平常使用R的时候，会遇到一些小问题，这时就会去上网查，但查到结果，如果不记录起来，常常会遇到相同的问题时再次查询，费时费力，因此决定记录下这些零碎的R语言知识（不定时更新）
1.查看R版本号
version
2.输出的txt文件去掉第一列1，2，3…
在输出的参数加上
row.names=F3.R语言 scale()
之前只知道scale()是标化数据，不知道具体是怎么标化的，知其然，不知其所以然。
查了一下，scale()可以根据选的参数进行数据中心化与标准化。
1）数据的中心化是指数据集中的各项数据减去数据集的均值
2）数据的标准化是中心化之后的数据在除以数据集的标准差
a=c(-0.243421520939024,-0.176367905181818,-0.126644970576923)
b=scale(a)
4.数据筛选还是subset()最好用
dplyr包
5.调整因子的顺序，有时候画图的时候需要修改图例的顺序
#只有两组的时候，可用以下
test$orig.ident=factor(test$orig.ident,levels = c("A","B"))
#比较多，比如一列，可以用：
TF_rowname<-TF[,1]
TF_rowname=rev(TF_rowname)
TF$Motif<-factor(TF$Motif,levels =TF_rowname,ordered = T )
6.删去ggplot2 legend（图例）的标题
ggplot(carrots, aes(y=MeanLength, x=Farm, fill=Type)) +
geom_bar(position="dodge") +
theme(legend.position="top", legend.direction="horizontal") +
scale_fill_discrete("")或者
labs(fill="")参考的教程
https://www.656463.com/wenda/rhscggplot2zdtlbt_127
7.ggplot2常用的theme
参考链接：
8.ggplot2修改字体
axis.text.x：对x轴上字体修改
axis.text.y：对y轴上字体修改
axis.title.x：对x轴上标题修改
axis.title.y：对y轴上标题修改
legend.title：对图例标题进行修改
legend.text：对图例文本进行修改
element_blank()：空
axis.ticks.x ：对刻度线进行修改
p2=p1+theme(axis.text.x=element_text(family="Arial",size=10,color="black",angle=0))
p3=p2+theme(axis.text.y=element_text(family="Arial",size=10,color="black"))
p + theme(legend.title=element_text(color="purple",
face="bold",size=12))
#隐去x轴刻度线
p4=p3+theme(axis.ticks.x=element_blank())
#x,y轴标题取消
p3<-p2+theme(axis.title.x= element_blank(),axis.title.y= element_blank())参考文章：https://www.jianshu.com/p/8e33dc11ed8c
去除网格，边框与背景，还有极端点恢复（很好的一篇例子）
https://www.codenong.com/10861773/ grid介绍：
http://t.zoukankan.com/ljhdo-p-4874785.html 去除网格与背景
9.subset()
subset()用于筛选特别棒，但是我遇到过几次报错，整的很心烦，搜网上也没有啥方法，记录一下出错的原因
这里是两个data.frame，分别是geneid与geneid与位置信息的对应
以下是正确的代码
gene = read.table('id.txt',header = T,sep = '\t')
pos= read.table('pos.txt',header = T,sep = '\t')
subset(pos,id=="Ackr3",select=c(id,pos1))下面这句也是可行的：
以下是出现报错的语句：
10.删除文件
#删除文件，并返回逻辑值
file.remove()
#删除文件
unlink()
