写在前面
不知何时起,我总是喜欢在推文前面写上写在前面,可能是表达我的一种心境吧。在家里的日子在不断的测试和完善流程,每当我累了的时候,总想去gogle找一些新鲜东西,然后修改,适最后合自己的模子,变成对自己功能强大的样子,慢慢的这种方式变成了习惯。
华夫饼干图
在本文中,我将展示如何使用ggplot2绘图包在R中创建各种样式的“华夫饼”图。我定义了超过物种华夫饼图的元素,这些元素当然都会来自ggplot和相关的R包,然后修改了一个gihub上的函数,用于出图,因为后面微生物领域需要哟一些华夫饼图的需求,所以我这里做了一些尝试,希望可以有一些思考。
首先,我将为模拟数据创建一个数据框,初始化数据类型:
library(dplyr)d
## # A tibble: 813 x 5## date year week day hours## ## 1 2018-01-02 2018 2 周二 0## 2 2018-01-03 2018 2 周三 0## 3 2018-01-04 2018 2 周四 0## 4 2018-01-05 2018 2 周五 0## 5 2018-01-06 2018 2 周六 0## 6 2018-01-07 2018 2 周日 0## 7 2018-01-08 2018 3 周一 0## 8 2018-01-09 2018 3 周二 0## 9 2018-01-10 2018 3 周三 0## 10 2018-01-11 2018 3 周四 0## # ... with 803 more rows
然后模拟每个日期的工作时间。我将模拟周末和工作日分别工作的小时数,以使生成的数据更加真实,并模拟数据的缺失值(即没有工作的天数)。
set.seed(1)# Simulate weekendsweekends % arrange(date) %>% # Arrange by date select(-na) # Remove na columnd
## # A tibble: 813 x 5## date year week day hours## ## 1 2018-01-02 2018 2 周二 NA## 2 2018-01-03 2018 2 周三 7## 3 2018-01-04 2018 2 周四 8## 4 2018-01-05 2018 2 周五 NA## 5 2018-01-06 2018 2 周六 NA## 6 2018-01-07 2018 2 周日 12## 7 2018-01-08 2018 3 周一 13## 8 2018-01-09 2018 3 周二 9## 9 2018-01-10 2018 3 周三 9## 10 2018-01-11 2018 3 周四 4## # ... with 803 more rows
华夫饼图功能函数
然后,我将创建一个绘制华夫饼图的函数。如果您具有类似的结构化数据,则可以复制粘贴该函数并将其用于数据)。
library(ggplot2)library(viridis) # Color palettelibrary(ggthemes)library(ggcor)gh_waffle
使用华夫饼图功能
gh_waffle()接受三个参数,第一个data是具有以下列的数据框date:(类型:日期),year(数字或字符),week(数字),day(使日期从图的顶部到底部连续的有序因素)和hours(数字) 。第二个选项来pal指定由所使用的四个色调色板一个viridis,并且可以是“A”,“B”,“C”,或“D”。默认值为“ D”,这也是GitHub所使用的。最后一个选项dir指定色标的方向,可以是-1或1。GitHub的默认值为-1。
使用gh_waffle()默认设置,仅提供数据框d,将得到以下结果:
gh_waffle(d,pal = "D", dir = -1,type = 21)
方形
gh_waffle(d,pal = "D", dir = -1,type = 22)
菱形华夫饼图
gh_waffle(d,pal = "D", dir = -1,type = 23)
三角形华夫饼图
gh_waffle(d,pal = "D", dir = -1,type = 24)
gh_waffle(d,pal = "D", dir = -1,type = 25)
五角星的华夫饼图
厚哥的包,让我们可以使用五角星的华夫饼图
gh_waffle(d,pal = "D", dir = -1,type = "star")
饼图类型华夫饼图
gh_waffle(d,pal = "D", dir = -1,type = "pie2")
尝试不同配色方案
for (pal in c("A", "B", "C")) { gh_waffle(d,pal, dir = -1,type = "star")}