一、斐波那契数列(递归VS动态规划)1、斐波那契数列——递归实现(python语言)——自顶向下递归调用是非常耗费内存的,程序虽然简洁可是算法复杂度为O(2^n),当n很大时,程序运行很慢,甚至内存爆满。1 def fib(n): 2 #终止条件,也就是递归出口 3 if n == 0 or n == 1: 4 return 1 5 else: 6
# DNA匹配python算法实现 ## 1. 概述 在这篇文章中,我将向你介绍如何使用Python实现DNA匹配算法DNA匹配是一种用于比较DNA序列之间相似性的算法。我们将通过以下步骤来实现这个算法: 1. 输入两个DNA序列 2. 比较两个序列 3. 计算相似性得分 4. 输出结果 ## 2. 实现步骤 下面的表格将展示整个算法的步骤: | 步骤 | 描述 | | --- | --
原创 2023-09-16 17:30:25
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二分查找:def BiSearch(li:[],key): length = len(li)
原创 2022-09-23 13:33:47
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冒泡:def
原创 2022-09-23 13:34:00
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function pair(str) {//定义DNF匹配对 var fr=["A","T","C","G"]; var ed=["T","A","G","C"];//初始化 var array=[];//将字符串转为数组 str=str.split('');//使用遍历 str.forEach(function(val
原创 2021-11-16 15:25:17
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描述 一个DNA序列由A/C/G/T四个字母的排列组合组成。G和C的比例(定义为GC-Ratio)是序列中G和C两个字母的总的出现次数除以总的字母数目(也就是序列长度)。在基因工程中,这个比例非常重要。因为高的GC-Ratio可能是基因的起始点。给定一个很长的DNA序列,以及限定的子串长度N,请帮助研究人员在给出的DNA序列中从左往右找出GC-Ratio最高且长度为N的第一个子串。 DNA序列为A
原创 2023-03-14 18:21:53
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聚类含义定义:聚类,也叫做聚类分析,依据对象的属性,将相似的对象归位一类。聚类,就是寻找发生数据之间内在联系的方法。 分类:从聚类的类型来讲,一般有结构性聚类、分散性聚类、密度聚类等。结构性聚类是指,可以从上至下或者从下至上双向进行计算。从下至上是以单个对象开始,不断与周围相近的对象进行融合,最终将全部数据分成多种类别。而从上至下算法则恰恰相反,它先将全部数据当作一个整体,然后逐渐分小。在结构性聚
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BWT(Burrows-Wheeler Transform)是一种常用的数据压缩算法,适用于DNA数据的压缩。在本文中,我将教你如何使用Python实现BWT DNA数据压缩算法。 ## BWT DNA数据压缩算法的流程 要实现BWT DNA数据压缩算法,可以按照以下步骤进行操作: | 步骤 | 描述 | | --- | --- | | 1 | 将DNA序列进行循环旋转,并按字典序排序 |
原创 2024-01-29 08:36:48
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DNA测序(A,T,C,G),DNA一级结构。核苷酸序列测定的两种方法第一代DNA测序:1、Snager双脱终止法(双脱氧链末端合成终止法)2、Gibert化学降解法3、荧光自动化测序测序的机理??DNA测序:(最初的测序仪一次只能测4个样,且分四个用到进行)在DNA合成的基础上,采用高分辨率的聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)【 聚丙烯酰胺凝胶电泳( polyacrylamide gel elect
转载 2024-05-07 15:06:42
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DNA计算概念理解发展历程发展现状DNA计算综述参考总结单个活细胞实现ANN参考总结基因转录翻译成蛋白实现简单分类器-感知机参考总结 概念理解DNA计算是一种全新的计算模式,也是信息科学与生物科学相结合的一种新兴思维模式。其基本思想是利用生物有机分子的信息处理能力来代替数字物理开关元器件,即利用DNA分子的双螺旋结构和碱基互补配对的性质,将所要处理的问题编码为特定的DNA分子链,当输入的DNA
转载 2023-07-11 09:27:00
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对生物有一定了解的朋友都知道DNA是染色体的重要组成部分,DNA结构中包含重要的遗传物质,孩子的DNA来自父母DNA的组合,这就是为什么“一家人相像”的奥秘所在。ChemDraw虽然号称是化学结构绘制工具但是它并不仅仅只能够用于化学领域,生物领域也是可以使用的。使用其他图形编辑器绘制DNA结构并不是一件特别简单的事情,但是使用ChemDraw的话就会变得异常简单,一、使用非ChemDraw绘制DN
转载 2023-12-28 15:47:44
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Description One measure of ``unsortedness'' in a sequence is the number of pairs of entries that are out of order with respect to each other. For instance, in the letter sequence ``DAABEC'', this meas
转载 2013-04-06 17:18:00
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方案:str = input()target_len = int(input
原创 2022-09-23 13:34:39
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题目链接:http://acm.hdu.edu.cn/showproblem.php?pid=1560 DNA sequence Time Limit: 15000/5000 MS (Java/Others) Memory Limit: 32768/32768 K (Java/Others) Tot
转载 2017-09-08 16:04:00
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O(1) < O(logn) < O(n) < O(nlogn) < O(n^2) < O(n^2logn) 于斜率唯一的曲线。...
原创 2022-09-23 13:33:25
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DNA 测序技术用以分析特定DNA 片段的碱基序列(腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)与鸟嘌呤(G))的排列方式.图2 DNA 测序及拼接过程示意图 Fig. 2 Diagram of DNA sequencing and assembly测序完成后的第一步也是最重要的一步就是根据读序拼接回贴成完整的序列,其测序与拼接过程如图2 所示.拼接算法用于将测出的读序拼接成完整的染色体序列(chr
一,Python中运行JS代码1-1  解决中文乱码或者报错问题import subprocess from functools import partial subprocess.Popen = partial(subprocess.Popen, encoding='utf-8') import execjs1-2 常用函数print(execjs.get().name) # 获取js
阅读本文大约需要 10 分钟。 在 Python 开发中,我们经常会看到使用装饰器的场景,例如日志记录、权限校验、本地缓存等等。 使用这些装饰器,给我们的开发带来了极大的便利,那么一个装饰器是如何实现的呢? 这篇文章我们就来分析一下,Python 装饰器的使用及原理。 一切皆对象 在介绍装饰器前,我们需要理解一个概念:在 Python 开发中,一切皆对象
DNA Consensus StringTime limit: 3.000 secondsFigure 1.DNA (Deoxyribonucleic Acid) is the
原创 2022-11-28 23:02:26
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对于每一个进入生物领域的人,基本都避免不了分子克隆(认知的同胞除外),当然就需要一个称手的 DNA 比对软件。今天给大家强烈推荐一款 DNA 比对软件,APE(a plasmid editor)。这款软件不仅能做 DNA 序列比对,DNA 序列翻译,还能够做引物设计,酶切位点设计,质粒图谱构建(这个还是 snapgene 更好用,不过人家是收费的),ORF 查找等非常多的实用功能,下面我来详细介绍
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