1.什么是序列？序列就是字符串。s就是一个序列。（原来序列是这么简单的，听着太高大上了）蛋白质序列：由20个不同的字母（氨基酸）排列组合而成。核酸序列：由4个不同的字母（碱基，ATCGU）排列组合而成，包括DNA序列和RNA序列。FASTA格式：第一行＞表示注释；第二行及以后：每行60个字母或80，不一定。 图1.数据格式2.序列相似性图2.相似比较图中显示了序列的相似性比较，对于序列长
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2024-11-02 14:30:35
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题目背景大家都知道，基因可以看作一个碱基对序列。它包含了在一个人类基因工作组的任务中，生物学家研究的是：两个基因的相似程度。因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用。题目描述两个基因的相似度的计算方法如下：对于两个已知基因，例如这样,两个基因之间的相似度就可以用碱基之间相似度的总和来描述，碱基之间的相似度如下表所示：那么相似度就是：相似度为：输入输出格式输入格式： 共两行。每行首先是一
dtw路径与线性变换路径对比 在孤立词语音识别中，最为简单有效的方法是采用DTW（Dynamic Time Warping，动态时间归整）算法，该算法基于动态规划（DP）的思想，解决了发音长短不一的模板匹配问
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2024-08-12 15:56:19
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什么是DTW？DTW算法采用了动态规划DP（dynamic programming）的方法来进行时间规整的计算，可以说，动态规划方法在时间规整问题上的应用就是DTW。为什么需要DTW算法当两个序列按照时间步t完全对齐的时候，我们可以直接使用ED算法（或者其它距离计算）来评估两个算法的相似度。但是有些时候两个序列并未完全对其，如果我们将某一序列进行压缩处理，此时会有信息损失。那么是否可以将两个长度不
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2024-06-06 11:07:30
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提供了这么好的总结！！！在做分类时常常需要估算不同样本之间的相似性度量(Similarity Measurement)，这时通常采用的方法就是计算样本间的“距离”(Distance)。采用什么样的方法计算距离是很讲究，甚至关系到分类的正确与否。 本文的目的就是对常用的相似性度量作一个总结。 本文目录：1. 欧氏距离2. 曼哈顿距离3. 切比雪夫距离4. 闵可夫斯基距离5. 标准化欧氏距
Efficient and Effective Similar Subtrajectory Search with Deep Reinforcement Learning摘要：相似轨迹搜索是一个基本问题，在过去的20年里已经得到了很好的研究。然而，类似的子轨迹搜索(SimSub)问题，目标是返回轨迹的一部分(即子轨迹)，这是与查询轨迹最相似的，尽管它可以以一种更细粒度的方式捕获轨迹相似性，并且许多
# 如何实现Python中的DTW相似度
## 概述
在这篇文章中，我将向你介绍如何使用Python实现DTW（Dynamic Time Warping）相似度。首先我将介绍整个实现的流程，然后详细说明每一步需要做什么以及具体的代码。
### 流程图
```mermaid
journey
title DTW相似度实现流程
section 步骤
开始 --> 数
原创
2024-04-03 06:39:06
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目录1、基本介绍2、算法原理（理论原理）2.1 主要术语2.2 算法由来和改进过程2.3 DTW算法流程3、算法DTW和算法HMM的比较1、基本介绍DTW：Dynamic Time Warping，即动态时间归整。DTW算法基于DP动态规划思想，解决了发音长短不一的模板匹配问题，常用于语音识别（孤立词识别）。HMM算法在训练阶段需要提供大量的语音数据，通过反复急速那才能得到模型参数；而DTW算法的
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2023-07-18 17:01:17
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简介动态时间规整：(Dynamic Time Warping，DTW)定义：用于比较不同长度的两个数组或时间序列之间的相似性或计算两者间的距离。例1：a =[1,2,3],b=[3,2,2]例2：a=[1,2,3],b=[2,2,2,3,4]例1好计算，但对于例2，如何计算呢？即所谓的规整或扭曲。比较不同长度的数组的思想是构建一对多和多对一匹配，以便使两者之间的总距离最小化。DTW是计算给定两个序
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2023-08-04 18:02:33
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今天来和大家聊聊大家都在视频内容制作的时候比较关心的话题，视频的去重，首先我们来对齐下定义，什么是视频的查重？什么是视频查重？视频查重，顾名思义，是一种技术手段，旨在防止相同或类似的视频在在线视频平台上被重复上传，从而提高版权保护和内容安全性。视频去重的主要目的是检测视频内容的相似度，确定视频是否与平台上已有的其他视频重复或近似重复，进而加以删除或屏蔽。视频查重通常使用图像识别技术和
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2024-08-24 10:25:55
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【Matlab实现】动态时间规划调整算法（DTW算法）——计算两个序列之间的相似度概述算法原理与步骤算法的实现 概述DTW （Dynamic time warping）算法是可以度量两个独立时间序列的相似度的一种方法。曾被广泛应用在单词音频的匹配上。该方法主要用来解决在两段序列的时长不同的情况下，进行相似度的判断。 上图中，左侧时长相等，可以逐一进行欧式距离的计算，右侧则是时长不等，经过DTW之
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2023-10-17 09:58:58
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DTW为(Dynamic Time Warping,动态时间归准)的简称。应用很广，主要是在模板匹配中，比如说用在孤立词语音识别，计算机视觉中的行为识别，信息检索等中。可能大家学过这些类似的课程都看到过这个算法，公式也有几个，但是很抽象，当时看懂了但不久就会忘记，因为没有具体的实例来加深印象。 这次主要是用语音识别课程老师上课的一个题目来理解DTW算法。
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2023-07-18 17:00:56
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相似度计算总结 + 图解在数据分析和数据挖掘以及搜索引擎中，我们经常需要知道个体间差异的大小，进而评价个体的相似性和类别。常见的比如数据分析中比如相关分析，数据挖掘中的分类聚类（K-Means等）算法，搜索引擎进行物品推荐时。相似度就是比较两个事物的相似性。一般通过计算事物的特征之间的距离，如果距离小，那么相似度大；**如果距离大，那么相似度小。**比如两种水果，将从颜色，大小，维生素含量等特征进
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2023-10-08 14:41:28
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我们知道，对于个性化推荐来说，最核心、重要的算法是相关性度量算法。相关性从网站对象来分，可以针对商品、用户、旺铺、资讯、类目等等，从计算方式看可以分为文本相关性计算和行为相关性计算，具体的实现方法有很多种，最常用的方法有余弦夹角（Cosine）方法、杰卡德（Jaccard）方法等。Google对新闻的相似性计算采用的是余弦夹角，CBU的个性化推荐以往也主要采用此方法。从9月份开始，CBU个性化推荐
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2024-08-12 19:33:32
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# 深入理解 Python 中的动态时间规整（DTW）算法
**一、引言**
动态时间规整（Dynamic Time Warping，DTW）是一种用于衡量两个时间序列相似度的算法，尤其在时间序列数据具有时变性时，不同长度的序列可以通过 DTW 有效地进行匹配。
本文将为刚入行的小白开发者提供一个完整的 Python DTW 实现流程，逐步指导你通过代码实现 DTW 算法。
**二、DTW
# 教你用Python实现动态时间规整(DTW)算法
## 一、DTW算法简介
动态时间规整（Dynamic Time Warping, DTW）是一种用于衡量两个时间序列之间相似度的算法。与传统的欧几里得距离计算相比，DTW可以在时间轴上进行非线性对齐，是处理不等长时间序列时非常有效的工具。
### DTW算法主要步骤
在这里，我们将分步骤逐步实现DTW算法。以下是整个实现流程的概览：
作者：桂。时间：2017-05-31 16:17:29链接： 前言动态时间规整（Dynamic Time Warping，DTW）是孤立词识别的早期技术，梳理一下，主要包括： 1）孤立词识别操作步骤; 2）DTW原理;内容基本就是两个博文的整合，最后一并给出链接。一、孤立词识别操作步骤基本原理：基本操作是预加重、分帧，端点检测技术又叫有话帧检测（Voice activit
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2023-07-24 14:32:26
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DTW算法详解1.DTW1.1 时序相似度在时间序列数据中，一个常见的任务是比较两个序列的相似度，作为分类或聚类任务的基础。那么，时间序列的相似度应该如何计算呢？“ 经典的时间序列相似性度量方法总体被分为两 类: 锁步度量(lock-step measures) 和弹性度量(elastic measures) . 锁步度量是时间序列进行 “一对一”的比 较; 弹性度量允许时间序列进行 “一对多”的
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2023-11-04 23:00:57
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本文目录0. 写在前面1. Kmeans聚类算法2. 聚类评估指标2.1 内部评价指标2.2 外部评价指标3. 寻找最优k值的方法3.1 手肘法3.2 最大化轮廓系数法4. 算法改进尝试Version 1Version 25. 实验6. 总结 0. 写在前面这学期的多元统计分析课程安排了个presentation，主题任意，我就想到了一个我感兴趣的东西——kmeans算法的一大问题在于最优k值不
一、前言TF-IDF方法的主要思想是：如果某个词或短语在一篇文章中出现的频率(TF) 高，并且在其他文章中很少出现(IDF高)，则认为此词或者短语具有很好的类别区分能力。二、步骤首先对文档进行特征提取操作：（1）分割句子：按照空格进行分割，去除数字以及标点符号，并将所有字符全部小写；（2）去除词汇：去除代词、冠词等功能词；（3）词干提取：去除单词的复数、过去式、比较级、最高级等形式。然后对生成的语
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2023-11-16 21:39:35
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