IQtree 是一款用于构建系统发育树的软件,支持 Phylip、Fasta、Nexus、Clustalw 等多序列比对后的数据格式。但随着 SNP 数据费用的大幅下降,研究人员利用 SNP 数据构建系统发育树的情况越大越多。本文为用 vcf 格式的 SNP 数据构建系统发育树的教程,主要包括:Vcf 文件转 Phylip 文件、Phylip 文件输入 IQtree 建树 两部分。数据集本教程使
转载 2024-03-30 20:05:58
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文章首发于简书b站,自己百度标题就能找到。这个教程我做得非常好,不仅安装好了R,Rtools,Rstudio,还设置了镜像,示范安装R包,把许多散乱的教程都统一起来了,R语言初学者值得一看。前面的文章请看:TBtools进行序列提取;基因家族的鉴定blast和hmmer;基于Windows系统的iqtree系统进化树;关于Windows系统上的java安装R与Rstudio的安装。R语言是一种专门
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