InnoDB索引实现
InnoDB也使用 B+Tree作为索引结构，但具体实现方式却与 MyISAM截然不同。
InnoDB的主索引：
MyISAM索引文件和数据文件是分离的，索引文件仅保存数据记录的地址。而在InnooDB中，数据本身就是按 B+Tree 组织的一个索引结构，这颗树的叶节点 data域保存了完整的数据记录。这个索引的 key就是数据表的主键，因此 InnoDB表数据文件本身就是主键索引。
（图InnoDB主索引）是InnoDB主索引（同时也是数据文件）示意图，可以看到叶节点包含了完整的记录。这种索引叫做聚集索引。因为 InnoDB的数据文件本身要按主键聚集，所以 InnoDB要求表必须有主键（MyISAM可以没有），如果没有显示指定，则 MySQL系统会自动选择一个可以作为唯一标识数据记录的列作为主键，如果不存在这种列，则MySQL会自动为 InnoDB表生成一个隐含字段作为主键，这个字段长度为 6 个字节，类型为长整型。
InnoDB的辅助索引
InnoDB的索引所有辅助索引都是 引用主键作为 data域。例如
InnoDB表是基于聚簇索引建立的。因此 InnoDB的索引能提供一种非常快速的主键查找性能。不过，它的辅助索引（Secondary Index，也就是非主键索引）也会包含主键列，所以，如果主键定义的比较大，则其他索引将很大。如果想在 表上定义很多索引，则争取尽量把主键定义的小一些。InnoDB不会压缩索引。
文字符的 ASCII码作为比较准则。聚集索引这种实现方式使得按主键的搜索十分高效，但是辅助索引需要检索两遍索引：首先检索辅助索引获得主键，然后用主键找到主索引中检索获得记录。
不同存储引擎的实现方式对于正确使用和优化索引都很有帮助。
a. 为什么不建议使用过长字段作为主键，一位内所有辅助索引都引用主键，过长的索引会令辅助索引变得过大。
b. 用非单调的字段作为主键在 InnoDB中不是个好主意，因为 InnoDB数据本身是一个 B+Tree，非单调的主键会造成在插入新记录的数据为了维持 B+Tree的特性而频繁的分裂调整。
聚簇索引和非聚簇索引的区别
聚簇索引的叶子节点存放的是主键值和数据行，支持覆盖索引，二级索引的叶子节点存放的是主键值和指向数据行的指针。
由于叶子节点（数据页）只能按照一颗 B+树排序，故一张表只能有一个聚簇索引。辅助索引的存在不影响聚簇索引中的数据组织，所以一张表可以有多个辅助索引。
MyISAM索引实现
MySAM索引文件和数据是分离的，索引文件仅保存数据记录的地址
主键索引：
MyISAM引擎使用 B+Tree作为索引结构，叶节点的 data域存放的是数据记录的地址。下图为 MyISAM主键索引的原理图：
辅助索引：
在MyISAM中，主索引和辅助索引（Secondary key）在 结构上没有任何区别，只是主索引要求 key 是 唯一的，而辅助索引的 key可以重复。
因此，MyISAM中索引检索的算法为首先按照 B+Tree搜索算法搜索索引，如果指定的 key存在，则取出其 data域的值，然后以data域的值作为地址，读取相对应数据记录。
MyISAM的索引方式也叫做 “非聚集” 的，之所以这么称呼是为了与 InnoDB的聚集索引区分。
MyISAM使用的是非聚集索引，非聚集索引的两棵 B+树看上去没什么不通，节点的结构完全一致只是存储的内容不同而已，主键索引 B+树的节点存储了主键，辅助键索引 B+ 树存储了辅助键。表数据在独立的地方，这两颗 B+树的叶子节点都使用一个地址只想真正的表数据，对于 表数据来说，这两个键没有任何区别。由于索引树是独立的，通过辅助索引无需访问主键的索引树。
InnoDB和MyISAM的区别：
MyISAM只有非聚簇索引，其叶子节点就是真实数据。
InnoDB有聚簇索引和非聚簇索引，聚簇索引叶子节点为数据，非聚簇索引叶子节点为聚簇索引，所以非聚簇索引要进行二次查询，要比MyISAM要慢。
MyISAM不支持事务、行锁、外键
InnoDB支持事务、行锁、外键
