t检验配对t检验两样本t检验分组后进行比较多组间的两两比较方差分析完全随机设计方差分析随机区组设计资料的方差分析拉丁方设计方差分析两阶段交叉设计资料
转载
2023-08-05 14:09:16
318阅读
临床研究中结局事件可能有多个, 例如结局B将阻止感兴趣事件A的出现或影响A发生的概率，B事件形成"竞争”关系,B为A竞争风险事件。常见场景是研究治疗方案A和复发的关系，如果患者在死亡就观察不到复发，“死亡”和“复发”存在竞争。传统生存分析回归前提假设是删失时间与失效时间是独立的且删失对回归系数β是无信息的，即结局不存在竞争风险。临床生存数据常常伴有多个结局，结局间若存在竞争关联关系，简单地将其他原
