001、root@PC1:/home/test# cat test.py ## 测试程序 #!/usr/bin/python in_file = open("a.fasta", "r") dict1 = {} for i in in_file: i = i.strip() if i.startswith(">"):
# Python计算DNA互补链 在生命科学中,DNA(脱氧核糖核酸)是遗传信息的载体。DNA 由两条互补的链组成,其中,一个链上碱基的顺序决定了另一条链上碱基的顺序。即 Adenine (A) 与 Thymine (T) 成对,Cytosine (C) 与 Guanine (G) 成对。在本教程中,我们将学习如何使用 Python 编写一个简单的程序来计算 DNA互补链。 ## 流程概
原创 10月前
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# Python处理FASTA文件:生成DNA互补序列 FASTA格式是一种广泛使用的生物信息学数据存储格式,常用于表示核酸和蛋白质序列。在许多生物学研究中,生成DNA序列的互补链是一个基本操作。本篇文章将介绍如何使用Python处理FASTA文件,提取DNA序列,并生成其互补序列。 ## 什么是互补序列? 互补序列是指DNA链中碱基之间的配对关系。A(腺嘌呤)配对T(胸腺嘧啶),C(胞嘧啶
原创 8月前
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Python学习笔记D3(列表与元组)列表定义语法 number=[1,2,3,4,5] print(number,type(number)) #[1,2,3,4,5] <class‘list’> week=[‘Monday’,’Tuesday’] mix=[1,’lgso’,2] empty=[] 关于更改列表内容的操作: append(object) :在列表末尾添加新的
• 循环嵌套介绍​​
转载 2023-06-27 21:44:31
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1.【描述】 脱氧核糖核酸(DNA)由两条互补的碱基链以双螺旋的方式结合而成。而构成DNA的碱基共有4种,分别为腺瞟呤(A)、鸟嘌呤(G)、胸腺嘧啶(T)和胞嘧啶(C)。在两条互补碱基链的对应位置上,腺瞟呤总是和胸腺嘧啶配对,鸟嘌呤总是和胞嘧啶配对。你的任务就是根据一条单链上的碱基序列,给出对应的互补链上的碱基序列。 【输入】 第一行是一个正整数n,表明共有n条要求解的碱基链。 以下共有n行,每行
# Python实现DNA序列互补链的生成 在生物学中,DNA(脱氧核糖核酸)是一个由核苷酸构成的双螺旋结构,其基本单位是核苷酸。我们知道,DNA的两个链是互补的,即在DNA的结构中,腺嘌呤(A)总是与胸腺嘧啶(T)配对,胞嘧啶(C)总是与鸟嘌呤(G)配对。在这篇文章中,我们将介绍如何使用Python编写程序来生成DNA序列的互补链。同时,内容会包括相应的流程图和旅程图,便于读者理解。 ##
原创 7月前
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Python编程中,"反向互补"是一个引起了极大关注的问题,特别是在涉及数据处理和算法优化时。通过分析如何实现Python中的反向互补,我们可以节省大量计算资源并优化程序性能。本博文将详细记录解决Python反向互补问题的过程,依次探讨背景定位、演进历程、架构设计、性能攻坚、故障复盘以及扩展应用。 ## 背景定位 在信息技术领域,我们常常会面临计算复杂性和性能瓶颈。Python语言因其灵活性
原创 6月前
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在这篇博文中,我将详细探讨如何解决“Python与C语言的互补”这一技术难题。我们将逐步分析协议背景、抓包方法、报文结构、交互过程、性能优化以及工具链集成。通过这样的结构,不仅帮助大家理解,但也实际展示了相关操作的具体实现。 --- ## 协议背景 在现代应用中,Python与C语言的结合极为常见,尤其是在性能要求较高或需要直接操作硬件资源的场合。我们可以将其穿插于许多互联网协议中,例如HT
原创 6月前
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# Python中的碱基互补配对 在生物学的领域中,DNA是遗传信息的载体,由四种核苷酸组成:腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)和鸟嘌呤(G)。DNA双链的互补配对是指,A总是与T配对,C总是与G配对。这一特性对于DNA的复制和修复至关重要。本文将探讨如何使用Python实现碱基互补配对,并给出相关代码示例,同时也会配以序列图与饼状图来更好地理解这一概念。 ## 碱基互补配对原理 在
原创 2024-09-28 04:39:26
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文章目录1 算法介绍2 算法实现2.1 陀螺仪角速度预积分2.2 加速度计线加速度修正2.3 磁力计修正3 其他算法 本文主要介绍《Keeping a Good Attitude: A Quaternion-Based Orientation Filter for IMUs and MARGs》一文的互补滤波算法论文下载地址https://www.mdpi.com/1424-8220/15/8/1
文章目录一、一阶低通滤波算法1.1 公式1.2 C代码二、一阶高通滤波算法2.1 公式2.2 C代码三、互补滤波算法3.1 前言3.2 公式3.2 C代码 一、一阶低通滤波算法  低通滤波(Low Pass Filter)用于从一个信号中去除高于某个频率的成分。它的基本原理是,信号中高于某个频率的成分在信号传输或接收过程中会发生衰减,而低于该频率的成分则不受影响。因此,通过将信号通过一个低通滤波
转载 2024-09-02 22:52:32
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最近项目上想用MPU6050来自动探测物体的转向角度,花了2天时间学习如何拿陀螺仪的姿态角度,发现蛮难的,写点笔记。 下面是哔哩哔哩的一堆废话讲解,只想看代码本体的可以直接跳到最后。应用场景是51单片机环境,有一块MPU6060,需要知道硬件板子水平摆放时,板子摆放的姿态和旋转的角度。编译环境只能用C语言。 首先单片机通过TTL串口接到MPU6050上拿到通信数据,水平旋转角度需要另外加地磁仪通过
1. 序列联配(Alignment)的目的:所有的建树方法都假设一组同源序列内任意一列中的所有碱基也都是同源的(即都是起源于祖先序列中相同位置的碱基)。若没有插入和突变(统称为:indels),那么两条序列是一样长的,且从头到尾每个碱基都是同源匹配的。但实际上插入缺失是确实存在的,这会改变序列长度,移动碱基的位置,且会影响氨基酸的序列。然而,序列比对(Alignment)就是在序列中引入
转载 2024-05-18 09:59:46
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/*=====================================配对碱基链总时间限制: 1000ms 内存限制: 65536kB描述脱氧核糖核酸(DNA)由两条互补的碱基链以双螺旋的方式结合而成。而构成DNA的碱基共有4种,分别为腺瞟呤(A)、鸟嘌呤(G)、胸腺嘧啶(T)和胞 嘧啶(C)。我们知道,在两条互补碱基链的对应位置上,腺瞟呤总是和胸腺嘧啶配对,鸟嘌呤总是和胞嘧啶配对。你的任
DNA计算概念理解发展历程发展现状DNA计算综述参考总结单个活细胞实现ANN参考总结基因转录翻译成蛋白实现简单分类器-感知机参考总结 概念理解DNA计算是一种全新的计算模式,也是信息科学与生物科学相结合的一种新兴思维模式。其基本思想是利用生物有机分子的信息处理能力来代替数字物理开关元器件,即利用DNA分子的双螺旋结构和碱基互补配对的性质,将所要处理的问题编码为特定的DNA分子链,当输入的DNA
转载 2023-07-11 09:27:00
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对生物有一定了解的朋友都知道DNA是染色体的重要组成部分,DNA结构中包含重要的遗传物质,孩子的DNA来自父母DNA的组合,这就是为什么“一家人相像”的奥秘所在。ChemDraw虽然号称是化学结构绘制工具但是它并不仅仅只能够用于化学领域,生物领域也是可以使用的。使用其他图形编辑器绘制DNA结构并不是一件特别简单的事情,但是使用ChemDraw的话就会变得异常简单,一、使用非ChemDraw绘制DN
转载 2023-12-28 15:47:44
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Description One measure of ``unsortedness'' in a sequence is the number of pairs of entries that are out of order with respect to each other. For instance, in the letter sequence ``DAABEC'', this meas
转载 2013-04-06 17:18:00
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方案:str = input()target_len = int(input
原创 2022-09-23 13:34:39
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文章目录前言结构体TIM_OC_InitTypeDefOCMode(输出通道模式)Pulse(脉冲值)OCPolarity(输出极性)OCNPolarity(互补输出通道极性)OCFastMode(输出通道快速模式)OCIdleState(输出通道闲置状态)OCNIdleState(互补输出通道闲置状态)源代码主函数配置TIM3_PWM_InitHAL_TIM_PWM_InitHAL_TIM_P
转载 2023-12-03 00:41:29
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