http://www.ebi.ac.uk/ena/about/sra_format Read metadata format Metadata is represented using XML documents. For detailed infor
原创
2023-11-08 09:08:18
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使用SRAdb V2获取SRA数据安装SRAdbV2包install.packages('BiocManager')BiocManager::install('seandavi/SRAdbV2')使用S
原创
2023-11-02 10:42:43
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所谓SoS思维，就是基于SoS之概念而去看待我们周遭的复杂系统；定义如下：在一群不同系统相互连接起来，而产生个别所无法达成的整体效果。一个SoS有发挥其特有功能和效果，必须依赖小系统之间互相协调与合作。尤其小系统之间的信息交换是发挥SoS整体效果的基础。SoS的特性包括：个别系统都能独立运作与管理、可分布于各地方、可各自成长，但是一旦连结起来，就会呈现出整体的特殊效果。说明如下：Operation
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2023-09-16 12:08:39
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前言测序成本的降低和测序速度的增加导致提交到SequenceReadArchive(SRA)的数据呈爆炸性增长，于是NCBI推出了SRAtoolkit技术来对数据进行压缩，以减少存储成本，SRAtoolkit可以从SRA数据库读（“dumping”）序列文件，也可以将文件写("loading")成.sra格式。由于使用了完全索引的柱状数据库（fullyindexedcolumnardatabase
原创
2021-03-28 06:47:51
6493阅读
http://blog..net/cslie/article/details/2158780SOS 调试扩展 (SOS.dll) 提供公共语言运行时(CLR)内部环境的有关信息，帮助你在WinDbg.exe调试器和Visual Studio中调试托管程序。![command] [options]命令命令描述BPMD[ ] [-md]建立一个断点在指定模块的指定方法上
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2013-12-21 16:00:00
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在这个博文中，我们将深入探讨如何使用 Java 处理 SRA（Sequence Read Archive）数据。SRA 数据是生物信息学中的重要数据格式，通常用于存储高通量测序的数据。处理这些数据不仅要求我们具备扎实的编程技能，更需要理解数据的结构和处理流程。本文将详细介绍问题背景、错误现象、根因分析、解决方案、验证测试，以及预防优化。
## 问题背景
在现代生物信息学中，处理 SRA 数据的
SOAP 简单对象协议。指定通讯的消息格式，一条SOAP消息就是一个简单的XML文档。HTTP/SMTP 在应用层进行通讯的协议。自身使用XML文件来描述程序的函数方法与参数消息，从而完成不同主机的异构系统间的计算服务处理。WSDL也是一个XML文档，向公众描述某个具体的WebService的URL信息，方法的命名，参数，返回值等。SMTP 简单邮件传输协议HTTP 超文本
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2023-12-01 14:46:31
171阅读
在Linux系统中，使用Aspera下载SRA文件是一种高效且快速的方式。SRA文件是NCBI数据库中的一种数据格式，包含了原始测序数据。而Aspera是一种文件传输协议，通过该协议可以在高速网络环境下实现快速的文件传输。本文将介绍如何在Linux系统中使用Aspera下载SRA文件。
首先，我们需要安装Aspera Connect软件。在Linux系统中，可以通过命令行安装Aspera Con
原创
2024-05-28 11:00:00
180阅读
# ClioSoft SOS: 一个用于电子设计和团队协作的解决方案
等；设备资源调整包括网关服务节点、节点服务升级、节点外设增删等。不仅限于上述场景，都要求系统架构在设计开发、集成、系统运行、多设备协作等方面有超高的灵活性。以前单Master的系统架构要转向多智体灵活协作的模式。需求分析从垂直方向看，应用程序运行时占用了相
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2024-04-12 22:02:46
322阅读
常见的版本控制管理工具 配置管理工具是配置管理相关理论的实践载体，工具的功能范围在某种程度上可以直接影响一个组织中配置管理水平的高低。 所以，选择一个符合自己组织的配置管理工具，是一些企业建立配置管理规程，实施配置管理实践过程中的重要一环。 以下介绍几种常见的版本控制管理工具。 1、VSS-- Visual Source Safe
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2024-03-14 17:14:55
511阅读
简介SRA数据库是美国国立卫生研究院（NIH）的高通量测序数据的主要归档，是国际核苷酸序列数据库协作（INSDC）的一部分，其中包括NCBI序列读取存档（SRA），欧洲生物信息学研究所（EBI）和DNA数据库 日本（DDBJ）。 提交给三个组织中的任何一个的数据都是共享的。SRA数据库数据来自高通量测序平台（Roche 454 GSSystem®，Illumina GenomeAnal
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2023-07-29 20:33:32
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The Sequence Read Archive (SRA) is an archive for high throughput sequencing data, publically accessible, for the purpose of enhancing reproducibility
原创
2023-11-02 10:43:01
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在数据分析和机器学习中，分段回归（Segmented Regression）是一种有效的方法，用于处理具有不同特性的线性回归问题。分段回归SRA（Segmented Regression Analysis）是一种流行的实现方式，允许通过设置多个线性段来拟合复杂的数据模式。在本文中，我将通过详细的版本对比、迁移指南、兼容性处理、实战案例、性能优化和生态扩展等方面，深入探讨如何使用Python进行分段
一、SOS扩展命令 SOS包含几十个命令，要熟练使用SOS，首先要了解SOS有哪些命令。下面给出SOS命令列表。命令描述BPMD [<module name> <method name>] [-md <MethodDesc>]建立一个断点在指定模块的指定方法上。如果指定模块和方法尚未被载入，该命令等到该模块被载入并且被即时(just-in-
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精选
2015-12-07 17:43:25
1375阅读
一、SOS扩展命令 SOS包含几十个命令，要熟练使用SOS，首先要了解SOS有哪些命令。下面给出SOS命令列表。命令描述BPMD [<module name> <method name>] [-md <MethodDesc>]建立一个断点在指定模块的指定方法上。如果指定模块和方法尚未被载入，该命令等到该模块被载入并且
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2024-06-23 13:34:56
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【1】前置情况介绍（1.1）进程的状态转换 在说明SOS_SCHEDULER_YIELD等待之前，先简要介绍一下进程的状态（迷迷糊糊记得操作系统原理课上讲过，三态五态转换的，比下面这个图要复杂，大部分都还给老师了）。 如下图，分别是：运行态，阻塞态，就绪态。各个状态之间的转换关系及粗略原因如下： 运行态-->阻塞态，原因：等待某种资源的完成，比如IO等。 阻塞态-->就绪态，原
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2024-05-28 21:09:27
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# 科普文章：ClioSoft SOS 配置
## 什么是ClioSoft SOS？
ClioSoft SOS 是一个软件版本控制系统，专门为电子设计团队设计。它提供了版本控制、团队合作、数据管理和项目管理等功能，帮助设计团队更高效地工作。
## ClioSoft SOS 配置步骤
### 步骤一：安装ClioSoft SOS
首先，你需要下载并安装ClioSoft SOS。在安装完成后
原创
2024-02-24 04:26:11
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# Cliosoft SOS开源：理解和使用开源项目
随着开源项目的兴起，软件开发的生态系统也在不断变化。Cliosoft SOS (Software Orchestration System) 就是这样一个开源项目，它为团队提供了在复杂的软件开发环境中进行有效协作的工具。本篇文章将介绍Cliosoft SOS的基本概念和使用方法，并通过代码示例和图表帮助大家更好地理解。
## 什么是Clio
