java调用R语言脚本 r.java作用

　　rJava是一个R语言和Java语言的通信接口，通过底层JNI实现调用，允许在R中直接调用Java的对象和方法。
　　rJava还提供了Java调用R的功能，是通过JRI(Java/R Interface)实现的。JRI现在已经被嵌入到rJava的包中，我们也可以单独试用这个功能。现在rJava包，已经成为很多基于Java开发R包的基础功能组件。
　　正式由于rJava是底层接口，并使用JNI作为接口调用，所以效率非常高。在JRI的方案中，JVM直接通过内存直接加载RVM，调用过程性能几乎无损耗，因此是非常高效连接通道，是R和Java通信的首选开发包。
　　软件环境：win7 64位 + R3.2.3(32位) + Jdk1.6(32位) +Eclipse4.4
　　1.安装rJava　
　　方法一：点击R工具栏上的【程序包】—》“设定CRAN数据源”—》China(Beijing 4) —》确定；点击【程序包】—》安装程序包—》选择 rJava —>OK
　　方法二：直接在R的命令行窗口，输入以下命令：

install.packages("rJava")
library(rJava)

　　2.配置环境变量　　
　　右击“我的电脑”—》属性 —》高级系统设置 —》环境变量 —》系统环境变量: JAVA_HOME、Classpath、Path。
　　对于32位的jdk + 32位的R，请使用:

Path = G:\Program Files\R\R-3.2.3\bin\i386;%JAVA_HOME%\bin;%JAVA_HOME%\jre\bin;
JAVA_HOME = G:\Program Files (x86)\Java\jdk1.6.0_45;
ClassPath = .;%JAVA_HOME%\lib\dt.jar;%JAVA_HOME%\lib\tools.jar;G:\Program Files\R\R-3.2.3\library\rJava\jri;

　　对于64位的jdk+64位的R，请使用：　　

PATH = G:\Program Files\R\R-3.2.3\bin\x64;%JAVA_HOME%\bin;%JAVA_HOME%\jre\bin;
JAVA_HOME =  G:\Program Files\Java\jdk1.6.0_45;
CLASSPATH = .;%JAVA_HOME%\lib\dt.jar;%JAVA_HOME%\lib\tools.jar;G:\Program Files\R\R-3.2.3\library\rJava\jri;

　　3.在Eclipse中，编写Java通过JRI调用R的程序
　　右击Eclipse的Package Explorer空白区，创建Java Projects，命名为：Rchart2，创建一个package：com.call，一个class文件：FirstRjava.java，一个Folder: Lib

图(1) Rchart2的Java工程目录图

　　//FirstRjava.java　　

package com.call;

import org.rosuda.JRI.Rengine;

public class FirstRjava {

    public static void main(String[] args) {
        FirstRjava demo = new FirstRjava();
        demo.callRJava();
    }

    public void callRJava(){
        //启动R引擎
        Rengine re = new Rengine(new String[]{"--vanilla"},false,null);
        if (!re.waitForR()) {
            System.out.println("Cannot load R");
            return;         
        }

        //打印变量
        String version = re.eval（"R.version.string").asString();
        System.out.println(version);

        //生成10个随机数,保存至arr[]数组里，并输出
        double[] arr = re.eval（"rnorm(10)").asDoubleArray();
        for(double a:arr){
            System.out.println(a+",");
        }

        //关闭R引擎
        re.end();       

    }

}

　　4. 加载JRI.jar和配置VM参数
　　4.1 在R中安装完rJava后，会在: X: ~R\R-x.x.x\bin\library\rJava\jri发现JRI.jar包，对于本例，目录为：G:\Program Files\R\R-3.2.3\library\rJava\jri，将JRI.jar放到Rchar2/Lib里；右击Rchar2 —》Build Path —》Add External Archives —》选择JRI.jar —>OK
　　4.2 配置工程Rchar2/FirstRjava的VM参数
　　首先运行一下FirstRjava，将.java文件编译成.class文件，然后，右击FirstRjava—》Run as —》Run Configurations —》在Arguments界面，填写VM arguments:　　

-Djava.library.path="G:\Program Files\R\R-3.2.3\library\rJava\jri\i386"

图(2) 在32的Eclipse上，配置32位的jri其vm参数

　　如果是64位的R，只需要将路径的末尾字段: \i386 改成 \x64，即配置如下：　　

-Djava.library.path="G:\Program Files\R\R-3.2.3\library\rJava\jri\x64"

　　效果如下：

图(3) 用Java通过JRI，调用R

　　5.将该工程打包成一个Runable jar
　　右击Rchart2 —>Export —> Runable JAR file —> Next —> 选择FirstRjava -Rcahrt2 ,路径: G:\Workspaces\ExportJar(按Browse按钮，自己设置)，命名为: FirstRjava.jar，如图(4)、图(5)、图(6)所示：

图(4) 右击工程Rchart2–》Export

图(5) 点击Runable JAR file

图(6) 选择要导出的工程.jar名称和地址，这里设置为FirstRjava.jar，地址：G:\Workspaces\ExportJar

　　6. 点击桌面左下角的【开始】—》cmd —>进入到.jar包所在的目录: G:\Workspaces\ExportJar，输入命令：　　　　

java -Djava.library.path="G:\Program Files\R\R-3.2.3\library\rJava\jri\i386" -jar FirstRjava.jar

　　如图(7)所示：

图(7) 在Dos黑框框里，执行.jar的效果

　　R和Java可以相互调用，R通过rJava调用Java，Java通过JRI调用R。
　　Java通过JRI调用R的工程代码：

参考文献：http://blog.fens.me/r-rjava-java/