上次我们分享了：全基因组DNA甲基化实验怎么做：手把手教你做全基因组DNA甲基化测序分析，深受同学们的欢迎。本期，易基因小编给您讲讲简化基因组DNA甲基化实验怎么做，从技术原理、建库测序流程、信息分析流程等三方面详细介绍。 一、简化基因组DNA甲基化测序（RRBS）技术原理简化基因组甲基化测序 (Reduced Representation Bisulfite S
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2023-08-02 22:09:44
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大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。简化甲基化测序(Reduced Representation Bisulfite Sequencing,RRBS)是利用限制性内切酶对基因组进行酶切，富集启动子及CpG岛等重要的表观调控区域并进行重亚硫酸盐测序该技术显著提高了高CpG区域的测序深度，在CpG岛、启动子区域和增强子元件区域可以获得高精度的分辨率，是一种准确、高效、经济的D
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2024-01-18 15:33:19
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易基因：简化甲基化测序(RRBS)在植物生态表观基因组学中的机遇和局限｜深度综述大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。2019年，《New Phytol》杂志发表了题为“Opportunities and limitations of reduced representation bisulfite sequencing in plant ecological e
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2024-05-18 11:11:28
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报错如下：1130-Host 'LAPTOP-QO05RRBS' is not allowed to conne
原创
2021-07-13 10:07:10
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methylKit 是一个用于分析甲基化测序数据的R包，不仅支持`WGBS，`RRBS`和目的区域甲基化测序
原创
2022-06-21 05:28:07
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本期，我们讲讲精准简化基因组甲基化测序（RRBS+oxRRBS）怎么做，从技术原理、建库测序流程、信息分析流程等方面详细介绍。 一、精准简化基因组甲基化测序(RRBS+oxRRBS)技术概述5-羟甲基化胞嘧啶（5hmC）是甲基化胞嘧啶（5mC）去甲基化过程中的中间产物，由TET家族酶类通过氧化甲基化胞嘧啶⽽产⽣。甲基化胞嘧啶和羟甲基化胞嘧啶在基因组DNA中存在⼴泛，均可明显影响基因的时空
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2024-01-09 07:58:44
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分析DNA甲基化的手段有很多，除了甲基化芯片外，还有WGBS和RRBS等实验与高通量测序相结合的手段，不管是
原创
2022-06-21 05:36:29
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大家好，这是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。本期，我们讲讲精准简化基因组甲基化测序（RRBS+oxRRBS）怎么做，从技术原理、建库测序流程、信息分析流程等方面详细介绍。一、精准简化基因组甲基化测序(RRBS+oxRRBS)技术概述5-羟甲基化胞嘧啶（5hmC）是甲基化胞嘧啶（5mC）去甲基化过程中的中间产物，由TET家族酶类通过氧化甲基化胞嘧啶⽽产⽣。甲基化胞嘧啶和羟甲基化胞嘧啶
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2024-08-31 16:45:53
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RRBS甲基化流程分析流程和普通的测序分析一致，首先fastqc质量检测，接着对序列进行修剪，修剪后再质量检测；如果质量检测通过，则进行序列回帖，然后去除重复，计算甲基化程度，以及一些后续分析，本次后续分析使用R包methlykit以及edmr，还有其他一些甲基化分析软件可以参见附录。流程命令比对流程首先进行fastqc质量鉴定，如果需要的话，再去除接头，PS：去除接头后需要重新进行质量鉴定 接下
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2024-07-04 17:32:44
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DNA甲基化是最早被发现的表观修饰之一，引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变，从而控制基因表达。DNA甲基化修饰参与了多个生物学过程，包括细胞分化、胚胎发育、X染色体失活、组织特异性等，与癌症、衰老、老年痴呆、糖尿病等多种复杂疾病密切相关。DNA甲基化的检测方法包括WGBS、MeRip、RRBS、芯片技术等等。基于芯片的甲基化图谱分析，目前包括Agilent平
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2024-09-27 20:08:00
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大家好，这是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。与常规RRBS不同，高通量单细胞甲基化测序sc-RBS由于从单个细胞输入的DNA量很少，常规方法不能保证目标DNA在最后的扩增过程中保持不变，因此sc-RBS在降损方面进行细化。易基因建立的高通量单细胞甲基化测序sc-RBS技术无需纯化，通过限制性内切酶消化、接头连接过程和在单管中转化重亚硫酸盐，是一种专注于将纯化过程中发生的损失降至最低
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2024-06-28 18:32:30
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摘要甲基化在真核生物基因组序列中广泛存在，其中5mC最为普遍，在真核生物基因组中也有发现6mA。捕获基因组中的甲基化状态的常用技术是全基因组甲基化测序（WGBS）和简化甲基化测序（RRBS），而随着第三代测序技术的完善，ONT单分子纳米孔测序可以从单分子的角度来检出甲基化的胞嘧啶和腺嘌呤电流的变化，从而实现由基因组中的一段序列中检出5mC和6mA，然而精确地从单碱基级别检出5mC和6mA扔具有挑战
摘要在哺乳动物基因组中临近的CpG位点在持续的甲基化转移酶和脱甲基化酶的作用下能产生共甲基化。但同时也观察到了混乱的甲基化模式，可能与随机或者不协调的分子过程有关。研究人员关注于系统地搜索和观察在人类基因组中展示出高度一致甲基化的区域。他们在分析了61个全基因组重亚硫酸盐测序数据后，定义了147888个紧密的CpG位点组成的块，称为甲基化单倍型块，并使用101个RRBS数据和637个甲基化芯片数据
原创
2021-03-27 07:28:07
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