1.问题描述

最近使用spark sql执行etl时候出现了,最终结果大小只有几百k,但是小文件一个分区有上千的情况。

危害:

hdfs有最大文件数限制
浪费磁盘资源(可能存在空文件);
hive中进行统计,计算的时候,会产生很多个map,影响计算的速度。

2.解决方法

方法一:通过spark的coalesce()方法和repartition()方法

val rdd2 = rdd1.coalesce(8, true) (true表示是否shuffle)
 val rdd3 = rdd1.repartition(8)

说明:

coalesce:coalesce()方法的作用是返回指定一个新的指定分区的Rdd,
如果是生成一个窄依赖的结果,那么可以不发生shuffle,
分区的数量发生激烈的变化,计算节点不足,不设置true可能会出错。

repartition:coalesce()方法shuffle为true的情况。

但是由于使用的是同事直接写好的模块,改新增函数相对比较麻烦,所以作为后手。

方法二:降低spark并行度,即调节spark.sql.shuffle.partitions

比如之前设置的为100,按理说应该生成的文件数为100;
但是由于业务比较特殊,采用的大量的union all,且union all在spark中属于窄依赖,
不会进行shuffle,所以导致最终会生成(union all数量+1)*100的文件数。
如有10个union all,会生成1100个小文件。
这样导致降低并行度为10之后,执行时长大大增加,且文件数依旧有110个,效果有,但是不理想。

方法三:新增一个并行度=1任务,专门合并小文件。

先将原来的任务数据写到一个临时分区(如tmp);
再起一个并行度为1的任务,类似:

insert overwrite 目标表 select * from 临时分区

但是结果小文件数还是没有减少,略感疑惑;
经过多次测后发现原因:‘select * from 临时分区’ 这个任务在spark中属于窄依赖;
并且spark DAG中分为宽依赖和窄依赖,只有宽依赖会进行shuffle;
故并行度shuffle,spark.sql.shuffle.partitions=1也就没有起到作用;

由于数据量本身不是特别大,所以直接采用了group by(在spark中属于宽依赖)的方式,类似:

insert overwrite 目标表 select * from 临时分区 group by *

先运行原任务,写到tmp分区,‘dfs -count’查看文件数,1100个,运行加上group by的临时任务(spark.sql.shuffle.partitions=1),查看结果目录,文件数=1,成功。
最后又加了个删除tmp分区的任务。

2.结论

方便的话,可以采用coalesce()方法和repartition()方法

如果任务逻辑简单,数据量少,可以直接降低并行度

任务逻辑复杂,数据量很大,原任务大并行度计算写到临时分区,再加两个任务:
一个用来将临时分区的文件用小并行度(加宽依赖)合并成少量文件到实际分区;
另一个删除临时分区;

hive任务减少小文件相对比较简单,可以直接设置参数,如:

Map-only的任务结束时合并小文件:
sethive.merge.mapfiles = true

在Map-Reduce的任务结束时合并小文件:
sethive.merge.mapredfiles= true

当输出文件的平均大小小于1GB时,启动一个独立的map-reduce任务进行文件merge:
sethive.merge.smallfiles.avgsize=1024000000
 

3.案例

背景:

flink任务会产生很多小文件,影响namenode性能,需要合并小文件

核心思想:

1.读取hive数据转为DataFrame

2.DataFrame使用coalesce(1)合并为一个文件

3.创建视图,overwrite插入

代码:

/**
 * 控制输出文件的个数DataFrame输出结果保存为文件时,可以控制输出文件的的个数,从而减少小文件的个数
 * DataFrame.coalesce(1).write.format("parquet").mode(SaveMode.Overwrite).partitionBy("分区条件列名").save("路径")
 * @param spark
 * @param startdate
 * @param enddate
 */
class MergeOds(spark: SparkSession, startdate: LocalDate, enddate: LocalDate) extends Serializable  {

  var dateLocalDate: LocalDate = null
  if (startdate != null)
    dateLocalDate = startdate
  else
    dateLocalDate = LocalDate.now().minusDays(1) //默认统计昨日
  val dateString = dateLocalDate.format(DateTimeFormatter.ISO_LOCAL_DATE)

  var enddateLocalDate: LocalDate = null
  if (enddate != null)
    enddateLocalDate = enddate
  else
    enddateLocalDate = LocalDate.now().minusDays(1) //默认统计昨日
  val enddateString = enddateLocalDate.format(DateTimeFormatter.ISO_LOCAL_DATE)

  val db = "ods"
  val table = "ods_shop_original_front_point"

  spark.sql(s"msck repair table $db.$table")
  spark.sql(
   s"""
      |select * from $db.$table
      |where pdate >= '$dateString'
      |and pdate <= '$enddateString'
      |""".stripMargin).coalesce(1).createTempView(table)
  spark.sql(
   s"""
      |insert overwrite table $db.$table partition(pdate)
      |select * from $table
      |""".stripMargin)

}