1. 数据的处理函数1.1 数学函数1.2 统计函数1.3 概率函数#绘制正太分布曲线
x<-pretty(c(-3,3),30)
y<-dnorm(x)
plot(x,y,type="l",xlab="Normal Deviate",ylab="Density",yaxs="i")1.4 字符处理函数a<-5
sqrt(a)
[1] 2.24
b<-c(1.243,5.6
# 使用R语言的ggplot2进行聚类分析
聚类分析是一种无监督学习技术,用于将数据点归类为若干个组,使得同一组内的数据点相似度较高,而不同组的数据点差异较大。在这篇文章中,我们将使用R语言中的ggplot2包来可视化聚类结果。我们将通过一个实例来演示如何进行数据预处理、计算聚类以及可视化聚类结果。
## 数据准备
在数据分析中,数据的清洗和准备是至关重要的一步。我们将使用R内置的iris数
原创
2024-10-09 04:42:39
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R语言是一种流行的数据分析和统计建模工具,可以用于处理和分析各种类型的数据。其中一个功能强大的包是cluster,它提供了一系列的聚类分析算法和可视化工具。在本文中,我们将介绍如何使用cluster包来进行COG(Cluster of Orthologous Groups)数据的可视化。
COG是一种用于基因组学和系统生物学研究的分类系统,它将已知的蛋白质序列分为不同的聚类。每个聚类代表了一组具
原创
2023-11-14 11:20:42
479阅读
EigenEigen库的介绍一、Eigen的安装二、Eigen的头文件三、矩阵和向量3.1矩阵和向量的定义3.2矩阵的基础操作四、geometry模块4.1初始化4.2矩阵变换五、Ax=b的求解方法 Eigen库的介绍Eigen是一个只包含头文件的库,由于在SLAM中经常需要使用Eigen,所以想要对Eigen的结构和使用方法记录总结,方便以后查询一、Eigen的安装Eigen的安装十分简单,只
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2024-05-15 06:30:05
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如何实现 Cluster Centroid 的均值
## 概述
在机器学习中,聚类是一种常用的无监督学习方法,它将数据集中的样本分成若干个类别,每个类别包含相似的样本。而 Cluster Centroid 就是每个类别的中心点,表示该类别的特征。本文将介绍如何使用 R 语言计算 Cluster Centroid 的均值。
## 实现流程
下面是计算 Cluster Centroid 的均值
原创
2024-01-07 10:02:49
53阅读
# R语言 cluster 中药聚类实现流程
## 概述
在这篇文章中,我将向你介绍如何使用R语言中的cluster包进行中药聚类分析。中药聚类分析是一种常用的数据分析技术,可以帮助我们发现中药在化学成分上的相似性和差异性,从而为中药研究提供指导和参考。
## 流程图
首先,让我们来看一下整个实现流程的流程图:
```mermaid
flowchart TD
A[数据预处理] -->
原创
2024-02-04 03:51:43
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在数据分析和计算中,"cluster参数没有用"的问题在R语言中常常会困扰用户。这不仅影响了计算的效率,还可能导致结果的不准确。本文将详细记录如何解决这一问题,探讨相关的参数及其影响,以确保数据分析工作的顺利进行。
### 背景定位
在进行大规模数据分析时,我们常常会使用到聚类分析(clustering)方法,而“cluster”参数的合理配置对于分析的结果起着至关重要的作用。如果该参数未能有
简介上期我们说了气泡图。如果我们将气泡图的三维数据绘制到三维坐标系中,通常称其为三维散点图,即用在三维X-Y-Z图上针对一个或多个数据序列绘出三个度量的一种图表。有关散点图前几部分系列可见(可跳转):趋势显示的二维散点图分布显示的二维散点图气泡图R 中scatterplot3d包的scatterplot3d()函数、rgl包的plot3d()函数、plot3D包的scatter3D()函数等都可以
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2023-11-08 20:48:33
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# R语言中的Cluster函数及其概率分析
R语言是一种广泛使用的统计编程语言,它提供了大量的包和函数来处理各种数据科学问题。在聚类分析中,`cluster`包是一个非常重要的工具,它提供了多种聚类算法。本文将介绍`cluster`包中的一个核心函数`kmeans`,以及如何使用它来进行概率聚类分析。
## 聚类分析简介
聚类分析是一种将数据集中的样本划分为多个组或“簇”的无监督学习方法。
原创
2024-07-23 10:58:02
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写在前面在去年10月份,出过一起关于R语言无法调用stats.dll的问题解决方案,今天(你看到后是昨天)不知道为什么,安装包,一直安装不了,真的是炸裂了。后面再次把R与Rstuido升级。说实话,我是真不想折腾升级这些,因为,只要升级,环境多多少少可能会有变化,这次,我就是其中一个。那么遇到的问题,也是前面遇到的一模一样。但是,使用前面的解决方案行不通了,自己只能再次查找解决方案。emm,一折腾
在之前的文章中分享了一致性聚类的原理,本文介绍下如何用R语言进行分析。ConsensusClusterPlus这个R包,就是专门用于一致性聚类分析的,为了简化调用,甚至将所有的步骤都封装到了一个函数里面,所以其使用方法非常的简单,一共三步1. 加载R包2. 把表达量数据读进去3. 运行一致性聚类的函数是不是和把大象装进冰箱一样简单,但是我们必须注意,这样简单的背后,实际是一个黑盒子,如果不了解原理
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2024-07-01 05:45:04
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一、大概思路:1.在某范围内随机生成k个初始点作为质点,即k个簇;2.将数据集中的点分到与其距离最近的质点所在的簇;3.对于每一个簇,计算该簇所有点的平均值,得到该簇的中心,将该点作为新的质点,重新进行步骤2,直到所有簇不再变化。 二、上代码1.获取数据集def loadDataSet(fileName):
# 初始化返回变量
dataMat = []
# a.要
注: 本文是R语言sf包的核心开发者和维护者——来自德国明斯特大学的地理信息学教授:
Edzer Pebesma 的一篇关于sf包的简介,发表于2018年7月的R语言期刊,主要讲述了sf的定位、功能、开发现状及现存问题和今后展望,sf包是一个非常了不起的工具,在R语言中引入了空间数量分析领域通用的标准规范(simple feature),结合tidyverse工具箱组合
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2023-06-30 18:38:28
422阅读
IRIS数据集简介IRIS数据集中的数据源于1936年费希尔法发表的一篇论文。彼时他收集了三种鸢尾花(分别标记为setosa、versicolor和virginical)的花萼和花瓣数据。包括花萼的长度和宽度,以及花瓣的长度和宽度。我们将根据这四个特征来建立支持向量机模型从而实现对三种鸢尾花的分类判别任务。有关数据可以从datasets软件包中的iris数据集里获取,下面我们演示性地列出了前5行数
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2023-11-27 19:36:12
117阅读
1.单因素方差分析:适用于单因素A有两个水平或以上,研究个水平对因变量的影响正态假设条件:W检验shapiro.test():原假设为数据来自正态分布方差齐性条件:Bartlett检验(主要用于正态分布的数据) bartlett.test(x, g, ...)x是数据向量或列表(list);g是因子向量,如果x是列表则忽略g。 当使用数据集时,也可以通过formula调用函数&
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2023-06-25 20:40:28
273阅读
安装R和Rstuido软件 R语言是用于统计分析,图形表示和报告的编程语言和软件环境;Rstudio是编辑、运行R语言的最为理想的工具之一。1、官网下载R安装包 下载地址为:https://cran.r-project.org 进入链接,如下图所示,在页面顶部提供了三个下载链接,分别对应三种操作系统:Windows、Mac和Linux。请选择自己操作系统对应的链接,接下来我将以windows为例给
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2023-08-10 13:02:35
214阅读
R语言有两种不同的OOP机制,分别是从其前身S语言继承而来的S3 Object和S4 Object,其中S4 Object更加的正式、也是现在用于开发的主力军,所以本文就从S4 Object谈起,并在最后讨论一下古老的S3 Object。那我们就开始吧!首先我们来设计一个时间序列类,在它的内部,需要包含主数据、起始时间与截止时间、取样间隔这些数据。在R中我们可以定义如下:setClass("Ti
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2023-08-25 00:50:38
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R语言如何计算矩阵的行均值?目录R语言如何计算矩阵的行均值?R语言是解决什么问题的?R语言如何计算矩阵的行均值?R语言是解决什么问题的?R 是一个有着统计分析功能及强大作图功能的软件系统,是由奥克兰大学统计学系的Ross Ihaka 和 Robert Gentleman 共同创立。由于R 受Becker, Chambers & Wilks 创立的S 和Sussman 的Scheme 两种语
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2023-08-07 10:38:41
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R语言入门学习笔记
从2018年秋季(大二上学期)开始接触R语言,曾在2019年寒假读过一遍本书的第一版,感觉受益匪浅,之后遇到问题也曾回头来查阅这本书,前几天刚学习过Simulink,趁现在有空再来温习这本书,回顾一下代码和各种命令,简单记录。虽然感觉R的功能和用途不如MATLAB广泛,但是需要派上用场的时候如果能熟练地运用真的是很好的体验。R用方括号
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2023-06-25 11:56:37
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关于softmax regression的数学模型部分可以参考Stanford的中英文Wiki:http://ufldl.stanford.edu/wiki/index.php/Softmax%E5%9B%9E%E5%BD%92 softmaxregR包的下载地址:https://cran.r-project.org/web/packages/softmaxreg/index.html一
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2024-04-18 15:05:05
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