文章目录什么是映射关系字典基本使用创建查询添加和修改删items()、keys()、values()其他方法字典的嵌套字典推导式集合 字典是Python中唯一实现映射关系的内置类型什么是映射关系类似于摩斯密码部分摩斯密码表字符密码字符密码字符密码A._F…_.K.B_…G__.L._…C..H…M__D_…I…N_.E.J.___O___其中 A 和._就是一对映射关系 K和._.又是另一对映射
转载
2024-05-31 15:19:30
53阅读
反密码子读码顺序的问题 (2014-06-30 18:25:29)正在上传…重新上传取消转载▼标签： 反密码子读码顺序的问分类： 高中教学 DNA分子模板链上的碱基序列携带的遗传信息最终翻译的氨基酸如下表,则右图所示的tRNA所携带的氨基酸是 A．赖氨酸 B．丙氨酸  
1.先根据你的蛋白序列，输入到http://mcl1.ncifcrf.gov/dnaworks/，选择相应的物种，就可以自动给出该物种的优化序列。参考下面的这篇文章：DNAWorks: an automated method for designing oligonucleotides for PCR-based gene synthesis.http://nar.oxfordjournals.o
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Utils/wprintgc.cgi[https://www.ncb...
原创
2022-07-16 00:29:38
73阅读
NKOJ 2406 翻译密码子 时间限制 : 10000 MS 空间限制 : 65536 KB 问题描述 DNA是一切细胞生物的遗传物质。它能指导蛋白质的合成，从而控制细胞的新陈代谢和生物的性状。 中心法则（genetic central dogma） 是所有有细胞结构的生物所遵循的法则，它的主要内容是遗传信息从DNA传递给mRNA，再从mRNA传递给蛋白质的转录和翻译的过程。 m
转载
2023-12-16 20:08:09
50阅读
密码子是按3个碱基翻译的，
所以从第一位开始翻译会得到一个氨基酸序列，
从第二位翻译会得到一个不同的氨基酸序列
从第三位开始又会得到一个不同的序列。
从第四位开始就会和第一个开始翻译的序列一样（因为这两个都是从序列里面的起始密码子开始翻译的），
所以相对于单链，会有3种翻译的方式，
同样的情况在互补链上也会有3种，所以就一共有六种翻译方式。读出六条序列，即6框翻译。
关于真核生物翻译的
转载
2024-07-04 22:33:29
73阅读
密码学是研究密码编制、密码破译和密钥管理的一门综合性应用科学。术语： 明文：被隐蔽的消息称作明文，通常用m表示。 Message，Plaintext密文：将明文隐蔽后的结果称作密文，通常用c表示。 Ciphertext 加密（ Encryption ）：将明文变换成密文的过程称作加密。脱密（ Decryption ）：合法用户由密文恢复出明文的过程称作脱密。密
转载
2024-01-02 16:52:53
77阅读
前言真核生物基因组存在64个密码子，这64个密码子编码20种不同的氨基酸和3个终止密码子，除蛋氨酸(Met)和色氨酸(Trp)外的所有氨基酸均由一个以上密码子编码。编码同一氨基酸的不同密码子互为同义密码子，不同的同义密码子被使用的频率并不一样，被频繁使用的密码子是“偏好密码子”，而其他密码子则是“非偏好密码子”，这种现象被称为“密码子偏好性”。 一般认为，密码子偏好性的成因是不同密码子对应的tRN
转载
2023-10-23 14:22:50
329阅读
# 密码子偏好性分析的R语言脚本
## 引言
在生物信息学中，密码子偏好性（Codon Usage Bias）是指在特定生物体中，不同密码子的使用频率差异。了解密码子偏好性对研究基因表达、蛋白质合成及进化生物学具有重要意义。本文将介绍如何使用R语言进行密码子偏好性分析，并通过示例代码进行说明。
## 何谓密码子
在基因组信息中，密码子是由三个核苷酸组成的遗传密码，用以编码氨基酸。不同的生物
Sentieon软件是通过改进算法模型实现性能加速(纯CPU环境，支持X86/ARM)，不依赖于昂贵高功耗的专用硬件配置（GPU/FPGA），不依赖专有编程语言；同时Sentieon软件针对几乎所有的短读长和长读测序平台进行了优化，是FDA多次公开挑战赛的连续赢家。本次评测展现了Sentieon软件在Intel Xeon平台上的卓越性能，是基因组二级分析的最佳解
使用R语言的ggplot2包绘制子偏向性分析中的ENC-plot 到这一步有人遇到报错Error: `mapping` must be cr...
原创
2022-03-18 11:44:51
2643阅读
点赞
# 如何用R语言统计各个密码子出现次数
## 1. 流程概述
首先，我们需要将DNA序列分割成密码子，然后统计每个密码子出现的次数。最后，将结果展示为饼状图。
下面是整个流程的步骤：
| 步骤 | 操作 |
| --- | --- |
| 1 | 导入DNA序列数据 |
| 2 | 将DNA序列转换成密码子 |
| 3 | 统计每个密码子出现的次数 |
| 4 | 绘制饼状图展示结果 |
原创
2024-06-24 03:31:56
149阅读
文章目录名称形状密码子-氨基酸对应表简明中文英文和简称突变类型生物化学课程笔记特殊氨基酸的性质缬氨酸和甲硫氨酸染色体 - RNA - 蛋白质 名称Phenylalanine,Leucine,Isoleucine,Methionine,Valine,Serine,Proline,Threonine,Alanine,Tyrosine,Histidine,Glutamine,Asparagine,Ly
需求 给定cds序列，统计不同的子出现的频率。首先需要将fasta序列以3位单位分割 找到了一个办法https://www.jb51.net...
原创
2022-03-18 11:11:55
496阅读
# 使用BioPython提取基因的起始密码子上下游300bp序列
## 引言
在生物信息学中，我们常常需要提取特定的基因序列。特别是对起始密码子的上下游序列提取，能够帮助我们更好地理解基因表达的调控。这篇文章将引导您使用BioPython库来提取基因的起始密码子（AUG）上下游300个碱基对（bp）序列。
## 流程概述
下面是提取序列的主要步骤：
| 步骤 | 描述 |
|------|
研究密码子偏向性的论文通常都会分析RSCU值，论文中通常会用堆积柱形图来展示RSCU的值，之前在论文里也看到过下面这幅图的形式展示RSCU分析的...
原创
2022-03-09 11:49:40
1283阅读
题目要求:有一个DNA序列，用字符串S表示（仅包含’A’、’C’、’G’、’T’四种字符， 长度<100000）。现有N个待检测的基因片段（序号分别是1，2…N），用字符 串Ti（i=1，2…,N）表示（仅包含’A’、’C’、’G '、’T’四种字符，长度<1000）。 请分别检测DNA序列S中是否存在这些基因片段，并按下面输出说明格式依次输出检测结果。输入说明：第一行是DNA序列S。
转载
2023-11-01 17:55:00
119阅读
论文 Evolutionary origins of the SARS-CoV-2 sarbecovirus lineage responsib...
原创
2022-03-18 09:47:20
103阅读
题目要求:有一个DNA序列，用字符串S表示（仅包含’A’、’C’、’G’、’T’四种字符， 长度<100000）。现有N个待检测的基因片段（序号分别是1，2…N），用字符 串Ti（i=1，2…,N）表示（仅包含’A’、’C’、’G '、’T’四种字符，长度<1000）。 请分别检测DNA序列S中是否存在这些基因片段，并按下面输出说明格式依次输出检测结果。输入说明：第一行是DNA序列S。
转载
2023-11-01 17:55:01
115阅读
Python 字典字典是另一种可变容器模型，且可存储任意类型对象。 字典的每个键值(key=>value)对用冒号(:)分割，每个对之间用逗号(,)分割，整个字典包括在花括号({})中 ,格式如下所示：d = {key1 : value1, key2 : value2 }**注意：**键必须是唯一的，但值则不必。 值可以取任何数据类型，但键必须是不可变的，如字符串，数字或元组。一个简单的字典
