DMU在windows下安装测试–外篇1
1. 下载地址
64为电脑安装DMUv6-R5-2-EM64T.msi, 32为电脑安装DMUv6-R5-2.msi
2. 安装DMU
3. 测试DMU是否安装成功
3.1 保存测试数据
#dir.create("d:/ddmu-test")
setwd("d:/ddmu-test/")
library(devtools)
install_github("dengfei2013/learnasreml")
library(learnasreml)
data("animalmodel.dat")
data("animalmodel.ped")
dat = animalmodel.dat
ped = animalmodel.ped
dmuped = ped
dmuped$Birth = 2018
library(data.table)
# write.table(dat,"animal-model.txt",row.names = F,col.names = F)
fwrite(dat,"animal-model.txt",sep = " ",col.names = F)
fwrite(dmuped,"animal-ped.txt",sep = " ",col.names = F)3.2 查看数据
3.3 将下面内容保存为:Uni_animal.DIR
$COMMENT Estimate variance components for BWT Model y: BWT fixed: BYEAR + SEX random: ANIMAL $ANALYSE 1 1 0 0 $DATA ASCII (4,2,0) d:/dmu-test/animal-model.txt $VARIABLE ANIMAL MOTHER BYEAR SEX BWT TARSUS $MODEL 1 0 1 0 3 3 4 1 1 0 0 $VAR_STR 1 PED 2 ASCII d:/dmu-test/animal-ped.txt $PRIOR 1 1 1 0.3 2 1 1 0.7
注意, 先建立txt, 然后将其重命名为:Uni_animal.DIR, 这里DIR是后缀, 而不是默认的txt
3.4 找到DMU的安装路径, copy文件
我的默认的安装路径如下:C:\Program Files (x86)\QGG-AU\DMUv6\R5.2-EM64T\bin
将这些文件copy到你的数据文件夹下.
数据文件夹里面的内容有:
3.5 打开cmd
- 进入D盘
- 进入文件夹:ddmu-test
- 查看当前文件内容
3.6 执行命令
run_dmuai.bat Uni_animal
3.7 查看结果
4. 最简单的方法: 全套资料下载
- 公众号回复:DMU下载数据, 里面有示例数据, 有bat文件, 还有DMU64位安装包
- 安装DMU, 默认路径即可
- 打开cmd, 进入数据文件
- 运行
run_dmuai.bat Uni_animal即可成功
资料浏览:
- 数据:
- cookbook
5. 千里之行, 始于足下
能够运行DMU的示例文件, 只是第一步, 随后你可以看看示例数据是什么结构, 怎么调整自己的数据, 怎么调整DIR文件, 加油, 祝你好运.
